Read alignment evidence... | |||||||||||
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 609 total aligned reads displayed.
ACGGACGGCCGCTGGCACGGGCCTTCCAGGTGTCGAAGGCCTTGTCGTCCAGGTTCAGCACGGCGGTGCCGTCGGCGGCCAGCCCTTCGAGTATCTCGCCCTTCGCCTCGACGATCTTCTCCGGTCCGCCGAACTCGCCGACATGGGCGGTGCCGGCATTGGTGATGATCGCCACGTGCGGGCGGGTCAGCTCGACCGTGTAGGCGATCTCGCCGATGCGCGAGGCGCCCAGTTCGATCACTGCGCTACGGTGCTGCGGCGCCAGTTGCAGCAGGGTCAGCGGTACGCCGAGGTCGTTGTT > NC_008463/5113983‑5114283 | acggacggCCGCTGGCACGGGCCTTCCAGGTGTCGAAGGCCTTGTCGTCCAGGTTCAGCACGGCGGTGCCGTCGGCGGCCAGCCCTTCGAGTATCTCGCCCTTCGCCTCGACGATCTTCTCCGGTCCGCCGAACTCGCCGACATGGGCGGt < 1:9587907/151‑1 (MQ=255) ggacggCCGCTGGCACGGGCCTTCCAGGTGTCGAAGGCCTTGTCGTCCAGGTTCAGCACGGCGGTGCCGTCGGCGGCCAGCCCTTCGAGTATCTCGCCCTTCGCCTCGACGATCTTCTCCGGTCCGCCGAACTCGCCGACATGGGCGGTGc > 1:4281890/1‑151 (MQ=255) ggacggCCGCTGGCACGGGCCTTCCAGGTGTCGAAGGCCTTGTCGTCCAGGTTCAGCACGGCGGTGCCGTCGGCGGCCAGCCCTTCGAGTATCTCGCCCTTCGCCTCGACGATCTTCTCCGGTCCGCCGAACTCGCCGACATGGGCGGTGc < 2:6489071/151‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |