| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_008463 | 3,279,247 | G→A | intergenic (‑33/+64) | PA14_RS31655 ← / ← katE | hypothetical protein/catalase HPII |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 3,279,247 | 0 | G | A | 99.3% | 2187.6 / NA | 543 | intergenic (‑33/+64) | PA14_RS31655/katE | hypothetical protein/catalase HPII |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (282/257); minor base C (2/2); total (284/259) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 557 total aligned reads displayed.
TGTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCGCCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACAT > NC_008463/3279100‑3279393 | gTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCAccc > 1:983004/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCttt > 2:4785789/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCttt < 2:10697375/150‑1 (MQ=255) 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aaGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCgg < 2:8176196/150‑1 (MQ=255) aGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGt > 1:8856634/1‑150 (MQ=255) aTCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGtgctgc > 2:3524866/1‑150 (MQ=255) tCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCa > 1:1580375/1‑150 (MQ=255) tCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCa > 2:8637291/1‑150 (MQ=255) 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tccCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCt > 2:10618933/1‑150 (MQ=255) tccCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTGCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCt < 2:8914567/150‑1 (MQ=255) ccgccgAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTgg > 1:8979447/1‑150 (MQ=255) ccgAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGGGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGgcgc < 2:1187819/150‑1 (MQ=255) gAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGCTCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAg > 2:7011974/1‑150 (MQ=255) aaTCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAgg > 1:5377775/1‑150 (MQ=255) aTCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGc > 2:452254/1‑150 (MQ=255) tCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGcc < 1:10823364/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCgg < 2:6183435/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCgggg > 2:7206701/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCgggg < 2:3786927/150‑1 (MQ=255) cGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGa < 1:7224660/150‑1 (MQ=255) gccagccaCCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAg > 1:639202/1‑150 (MQ=255) cAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGAc > 1:10009000/1‑150 (MQ=255) aGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACa < 1:2569982/150‑1 (MQ=255) gccaccCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACAt > 2:7934490/1‑150 (MQ=255) gccaccCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACAt > 2:2355521/1‑150 (MQ=255) | TGTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCGCCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACAT > NC_008463/3279100‑3279393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |