| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 1,501,459 | T→G | T676P (ACC→CCC) | mutS ← | DNA mismatch repair protein MutS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 1,501,459 | 0 | T | G | 99.4% | 1820.0 / NA | 471 | T676P (ACC→CCC) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base G (226/242); total (228/243) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 476 total aligned reads displayed.
GTGGCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATCAGCGC > NC_008463/1501311‑1501606 | gtggCGAACAGGGTGCAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCACGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCCGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGgtt < 2:6561082/151‑1 (MQ=255) tggCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTc < 2:2678247/151‑1 (MQ=255) tggCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTc > 1:147242/1‑151 (MQ=255) tggCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCCGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTc < 2:9399551/151‑1 (MQ=255) gCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGc > 2:1602282/1‑151 (MQ=255) cGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCt > 2:1283718/1‑151 (MQ=255) cGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCt > 2:8125773/1‑151 (MQ=255) aaCAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCa > 1:5076551/1‑151 (MQ=255) aaCAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCa < 2:1427362/151‑1 (MQ=255) aCAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCAt > 1:7843338/1‑151 (MQ=255) aGGGTGCAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCGGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCTGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCAtct < 2:6818631/151‑1 (MQ=255) aGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCAtct < 1:461762/151‑1 (MQ=255) tGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTccac > 1:4884834/1‑151 (MQ=255) gcgcGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGa < 1:839399/151‑1 (MQ=255) cgAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAgg > 1:9808136/1‑151 (MQ=255) gAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGt > 1:6060824/1‑151 (MQ=255) gAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGt > 2:2747018/1‑151 (MQ=255) cGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGc < 1:2646815/151‑1 (MQ=255) ggCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCgg < 1:10561873/151‑1 (MQ=255) ggCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCAGGAAGGTCGAGCgg > 2:5396963/1‑151 (MQ=255) ggCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGGCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCgg > 1:3540595/1‑151 (MQ=255) cAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGgccg > 2:4848886/1‑151 (MQ=255) gTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGccgccg > 1:7994166/1‑151 (MQ=255) gTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGccgccg < 1:3653503/151‑1 (MQ=255) gTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGccgccg > 1:5141658/1‑151 (MQ=255) ccTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGc < 2:1140385/151‑1 (MQ=255) tCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCaa > 1:6260612/1‑151 (MQ=255) cGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAg < 2:10763197/151‑1 (MQ=255) cGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGGTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCCAg > 2:5607822/1‑151 (MQ=255) gCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgt > 1:8246281/1‑151 (MQ=255) gCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgt < 1:2179581/151‑1 (MQ=255) gCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgt < 2:848645/151‑1 (MQ=255) ccGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgtc > 1:10079876/1‑151 (MQ=255) ccGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgtc > 2:2365164/1‑151 (MQ=255) ccGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgtc < 1:1872948/151‑1 (MQ=255) cTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgtcgtc > 2:7049601/1‑151 (MQ=255) ccAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGAc < 2:4175265/151‑1 (MQ=255) ccAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGAc < 2:1892254/151‑1 (MQ=255) ccAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGAc < 1:3124960/151‑1 (MQ=255) aGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGGCGGACGa > 2:7774769/1‑151 (MQ=255) ccAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGcc < 2:6674980/151‑1 (MQ=255) cAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCg > 2:1013897/1‑151 (MQ=255) aGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGa < 1:4460576/151‑1 (MQ=255) aCAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCg > 1:3187665/1‑151 (MQ=255) gCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTg > 1:8519222/1‑151 (MQ=255) cGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATTAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGaa < 2:4648257/151‑1 (MQ=255) cGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGaa < 1:10013904/151‑1 (MQ=255) gTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGTCCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCCTCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAg > 2:788942/1‑151 (MQ=255) gTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAg < 2:9219983/151‑1 (MQ=255) gTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAg > 1:7799470/1‑151 (MQ=255) cGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGAt > 2:10559977/1‑151 (MQ=255) gAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATg > 2:6257792/1‑151 (MQ=255) gAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATg > 1:10212250/1‑151 (MQ=255) gAAGGTGCGGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATg > 1:4205147/1‑151 (MQ=255) aGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCg > 2:8820855/1‑151 (MQ=255) aGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCg > 1:1178441/1‑151 (MQ=255) gCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTcc > 1:3838469/1‑151 (MQ=255) tGGTGCCGCGGCCGACCTCTTCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGCGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGTGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTcctc > 1:7344781/1‑149 (MQ=255) tGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTccac < 2:719246/151‑1 (MQ=255) gTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTccacca < 2:5887501/151‑1 (MQ=255) gCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAgg < 2:5220990/151‑1 (MQ=255) cgcgGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGa < 1:10297554/151‑1 (MQ=255) cgGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACa > 1:2299543/1‑151 (MQ=255) ccGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCCTCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCt > 2:3803914/1‑151 (MQ=255) cGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTc > 1:6495/1‑151 (MQ=255) cGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTc < 2:9033974/151‑1 (MQ=255) gACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCg < 1:2957652/151‑1 (MQ=255) tCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAgc > 1:8976253/1‑151 (MQ=255) tCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAgc < 2:4041904/151‑1 (MQ=255) catcAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCa < 2:3976623/151‑1 (MQ=255) atcAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAg > 1:5731222/1‑151 (MQ=255) cAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGcc > 2:8640200/1‑151 (MQ=255) aGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCg > 2:1569298/1‑151 (MQ=255) aGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCAGGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCg > 2:3163125/1‑151 (MQ=255) aCCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGaa < 1:9611360/151‑1 (MQ=255) ccAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAAc < 2:3348704/151‑1 (MQ=255) ggCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGaa < 2:9626679/151‑1 (MQ=255) ggCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGaa < 2:4416347/151‑1 (MQ=255) ggCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGaa < 1:7635447/151‑1 (MQ=255) ctTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTg < 2:2276201/151‑1 (MQ=255) tCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGa < 2:3034440/151‑1 (MQ=255) cAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGat < 1:5506080/151‑1 (MQ=255) gCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATgcg > 2:2091464/1‑151 (MQ=255) cGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGACCGAAGCTGCCGATATgcgc > 2:1737902/1‑151 (MQ=255) gTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCa < 2:1036387/151‑1 (MQ=255) gTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCa > 1:10791360/1‑151 (MQ=255) tgtgCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAag < 1:278188/151‑1 (MQ=255) tgtgCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAag < 1:6736893/151‑1 (MQ=255) gtgCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAagc < 1:7034061/151‑1 (MQ=255) cAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAagcagc > 2:2587181/1‑151 (MQ=255) aGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAgcagca < 2:10197721/151‑1 (MQ=255) aGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAgcagca > 2:7531428/1‑151 (MQ=255) ggATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCAc < 1:686186/151‑1 (MQ=255) aTGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGa > 2:4347551/1‑151 (MQ=255) tGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGAt > 1:9386538/1‑151 (MQ=255) gTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATc < 1:6548295/151‑1 (MQ=255) ttGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATCa < 2:7373288/151‑1 (MQ=255) tGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATCAg > 2:3634882/1‑151 (MQ=255) ggCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCTGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATTTGCGCTAGCAGCTCGATCAgc > 1:8093821/1‑151 (MQ=255) ggCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATCAgc < 1:9580516/151‑1 (MQ=255) | GTGGCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATCAGCGC > NC_008463/1501311‑1501606 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |