New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_008463 | = 3441406 | 400 (0.810) | 12 (0.030) | 11/270 | 33.0 | 3.0% | coding (1196/1431 nt) | hbcR | sigma‑54‑dependent transcriptional regulator HbcR |
? | NC_008463 | 3442019 = | 413 (0.930) | coding (102/1392 nt) | PA14_RS15680 | GntP family permease | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CCTCGACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_008463/3441242‑3441406 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccctcggcgcCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCCGCTC > NC_008463/3442019‑3442168 CCTCGACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCACTGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCC > 1:8539078/1‑151 CCTCGACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCC > 2:1133814/1‑151 CCTCGACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCC < 2:8823851/151‑1 CCTCGACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCC < 2:7902412/151‑1 CCTCGACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCC > 1:8539097/1‑151 CCTCGACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCC < 1:8482332/151‑1 CCTCGACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCC > 1:1518364/1‑151 CGACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCC < 1:32593/151‑1 CGACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGGTGCTGGACGCCGCC > 2:1496406/1‑151 GACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCG > 1:8399904/1‑151 GACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCG > 2:10351360/1‑151 GACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCG > 2:4027934/1‑151 GACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCG > 1:7069690/1‑151 ACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGC < 2:3307/151‑1 ACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGC > 2:385875/1‑151 ACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGC > 2:670222/1‑151 ACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGC > 2:6041926/1‑151 CAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCC > 1:6603444/1‑151 AGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCC > 1:9581137/1‑151 GCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCCCTGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCa > 2:3178856/1‑150 GCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCT < 1:1324400/151‑1 GCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCT < 1:10436482/151‑1 GCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCT < 1:1314426/151‑1 GCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCT < 1:10436250/151‑1 CCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTC < 2:2533513/151‑1 CCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTC < 2:5268484/151‑1 CCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTC < 2:4383687/151‑1 CCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTC < 2:2778761/151‑1 CCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTAGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCTAAATGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTC < 2:2533404/151‑1 CTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCG < 2:4082762/151‑1 CTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCG > 2:7873438/1‑151 TCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGG > 2:1017814/1‑151 TCGACAACGGCCGTCTCAACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCTCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTTGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACAGTTGCTGGACGACGCCGCCCTCtg > 2:1017342/1‑149 GACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCG > 1:248571/1‑151 GACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCG > 1:888657/1‑151 GACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCG > 1:788127/1‑151 GACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCG > 1:788117/1‑151 GACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCG > 2:5928172/1‑151 GACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCAAGCCTGGCCGGGCAATTTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCG > 2:3887948/1‑151 ACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGC < 1:8032522/151‑1 ACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGC > 2:3727986/1‑151 ACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGC > 2:704476/1‑151 CCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGCCGTCCTCCTCACCGATCCCAGCGCGGACGAGCAGACAATCACCGCGGTGTTCAGGGA > 1:10705210/1‑151 ACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGGCGCGCCGACATTCACCGGGGTGTTCAGGGAGAAGATGGTCTGAGTAATCAAG > 2:7810147/1‑151 ACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGCCGACCTGCTCACCCATCCCCGCGCGGTCGCGCCGACCTTCCCCGCGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCTGTATCATCTAG > 2:7810044/1‑151 TGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGCCG > 1:12004/1‑72 TGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGCCG < 2:12004/72‑1 GCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGCCGTCCTG < 1:2080641/76‑1 CGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGAT > 2:4300833/1‑79 CGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGAT < 1:4300833/79‑1 CTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCAC > 1:10392553/1‑65 CTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCAC < 2:10392553/65‑1 GACGCCGCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGC < 2:1673819/151‑1 CGCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGTAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCC > 1:4190033/1‑151 GCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATTGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCG < 2:4257374/151‑1 GCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCG > 2:1236280/1‑151 GCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCG > 1:4827390/1‑151 GCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCG > 2:2589328/1‑151 GCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCG > 2:2589196/1‑151 GCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCG > 1:9609839/1‑151 GCCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCG < 1:10250123/151‑1 CCGCTCTCGGAGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCTCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATAAAGCTCTACTTCCCGTTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGG < 2:4657038/151‑1 CCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGTGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGG < 2:4657162/151‑1 CCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCAACAAGCACTACTACCAGGTTTTCCTGCTAGGCGCGGTGTTCGGCAAGCAGATCGAGCTGGCCGG > 2:1449091/1‑151 CCGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCAAGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCAACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGG > 1:4230986/1‑151 CGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGCCCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGC < 1:29805/151‑1 CGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGC < 2:6480317/151‑1 CGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGC < 1:3891451/151‑1 CGCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGC < 1:5411035/151‑1 GCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCT < 1:8962790/151‑1 GCCCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGGTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCT > 2:5618706/1‑151 CCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCCAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTC > 2:5699462/1‑151 CCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCACGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTC > 2:3169473/1‑151 CCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTC > 1:7683424/1‑151 CCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTC > 2:5699471/1‑151 CCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTC > 1:7112417/1‑151 CCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTC < 1:3443715/151‑1 CCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTC > 1:9510712/1‑151 CCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTC > 2:1852282/1‑151 CCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCGTGGCGCGGTGTGCGGCACGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTC > 2:3808454/1‑151 CCTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTCTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTC > 1:2247212/1‑151 CTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCT < 1:1278302/151‑1 CTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCT < 2:6364078/151‑1 CTCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCT < 1:7292892/151‑1 TCGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTC > 2:4322157/1‑151 TCGGCGCCGTCCAGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTC > 1:4089233/1‑151 CGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGCGCTGGCCGGCTTCTCC < 2:3486104/151‑1 CGGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCC < 1:8579986/151‑1 GGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCC > 1:2477139/1‑151 GGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCC > 1:2479647/1‑151 GGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCC < 2:7541524/151‑1 GGCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACGTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCC < 2:1264613/151‑1 GCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCCG < 1:3319614/151‑1 GCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCCG < 2:8344796/151‑1 GCGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCCG > 2:10157714/1‑151 CGCCGTCCTGCTCCCCGACCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTACACCGGGGTGTGCATGGAGAAGATGGTCGGGTTCAACAAGCACTCCTGCCCGGTATTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCAGGCCGGCTTCTCCCGC < 2:4299647/151‑1 CGCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACGTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCCGC < 2:4299683/151‑1 GCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCCGCT > 2:2050088/1‑151 GCCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCCGCT > 2:2050103/1‑151 CCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCCGCTC < 1:8018934/151‑1 CCTCGACAGCCTCGACCACGGCCGTCTCCACGAACTCGGCGGCGACGCCCTGGCGCTGCTCGCCCGGCATGCCTGGCCGGGCAATGTTCGCGAACTGCGCAACGTGCTGGAACGCGCGCTGCTGCTGGCCGACCAACCGTTGCTGGACGCCGCCGCCCTCGGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_008463/3441242‑3441406 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccctcggcgcCGTCCTGCTCACCGATCCCAGCGCGGTCGCGCCGACCTTCACCGGGGTGTTCATGGAGAAGATGGTCGGTTTCATCAAGCTCTACTTCCCGGTTTTCCTGCTTGGCGCGGTGTTCGGCAAGCTGATCGAGCTGGCCGGCTTCTCCCGCTC > NC_008463/3442019‑3442168 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |