New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_008463 | = 3304506 | 427 (0.850) | 14 (0.030) | 13/266 | 32.7 | 3.5% | coding (1023/1449 nt) | PA14_RS15105 | aldehyde dehydrogenase family protein |
? | NC_008463 | 3304825 = | 400 (0.890) | coding (704/1449 nt) | PA14_RS15105 | aldehyde dehydrogenase family protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 428 total aligned reads displayed.
GGGTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAACGCCGC > NC_008463/3304358‑3304654 | gggTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGa < 2:6482904/150‑1 (MQ=255) gTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATg > 1:808929/1‑150 (MQ=255) gTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATg > 2:6045828/1‑150 (MQ=255) gCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGTCCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCt > 2:10411393/1‑150 (MQ=255) gCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCt > 1:3364497/1‑150 (MQ=255) cGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCg < 1:6437084/150‑1 (MQ=255) cGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCg < 1:7513833/150‑1 (MQ=255) cGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCg > 1:6275428/1‑150 (MQ=255) cGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCg > 1:8968706/1‑150 (MQ=255) gTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTa > 1:4032479/1‑150 (MQ=255) tCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTAc < 2:9326134/150‑1 (MQ=255) tCCGAAGGTTTCCTGGTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTAc < 1:11034517/150‑1 (MQ=255) ccGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACg < 1:5254966/150‑1 (MQ=255) aaGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgct > 2:3384786/1‑150 (MQ=255) ggTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgctcg > 1:6557170/1‑150 (MQ=255) tttCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgctcgct < 1:2794003/150‑1 (MQ=255) ttCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgctcgctc < 2:3780301/150‑1 (MQ=255) ccTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcga < 1:10356954/150‑1 (MQ=255) 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tGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGt > 2:502576/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTg > 1:9537578/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTg > 1:7666757/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGACTGTCGTACGGCTCGCACGACGCGCTCGACGTTg > 2:5266401/1‑150 (MQ=255) gTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCtt > 2:7590386/1‑150 (MQ=255) 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atcGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAg < 2:5745903/150‑1 (MQ=255) atcGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAg > 2:8230172/1‑150 (MQ=255) atcGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAg < 1:2191303/150‑1 (MQ=255) aCCTCCAGCAGGGTCGGACGGGAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGc < 2:6322796/150‑1 (MQ=255) tCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGcccc > 1:2093010/1‑150 (MQ=255) 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tCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAgg < 2:7909400/150‑1 (MQ=255) cccTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGttt < 2:239471/150‑1 (MQ=255) cccTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGAACAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCCGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGgtt > 2:8002358/1‑150 (MQ=255) cGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCCCCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCa < 2:3590142/150‑1 (MQ=255) cGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCa < 2:8888831/150‑1 (MQ=255) gTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCCGGTTTTCCAgg > 2:3015739/1‑150 (MQ=255) gTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAgg > 2:10107113/1‑150 (MQ=255) ttACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGgc < 1:7050767/150‑1 (MQ=255) tccGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGgcgc < 2:10005664/149‑1 (MQ=255) ccGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCCGGTTTTACAGgcgcg > 1:5718775/1‑149 (MQ=255) ccGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCt < 2:10789059/150‑1 (MQ=255) ccGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCt < 1:7167676/150‑1 (MQ=255) cGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGGCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTg > 1:9802962/1‑150 (MQ=255) cgccgcGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCa < 2:1603971/150‑1 (MQ=255) ccgcGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGCCGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCCTGTCGCTGNGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAgg < 1:5874173/150‑1 (MQ=255) cgcgGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCCCGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGc > 1:542978/1‑150 (MQ=255) cgGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGt < 1:4470119/150‑1 (MQ=255) accaccaccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTcg < 1:9072911/150‑1 (MQ=255) accaccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGTCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTAGTCGATCAGCGGCCCCAGGTCGCGGCGCGGGGCCGCGGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTACAGGCGCGGCGCCGGGCGGTAGCGt > 2:2764717/1‑150 (MQ=255) accaccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGt > 2:8320999/1‑150 (MQ=255) accaccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCAGCGCCAGGCGTTcgcgg > 1:3161213/1‑149 (MQ=255) caccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCCGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAg > 2:7477178/1‑150 (MQ=255) accCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGc < 1:1001663/150‑1 (MQ=255) cggcggCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCaa < 1:7330691/150‑1 (MQ=255) cggcgATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAAcgc < 1:1362908/150‑1 (MQ=255) gcgATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAAcgccg > 2:3962336/1‑150 (MQ=255) cgATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCAGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAAcgccgc > 2:3665145/1‑150 (MQ=255) | GGGTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAACGCCGC > NC_008463/3304358‑3304654 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |