| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_008463 | 1,598,729 | C→T | G125S (GGC→AGC) | argF ← | ornithine carbamoyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 1,598,729 | 0 | C | T | 99.2% | 1959.8 / NA | 476 | G125S (GGC→AGC) | argF | ornithine carbamoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (247/224); minor base G (4/0); total (251/225) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 476 total aligned reads displayed.
AACTTCAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCCGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTCGCGCGG > NC_008463/1598581‑1598876 | aaCTTCAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGt < 1:46325/151‑1 (MQ=255) cTTCAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTg > 1:3231250/1‑151 (MQ=255) tCAGCGCCGCGTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGAt > 1:4473361/1‑151 (MQ=255) 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ggCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCg > 2:10128707/1‑151 (MQ=255) gCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGa > 2:8031470/1‑151 (MQ=255) gAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCAACGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATc > 2:1801997/1‑151 (MQ=255) aGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCg > 2:5411048/1‑151 (MQ=255) gCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCgg > 2:6389902/1‑151 (MQ=255) gCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCgg < 2:4373844/151‑1 (MQ=255) cAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGc > 2:10196439/1‑151 (MQ=255) cAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTACGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGc > 1:2672349/1‑151 (MQ=255) aCTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTc > 1:8109368/1‑151 (MQ=255) ggCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTcgcc > 2:6532920/1‑151 (MQ=255) cAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGAGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTcgccgc < 2:7562838/151‑1 (MQ=255) tGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCgc < 1:760845/151‑2 (MQ=255) cAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGc > 2:980216/1‑151 (MQ=255) gtcgGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGgtg > 1:7752253/1‑151 (MQ=255) tcgGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGgtgt < 1:10717506/151‑1 (MQ=255) gACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTcgc < 1:3781975/151‑1 (MQ=255) aGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTcgcgcg > 2:4121212/1‑151 (MQ=255) | AACTTCAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCCGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTCGCGCGG > NC_008463/1598581‑1598876 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |