| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_008463 | 1,598,729 | C→T | G125S (GGC→AGC) | argF ← | ornithine carbamoyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_008463 | 1,598,729 | 0 | C | T | 99.3% | 1668.4 / ‑5.6 | 410 | G125S (GGC→AGC) | argF | ornithine carbamoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (219/186); minor base G (3/0); total (222/188) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.54e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 410 total aligned reads displayed.
ACTTCAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCCGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTCGCGCG > NC_008463/1598582‑1598875 | cTTCAGCGCCTCTTCTATATAGCTGTGGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGGGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGtt < 2:399299/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTg < 2:215061/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGAt < 2:7074970/150‑1 (MQ=255) 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cGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGa < 2:8024544/150‑1 (MQ=255) gAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGAt < 1:2746003/150‑1 (MQ=255) gAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGAt < 2:456017/150‑1 (MQ=255) cAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCgg < 1:8889692/150‑1 (MQ=255) aCTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCt < 1:4995524/150‑1 (MQ=255) ggCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTcgc > 2:10912394/1‑150 (MQ=255) cAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTcgccg > 2:3301167/1‑150 (MQ=255) aGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTcgccgc > 1:2144298/1‑150 (MQ=255) aGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTcgccgc > 2:535023/1‑150 (MQ=255) tcgtcgGACAGGCTGTTGATCACCTGCACCTTCGAGTTCGCGGCGAATTCCGTCTGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCTTCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTgg < 1:3007232/150‑1 (MQ=255) 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gACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTcg > 2:1972381/1‑150 (MQ=255) gACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCGGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTcg < 2:7514109/150‑1 (MQ=255) | ACTTCAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCCGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTCGCGCG > NC_008463/1598582‑1598875 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |