| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 2,910,205 | A→G | L138P (CTG→CCG) | pvdS ← | pyoverdine signaling pathway sigma factor PvdS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 2,910,205 | 0 | A | G | 99.4% | 2048.7 / NA | 529 | L138P (CTG→CCG) | pvdS | pyoverdine signaling pathway sigma factor PvdS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (210/316); minor base T (2/1); total (212/317) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 532 total aligned reads displayed.
CGACGGGCGCTGAGATGGGTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCAGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCGGCCCC > NC_008463/2910058‑2910351 | cGACGGGCGCTGAGATGGGTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCggg < 1:10277519/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGAGATGGGTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGACGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGt > 2:363616/1‑150 (MQ=255) gggCGCTGAGATGGGTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGt > 1:2714589/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGAGATGGGTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTa > 2:8284951/1‑150 (MQ=255) gcgcTGAGATGGGTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTAc < 1:3260868/150‑1 (MQ=255) gcTGAGATGGGTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACAt > 2:7039523/1‑150 (MQ=255) cTGAGATGGGTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACAtc > 1:7327342/1‑150 (MQ=255) tGAGATGGGTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGTTCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACAtct > 2:9616582/1‑150 (MQ=255) agaTGGGTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCg > 1:3810930/1‑150 (MQ=255) gggTGACGTAGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCATGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGAACATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTACTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGaatg > 2:10486064/1‑148 (MQ=255) gTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCg < 2:8760075/150‑1 (MQ=255) tGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGt < 2:8908261/150‑1 (MQ=255) gTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGAGCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCg > 2:1268829/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCgg < 1:4653454/150‑1 (MQ=255) gTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGt < 2:1434106/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCt < 2:7488447/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCtt > 2:4395603/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCtt < 2:7845596/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTg > 2:10644118/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTg > 2:7657422/1‑150 (MQ=255) ggCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTgg > 1:1587470/1‑150 (MQ=255) ggCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTgg < 2:296277/150‑1 (MQ=255) ggCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTgg < 2:5894151/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTggg > 1:2992041/1‑150 (MQ=255) cTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAg < 1:9008134/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAg > 1:8368891/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCTTGATTTTGACCAGGGTCTGCGAGACGCCAAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCTGCAAGACGTTCTGGCGGTACATCTCGAAGGAGTAGAGGGTGCGCTTGGGCAGc < 1:3665038/150‑1 (MQ=255) cggcggTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCt > 1:5666609/1‑150 (MQ=255) gTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTg < 1:482115/150‑1 (MQ=255) gTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTg > 2:4816164/1‑150 (MQ=255) aCCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAgg > 1:696462/1‑150 (MQ=255) cTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGc > 2:10787899/1‑150 (MQ=255) gCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATc < 1:7028656/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCcg > 2:2134801/1‑150 (MQ=255) gCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCcgc > 2:2228327/1‑150 (MQ=255) gCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCcgc > 1:10426002/1‑150 (MQ=255) cAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCAGGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGGGAGGGCATCcgcg > 2:4073547/1‑150 (MQ=255) aGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGa > 2:3830375/1‑150 (MQ=255) aGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGa < 1:6309385/150‑1 (MQ=255) cACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGAtgtg < 1:3797493/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTc > 2:4202989/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTc > 1:5134659/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGt < 1:10646136/150‑1 (MQ=255) tCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTc > 1:4414062/1‑150 (MQ=255) tCGCGGATCATCAATTTGAACATGGTCGGCGAGACGACCAGATCCTAGGCGATTGACTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGAGCTAGGGCAGCTCGGTGAGGTCATCCGCGATATGTTCGAGGGTc > 2:549938/1‑150 (MQ=255) cgcgGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTcg > 1:984695/1‑150 (MQ=255) gcgGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTcgc > 1:9576632/1‑150 (MQ=255) ggATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGt < 2:2380353/150‑1 (MQ=255) ggATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGt > 1:2391364/1‑150 (MQ=255) gATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTa > 2:5046902/1‑150 (MQ=255) cATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGtt < 2:11121250/150‑1 (MQ=255) cATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGtt < 1:431527/150‑1 (MQ=255) gtaGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCCGGTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGGACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCCTCCGCGAGGTGTTCGAGGGTCGCGGAGTTGag > 2:9279705/3‑149 (MQ=255) gTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGAtgtg > 2:485350/1‑150 (MQ=255) ttGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGc < 1:146967/150‑1 (MQ=255) aCCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAg < 1:761666/150‑1 (MQ=255) ccAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAgg > 2:8653420/1‑150 (MQ=255) cAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGt < 1:7737178/150‑1 (MQ=255) aGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGtt < 2:8444489/150‑1 (MQ=255) aGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGtt < 2:6422191/150‑1 (MQ=255) aGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGtt < 1:219407/150‑1 (MQ=255) aGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGtt < 1:10804938/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTcc > 2:5663547/1‑150 (MQ=255) gTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTcc < 1:3549331/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTcc < 1:8647285/150‑1 (MQ=255) ggCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGc < 1:817725/150‑1 (MQ=255) gCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCg > 2:470290/1‑150 (MQ=255) gCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCg > 2:2660392/1‑150 (MQ=255) gagaCGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAg < 1:10052375/150‑1 (MQ=255) gagaCGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAg < 1:6563342/150‑1 (MQ=255) agaCGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGGAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAgg < 2:5135793/150‑1 (MQ=255) aGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTgg < 1:6851293/150‑1 (MQ=255) cctgtgCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATca < 2:7255733/145‑1 (MQ=255) ttGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATcacc > 2:5787030/1‑150 (MQ=255) ttGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATcacc > 1:8790774/1‑150 (MQ=255) tGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATcacca < 1:9297480/150‑1 (MQ=255) tGGCGATGTCCTTATGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATcacca < 2:156709/150‑1 (MQ=255) gATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGtt > 1:3101228/1‑150 (MQ=255) aTGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTc < 2:9341198/150‑1 (MQ=255) gTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAg > 1:10506670/1‑150 (MQ=255) tCCTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAgg > 1:1162487/1‑150 (MQ=255) ccTTCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGc < 2:6693837/150‑1 (MQ=255) tCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCctt < 2:10004028/150‑1 (MQ=255) tCTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCctt < 2:1938954/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCcttc < 1:610055/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCcttc < 2:803430/150‑1 (MQ=255) gCGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCcttctt > 2:10188385/1‑150 (MQ=255) cGGCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCttcttc < 2:6260600/150‑1 (MQ=255) ggCACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTtcc > 2:3927065/1‑150 (MQ=255) cACGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTtcctc < 1:2320140/150‑1 (MQ=255) cGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCCGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCg > 2:7111803/1‑150 (MQ=255) cGCCGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCg > 2:6508768/1‑150 (MQ=255) ccGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCGGc > 1:5491280/1‑150 (MQ=255) ccGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCGGc < 1:5387942/150‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCGGcc < 1:8035600/150‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCGGcc < 1:9452927/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCGGccc < 2:312847/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCGGccc < 2:1105721/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCGGccc < 2:2432024/150‑1 (MQ=255) tGCGGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCGGcccc > 1:1996298/1‑150 (MQ=255) | CGACGGGCGCTGAGATGGGTGACGTTGTCGCCCTGGCGCTCGGCGGTGACCTTGCGGCAGTGCACCAGGGCGTCGCGGATCATGAAGTTGACCAGGGTCGGCGAGACGCCCAGTTCCTTGGCGATGTCCTTCTGCGGCACGCCGTGCAGGCGGTACATCTCGAAGGCGTAGCGGGTGCGCTTGGGCAGCTCGGTGAGGGCATCCGCGATGTGTTCGAGGGTCGCGTAGTTGATGTGCGAGGTTTCCGGCGAGGCGCCCTGGATCACCACGTTCAGGCCTTCTTCCTCCGGCCCC > NC_008463/2910058‑2910351 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |