| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_008463 | 3,279,247 | G→A | intergenic (‑33/+64) | PA14_RS31655 ← / ← katE | hypothetical protein/catalase HPII |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_008463 | 3,279,247 | 0 | G | A | 99.3% | 2251.5 / NA | 545 | intergenic (‑33/+64) | PA14_RS31655/katE | hypothetical protein/catalase HPII |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (274/267); minor base C (2/2); total (276/269) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 546 total aligned reads displayed.
CTGTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCGCCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACAT > NC_008463/3279099‑3279393 | gTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCt > 2:632240/1‑151 (MQ=255) aGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCttt < 1:8763393/151‑1 (MQ=255) gcgcAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTc < 1:10558308/151‑1 (MQ=255) cACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCtgtg < 1:4835875/151‑1 (MQ=255) aCCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGa > 2:8815570/1‑151 (MQ=255) aCCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGa > 1:4052671/1‑151 (MQ=255) cGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGAcc > 2:9210942/1‑151 (MQ=255) gCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACcg > 2:8108183/1‑151 (MQ=255) caggcagCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGGGACCgacgaga < 1:184365/151‑1 (MQ=255) cagCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAgacgac > 2:2577088/1‑151 (MQ=255) agCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGacgacg > 1:10042670/1‑151 (MQ=255) agCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGacgacg < 1:7065333/151‑1 (MQ=255) agCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGacgacg > 2:1017293/1‑151 (MQ=255) 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aaCGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGAt < 1:6340009/151‑1 (MQ=255) gCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCg > 1:1717245/1‑151 (MQ=255) aaGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGt < 1:5446672/151‑1 (MQ=255) aGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGtg < 1:8475512/151‑1 (MQ=255) ggTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGACGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCTGGCGGGGCTCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGtgc > 2:9476177/1‑151 (MQ=255) aTCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCa > 2:386843/1‑151 (MQ=255) aTCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCa > 1:9355020/1‑151 (MQ=255) tCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCAt > 2:5238272/1‑151 (MQ=255) ccGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATc > 2:5641566/1‑151 (MQ=255) ccGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATc < 1:6028670/151‑1 (MQ=255) gggTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCCCCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCaa < 2:7113116/151‑1 (MQ=255) ggTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAAt < 2:1567887/151‑1 (MQ=255) gTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATg < 1:2642282/151‑1 (MQ=255) cccGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTgg < 2:443481/151‑1 (MQ=255) gAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGACGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAgg > 1:5648338/1‑151 (MQ=255) gAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAgg < 1:1572101/151‑1 (MQ=255) gAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAgg > 1:8145299/1‑151 (MQ=255) gAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAgg < 1:8332835/151‑1 (MQ=255) aaTCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGc > 2:3684821/1‑151 (MQ=255) aTCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGcc < 1:7499377/151‑1 (MQ=255) cGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCgg > 1:3849475/1‑151 (MQ=255) gCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCggg > 2:6942205/1‑151 (MQ=255) gCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCggg < 1:9095386/151‑1 (MQ=255) ggCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAg > 1:587781/1‑151 (MQ=255) cAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACa > 1:6277323/1‑151 (MQ=255) cAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGGCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGACGACa > 2:10640651/1‑151 (MQ=255) aGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACAt > 2:2076428/1‑151 (MQ=255) | CTGTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCGCCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACAT > NC_008463/3279099‑3279393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |