| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 2,040,296 | (G)10→9 | coding (148/1017 nt) | PA14_RS09495 → | glycosyltransferase family 4 protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 2,040,287 | 0 | G | . | 97.3% | 1731.2 / 34.8 | 373 | coding (139/1017 nt) | PA14_RS09495 | glycosyltransferase family 4 protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/3); new base . (161/201); total (168/205) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 411 total aligned reads displayed.
CATCAACAATAATGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTGGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATA > NC_008463/2040138‑2040434 | tCAACAATAATGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTgggg < 2:2465647/151‑1 (MQ=255) caaTAATGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTgggggggg > 2:4071821/1‑151 (MQ=255) caaTAATGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTgggggggg < 2:7497025/151‑1 (MQ=255) aataatGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGTACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTggggggggg > 2:4628809/1‑151 (MQ=255) ataatGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTgggggggggt < 1:646181/151‑2 (MQ=255) ataatGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTgggggggggt < 1:194476/151‑2 (MQ=255) ataatGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTACTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTgggggggggt < 2:9763507/151‑2 (MQ=255) taatGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTgggggggggtg > 1:4901011/1‑149 (MQ=255) atGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTgggggggggtggc > 1:1481671/1‑147 (MQ=255) atGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTgggggggggtggc > 1:1404336/1‑147 (MQ=255) cgAACTCCGGGTTTTGGCGTCCCGGACTTATGGGCCTTGCTTGCGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCATGGGCGCGTAGCTTGATGGACGGTCCCAATGCCCGTAGCTCTCCCTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCt < 2:8829796/150‑1 (MQ=255) aaCTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTAt > 1:3647959/1‑151 (MQ=255) aCTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCGTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATc < 2:6900701/151‑1 (MQ=255) cTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCg < 1:894997/151‑1 (MQ=255) ttCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATCCGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCACTGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGt < 2:7309862/151‑1 (MQ=255) ttCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGt > 2:5790876/1‑151 (MQ=255) tCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGtt < 1:6528497/151‑1 (MQ=255) ttttGGCGTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAg < 1:1234967/151‑1 (MQ=255) tGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGttt > 1:4952616/1‑151 (MQ=255) gCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTcc > 1:6893365/1‑151 (MQ=255) tCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTAc > 2:6375662/1‑151 (MQ=255) tCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTAc < 2:587579/151‑1 (MQ=255) ccGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGAAACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACGCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTg < 2:3209971/151‑1 (MQ=255) gTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGt < 2:5355031/151‑1 (MQ=255) tAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGtt < 1:9208364/151‑1 (MQ=255) aGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGttt < 2:5163025/151‑1 (MQ=255) ttATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGAGACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTg < 2:546176/151‑1 (MQ=255) aTGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCt > 1:6973161/1‑151 (MQ=255) aTGGGGCTTTCTTTAGTCTGGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCt < 2:6218338/151‑1 (MQ=255) aTGGGGCTTTATTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGAGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACAACCCG‑GTGGGGGGGGTGGCGATCGTTATGAGTTTCCTACAGGTGTTGCt > 2:597923/1‑151 (MQ=255) ggCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGAtt > 2:1808770/1‑151 (MQ=255) ggCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGAtt < 2:8769730/151‑1 (MQ=255) ctttctttAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCt > 2:3849279/1‑151 (MQ=255) ttctttAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTgg < 1:9920267/151‑1 (MQ=255) ttctttAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTgg > 1:10575820/1‑151 (MQ=255) ttctttAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTgg < 2:2084534/151‑1 (MQ=255) tctttAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTATCTTGATGTACGTTCCCAATTCCCGGTGCTCTAACTCGGTACCTACACCCC‑TTGGGGGGGGGTGGCTTTCGTTTTGAGTTTCCTACTGGTTTGGATGATTCTggc < 2:3683458/151‑1 (MQ=255) ctttAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTCCTGGTTTTGCTGATTCTggcg > 2:8121911/1‑151 (MQ=255) tttAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGGTAGGAGTTTCCTAGTGGTTTTGCTGTTTCTggcgg > 2:285409/1‑151 (MQ=255) ttAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTACCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTggcggc > 2:9256711/1‑151 (MQ=255) tCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCtt < 2:7994128/151‑1 (MQ=255) cTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTg > 2:4390281/1‑151 (MQ=255) cTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTg > 1:7409359/1‑151 (MQ=255) ttGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑‑GGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGt < 1:7206901/151‑1 (MQ=255) gACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTc > 1:8815181/1‑151 (MQ=255) aCCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCa < 1:10109679/151‑1 (MQ=255) aCCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCa > 1:9330978/1‑151 (MQ=255) ggAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGt < 2:26405/151‑1 (MQ=255) ggTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCTTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTCGCACTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAg < 1:543242/151‑1 (MQ=255) gTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGc > 1:5842920/1‑151 (MQ=255) cTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCGATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCTAGTGAGCTg > 2:3381463/1‑151 (MQ=255) cGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGa < 1:9111000/151‑1 (MQ=255) cGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGa < 2:2168934/151‑1 (MQ=255) gTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGAc > 1:6793741/1‑151 (MQ=255) tCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACt > 1:2900664/1‑151 (MQ=255) cTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTgg > 2:4849966/1‑151 (MQ=255) tttGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTggg > 1:3928332/1‑151 (MQ=255) ttGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGc < 1:3313164/151‑1 (MQ=255) ttGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCACACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGc < 2:2229193/151‑1 (MQ=255) ttGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAAGGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGc < 2:9693093/151‑1 (MQ=255) tGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTAGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCg < 2:9467391/151‑1 (MQ=255) gcgTAGCTTGATGGACGGTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGCTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGc < 2:5547019/151‑1 (MQ=255) cgTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCt < 1:1662880/151‑1 (MQ=255) gTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTa > 2:10665779/1‑151 (MQ=255) gTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTa > 1:10066088/1‑151 (MQ=255) tAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAg < 1:4679615/151‑1 (MQ=255) gCTTTATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGt < 2:10401084/151‑1 (MQ=255) cTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAATTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTg > 2:832838/1‑151 (MQ=255) cTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTg > 1:7863018/1‑151 (MQ=255) ggACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑‑GGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTAt > 1:8328697/1‑151 (MQ=255) aCGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTAtt < 1:2187081/151‑1 (MQ=255) cccAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCAt > 1:5343297/1‑151 (MQ=255) ccAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCAtt < 2:10312727/151‑1 (MQ=255) ccAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCAtt < 2:1928214/151‑1 (MQ=255) aTGCCCGTAGCTCTCCCACGGTTCCCACACCCCGTGGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGc < 2:8737283/151‑1 (MQ=255) aTGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCg < 2:1176291/151‑1 (MQ=255) tGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCgg > 1:5643437/1‑151 (MQ=255) tGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGGTATGAGTTTCCGACTGGTTTTGCTGATTCGGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCgg > 2:10467377/1‑151 (MQ=255) cccGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGtt > 2:8635903/1‑151 (MQ=255) ccGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTc < 2:10550656/151‑1 (MQ=255) ccGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTAAACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTc > 2:14834/1‑151 (MQ=255) gTATCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTATGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCtt < 2:9363477/151‑1 (MQ=255) gTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTGGGGGGGGGG‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCGGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGGGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCtt > 1:2544093/1‑151 (MQ=255) gTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCtt < 2:8453285/151‑1 (MQ=255) gTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTAGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCtt < 1:10364469/151‑1 (MQ=255) tctcACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCAATCGTTATGAGTTTCCTACTGGATTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGGTCTTGGCtt > 2:1319507/1‑151 (MQ=255) cACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCt > 1:5059291/1‑151 (MQ=255) cACTCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACAGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATAAGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCt > 2:7092552/1‑151 (MQ=255) tCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGa < 1:2246492/151‑1 (MQ=255) tCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGa < 1:7757054/151‑1 (MQ=255) tCGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGACAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGa > 2:3603311/1‑151 (MQ=255) cGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGAc < 2:10072159/151‑1 (MQ=255) cGGTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGAc < 1:8573563/151‑1 (MQ=255) gTACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGa < 1:6294592/151‑1 (MQ=255) tACCTACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGAt > 1:10708244/1‑151 (MQ=255) tACCTACACCCCG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGGTCTGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGAt > 1:2657832/1‑151 (MQ=255) tACACCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATg > 1:4347889/1‑151 (MQ=255) acacCCCGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATgg < 1:8014731/151‑1 (MQ=255) ccccGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCa > 2:7649717/1‑151 (MQ=255) ccccGT‑GGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCa > 1:10197242/1‑151 (MQ=255) | CATCAACAATAATGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGTGGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATA > NC_008463/2040138‑2040434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |