| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_008463 | 5,905,079 | A→G | F731F (TTT→TTC) | glnE ← | bifunctional [glutamate‑‑ammonia ligase]‑adenylyl‑L‑tyrosine phosphorylase/[glutamate‑‑ammonia‑ligase] adenylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 5,905,079 | 0 | A | G | 99.8% | 1630.0 / NA | 424 | F731F (TTT→TTC) | glnE | bifunctional [glutamate‑‑ammonia ligase]‑adenylyl‑L‑tyrosine phosphorylase/[glutamate‑‑ammonia‑ligase] adenylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (229/194); minor base T (0/1); total (229/195) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 424 total aligned reads displayed.
CAGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATAAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGTTCG > NC_008463/5904932‑5905226 | aGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAaca > 1:9491542/1‑151 (MQ=255) ggCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAacac < 2:5617570/151‑1 (MQ=255) cATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAgg < 1:8073101/151‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |