Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_008463 | 934,247 | 0 | A | G | 40.6% | 518.5 / inf | 475 | Y92C (TAC→TGC) | ampR | LysR family transcriptional regulator AmpR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (149/133); new base G (95/98); total (244/231) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.63e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 483 total aligned reads displayed.
GAGCCTCGAGGAGCGTCTCGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACATCGCCGCCGAGGGGCTCG > NC_008463/934098‑934396 | gCCTCGAGGAGCGTCTCGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTAcc < 2:4040009/150‑1 (MQ=255) tCGAGGAGCGTCTCGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCggg < 2:10578579/150‑1 (MQ=255) tCGAGGAGCGTCTCGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCggg > 1:3438217/1‑150 (MQ=255) cGAGGAGCGTCTCGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGa > 1:240754/1‑150 (MQ=255) cGAGGAGCGTCTCGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGa > 2:5234131/1‑150 (MQ=255) ggagCGTCTCGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGt < 2:10758583/150‑1 (MQ=255) gTCTCGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCa < 1:6619093/150‑1 (MQ=255) tcGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCg > 1:5956338/1‑150 (MQ=255) tcGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCg < 2:4366048/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGt < 1:2671611/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTc < 1:2221550/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTGTACAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGAGGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGgcg < 2:7746194/150‑1 (MQ=255) cTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTc > 1:8798038/1‑150 (MQ=255) tggtCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGCAGCTGACCCCCGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCAGCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCg < 2:6237347/147‑1 (MQ=255) gTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCGGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCgg < 2:3289919/150‑1 (MQ=255) ttCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGa > 1:4736263/1‑150 (MQ=255) aaGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAAcc < 2:4502256/150‑1 (MQ=255) gCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCtt > 1:8468985/1‑150 (MQ=255) gTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCa < 2:783899/150‑1 (MQ=255) tCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCAc > 2:10321447/1‑150 (MQ=255) cTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACg < 2:5538527/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACg < 1:1270263/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACg < 2:2588610/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACAACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACgg > 2:6497418/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCg > 1:3944390/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCg > 2:2818818/1‑150 (MQ=255) cgcgGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCggc < 1:4479169/150‑1 (MQ=255) ggCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCggctgg < 1:7389498/150‑1 (MQ=255) ggCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCggctgg > 1:10505611/1‑150 (MQ=255) gCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCggctggc < 2:584323/150‑1 (MQ=255) tGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGgctgc > 1:4892268/1‑150 (MQ=255) tGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGgctgc > 1:8555031/1‑150 (MQ=255) tGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGgctgc > 2:9873111/1‑150 (MQ=255) aCCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCgg > 1:8043768/1‑150 (MQ=255) aCCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCgg > 1:9975004/1‑150 (MQ=255) cccACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGc > 1:198571/1‑150 (MQ=255) ccACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCt < 1:8099998/150‑1 (MQ=255) cGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGc < 1:6078347/150‑1 (MQ=255) gAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCg > 1:526547/1‑150 (MQ=255) gggCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGa > 1:5108875/1‑150 (MQ=255) gggCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGa > 2:2219925/1‑150 (MQ=255) gagaGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTc < 1:10240366/150‑1 (MQ=255) agagCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTcc > 1:7351560/1‑150 (MQ=255) gagCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCa < 1:11017246/150‑1 (MQ=255) gagCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCa < 2:8024484/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCTACAGCATCGCCGGCCTGCTGGATCGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGTGAAGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACTGTCGGGTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAgg < 2:7523632/150‑1 (MQ=255) tgcCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCCTCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGcc < 2:485495/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATcc > 1:5452441/1‑150 (MQ=255) tGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCt > 1:6839368/1‑150 (MQ=255) gCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCtt < 2:7223394/150‑1 (MQ=255) gCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCtt < 2:1087611/150‑1 (MQ=255) gCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCtt < 2:9066190/150‑1 (MQ=255) gCTGTGTGACTCCTTCGACCGCAACGCCGGCCTGCTGGACCGCTTGGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACAGACGGCGCGGTCGGAACCTGCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTGCCAGGCGCGCCCTCCCtt > 2:659587/1‑150 (MQ=255) cTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTc < 2:9642371/150‑1 (MQ=255) cTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTc > 2:1380748/1‑150 (MQ=255) tgACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGa < 2:122384/150‑1 (MQ=255) gACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGAt < 2:9277702/150‑1 (MQ=255) cTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCt < 1:4322650/150‑1 (MQ=255) tCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTg > 2:10551915/1‑150 (MQ=255) tCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTg < 2:5112242/150‑1 (MQ=255) tCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTg < 1:10142301/150‑1 (MQ=255) ccTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTgc > 2:7429944/1‑150 (MQ=255) ccTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTgc > 1:184559/1‑150 (MQ=255) 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cGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGAc > 2:8282465/1‑150 (MQ=255) gCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACa < 1:9564453/150‑1 (MQ=255) gCTTCGAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACa < 2:610447/150‑1 (MQ=255) cTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACAt < 1:2786727/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACATc < 1:9149945/150‑1 (MQ=255) cGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCCTCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACATcgc > 2:3739066/1‑150 (MQ=255) gAGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACATcgcc > 1:10868273/1‑150 (MQ=255) aGGGCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACATcgccg > 1:7650065/1‑150 (MQ=255) aGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATACCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACATcgccg > 1:3712619/1‑150 (MQ=255) gggCGGCCACTGCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACATcgccgc < 1:9039061/150‑1 (MQ=255) 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aCTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACATCGCCGCCGAGGGGc > 1:7208978/1‑150 (MQ=255) aCCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACATCGCCGCCGAGGGGCTCg < 1:1504946/150‑1 (MQ=255) | GAGCCTCGAGGAGCGTCTCGGCGTGGCCCTGTTCAAGCGTCTGCCGCGCGGCCTGATGCTGACCCACGAGGGCGAGAGCCTGCTGCCGGTGCTGTGTGACTCCTTCGACCGCATCGCCGGCCTGCTGGAACGCTTCGAGGGCGGCCACTACCGGGACGTGCTCACCGTCGGCGCGGTCGGAACCTTCACGGTCGGCTGGCTGCTGCCGCGGCTGGCGGACTTCCAGGCGCGCCATCCCTTCATCGATCTGCGCCTGTCCACCCACAACAACCGCGTCGACATCGCCGCCGAGGGGCTCG > NC_008463/934098‑934396 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |