| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_008463 | = 5884344 | 539 (1.070) | 12 (0.030) | 12/272 | 33.7 | 2.1% | coding (746/1425 nt) | hldE | bifunctional D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑7‑phosphate kinase/D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose 1‑phosphate adenylyltransferase HldE |
| ? | NC_008463 | 5884597 = | 607 (1.320) | coding (493/1425 nt) | hldE | bifunctional D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑7‑phosphate kinase/D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose 1‑phosphate adenylyltransferase HldE | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGATCGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCCCGCGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_008463/5884183‑5884344‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgcgcccgcgccgCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAGT > NC_008463/5884597‑5884745 TGATCGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCC < 1:10004905/150‑1TGATCGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCC < 2:6275390/150‑1 GATCGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCATGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCG < 2:8261287/150‑1 GATCGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCG < 1:9185598/150‑1 ATCGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTCTCGCCAGCACCGGTGTCGTCGAACACTTCCCGC > 2:6310382/1‑150 ATCGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGC > 1:3882558/1‑150 ATCGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGC > 1:2974114/1‑150 ATCGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGGATCGCCAGCACCGGTGACGTCGACCACTTCCCGC < 2:8527351/150‑1 CGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGC < 2:9667263/150‑1 CGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGC > 1:7123750/1‑150 GCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCC < 1:8656716/150‑1 GCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCC < 2:2178872/150‑1 GCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCC < 1:2963708/150‑1 GCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCC < 2:7759970/150‑1 CCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCCC < 1:2123280/150‑1 CCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCCC < 2:2279947/150‑1 CGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCCCG < 2:7609203/150‑1 CGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCCCG < 1:6812677/150‑1 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1:4856335/1‑150 GCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCCCGC > 2:1404134/1‑150 GCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCCCGC > 2:1404074/1‑150 GGTACCCAGCTTGCCGACCACGCTGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCACACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCCCGCGC < 2:4489343/150‑1 GGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCCGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCCCGCGC > 1:1692401/1‑150 GGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCCCGCGC < 1:5164918/150‑1 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2:9040829/1‑150 GCCCGCGCCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACC < 2:1966087/150‑1 GCCCGCGCCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACC < 1:1132326/150‑1 CCCGCGCCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCC > 2:5304228/1‑150 CCCGCGCCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCC > 2:5626903/1‑150 CCCGCGCCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCC > 2:5633701/1‑150 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1:8837224/150‑1 GCCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGC < 2:5421937/150‑1 GCCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGC < 2:10831462/150‑1 GCCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGC < 2:4106257/150‑1 CCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCA < 1:1474658/150‑1 CCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCA > 1:5476998/1‑150 CCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCA > 1:5476684/1‑150 CCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCA < 2:3199048/150‑1 CCGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCA < 1:1474659/150‑1 CGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGACCGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAG > 2:5195429/1‑150 CGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAG > 2:5195401/1‑150 CGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAG > 2:5195022/1‑150 CGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAG < 1:361605/150‑1 CGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAG < 2:8338566/150‑1 CGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAG < 2:2440491/150‑1 CGCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAG < 2:8629131/150‑1 GCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCCGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAGT > 1:2395010/1‑150 GCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAGT > 1:2391547/1‑150 GCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAGT > 2:8340274/1‑150 GCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAGT > 1:651383/1‑150 GCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAGT > 2:5729457/1‑150 GCCTCGATCAGCACCTGGTGGTTCCGTAGCGCGCCCGTGCCGTAGACGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAGT < 2:7463617/150‑1 TGATCGCCGCGGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCGGCGGCCAGGTTGGCCAGGCCCACCGCGGACGGCAGCTCCTCGCCGGCGGCAAGCGCCGCGGCCAGGGTGGAGATGACCGTATCGCCAGCACCGGTGACGTCGAACACTTCCCGCGCCCGCGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_008463/5884183‑5884344‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgcgcccgcgccgCCTGGATCAGCACCTGGTGGTTCTGTAGCGCGCCCTTGCCGTAGTCGGACAGCACCAGCACCTTGACCTTGGCCAGCAGCGACTCGACGTCCACGGCCAGGGCCGCCGCGTCGGTGCGGAACGGTTCCTCGAAGTCGACCCGCAGCAGT > NC_008463/5884597‑5884745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |