Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_008463 | 5,905,079 | A→G | F731F (TTT→TTC) | glnE ← | bifunctional [glutamate‑‑ammonia ligase]‑adenylyl‑L‑tyrosine phosphorylase/[glutamate‑‑ammonia‑ligase] adenylyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | NC_008463 | 5,905,079 | 0 | A | G | 99.6% | 2087.9 / NA | 532 | F731F (TTT→TTC) | glnE | bifunctional [glutamate‑‑ammonia ligase]‑adenylyl‑L‑tyrosine phosphorylase/[glutamate‑‑ammonia‑ligase] adenylyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (298/232); minor base T (1/1); total (299/233) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 534 total aligned reads displayed.
CAGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATAAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGTT > NC_008463/5904932‑5905224 | cAGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATgaa > 1:3195959/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATgaa > 1:2916410/1‑150 (MQ=255) aGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAac > 1:8159816/1‑150 (MQ=255) 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ggTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTgcc < 1:4029912/150‑1 (MQ=255) cGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTgccgcc > 1:2355959/1‑150 (MQ=255) cGCCGACATGGATGAACCCCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGCACTCCAGCCCGCCGACCTGGCCGTCGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTgccgcc < 2:8184415/150‑1 (MQ=255) gCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgcca > 1:6908899/1‑150 (MQ=255) tCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggcc > 1:1526806/1‑150 (MQ=255) 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tGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGt > 2:2928241/1‑150 (MQ=255) ggATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGtt > 2:3809875/1‑150 (MQ=255) | CAGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATAAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGTT > NC_008463/5904932‑5905224 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |