| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_008463 | = 5979139 | 270 (0.510) | 312 (0.630) | 166/282 | 2.2 | 55.1% | coding (520/804 nt) | tatC | twin‑arginine translocase subunit TatC |
| ? | NC_008463 | 5979152 = | 255 (0.510) | coding (533/804 nt) | tatC | twin‑arginine translocase subunit TatC | |||||
Only 100 of 620 total aligned reads displayed.
ATCCTGTTCTACGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGGGTGGTCGACGTCGAGTACCTGAAGAAGATCCGCCCGTACGTGATCATCGGCTGCTTCGTGGTCGGCATGGTCCTGACCCCGCCGGACATCTTCTCCCAG > NC_008463/5978989‑5979288 | atcCTGTTCTACGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCG < 1:6727311‑M1/151‑1 (MQ=255)atcCTGTTCTACGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCG > 2:11138520‑M1/1‑151 (MQ=255) ccTGTTCTACGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGag < 1:6048032‑M1/151‑3 (MQ=255) tGTTCTACGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGt > 2:9797634/1‑151 (MQ=255) tGTTCTACGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGt < 2:2488149/151‑1 (MQ=255) gTTCTACGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTc > 1:9645213/1‑151 (MQ=255) tCTACGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatccc > 1:6518766‑M1/1‑144 (MQ=255) cTACGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccg < 1:7385758‑M1/151‑9 (MQ=255) cTACGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccg < 1:8995785‑M1/151‑9 (MQ=255) aCGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggt > 2:8615320‑M1/1‑141 (MQ=255) aCGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggt < 1:2339355‑M1/151‑11 (MQ=255) aCGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCtt < 2:5441169/151‑1 (MQ=255) cGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtg < 1:3053297‑M1/151‑12 (MQ=255) ccGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCga < 1:11533153/151‑1 (MQ=255) ccGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCga < 1:7760282/151‑1 (MQ=255) ggATGGCCTTCGCCTACGCCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccac < 1:1670054‑M1/151‑17 (MQ=255) tGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATccc > 2:3282778/1‑151 (MQ=255) ccTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGt > 1:10521817/1‑151 (MQ=255) cTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctg > 2:10601240‑M1/1‑128 (MQ=255) cTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTg > 2:8684993/1‑151 (MQ=255) ttCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgc > 2:3071734‑M1/1‑127 (MQ=255) tCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgct < 1:1098899‑M1/151‑26 (MQ=255) gCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCa < 2:6461562/151‑1 (MQ=255) cTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACg > 1:7975506/1‑151 (MQ=255) tACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatct > 1:10765657‑M1/1‑121 (MQ=255) cTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcg > 2:7720500‑M1/1‑115 (MQ=255) ggTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGctgctg < 2:4757634/151‑1 (MQ=255) ggTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGctgctg < 2:9288029/151‑1 (MQ=255) gtTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtg < 1:9504547‑M1/151‑42 (MQ=255) gtTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATc < 2:5209110/151‑1 (MQ=255) cccGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtc < 2:107906‑M1/151‑45 (MQ=255) cccGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtc < 2:4394657‑M1/151‑45 (MQ=255) ccGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcg < 1:2443837‑M1/151‑46 (MQ=255) cGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcga > 1:3730862‑M1/1‑105 (MQ=255) atgatCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCg > 2:6041238/1‑151 (MQ=255) tgatCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCgg < 2:1537041/151‑1 (MQ=255) cTTCCCCTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgag < 1:7088313‑M1/151‑54 (MQ=255) tCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGggtggt < 2:6057442/151‑1 (MQ=255) 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gACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGGGTGGTCGACGTCGAGTACCTGAAGAAGATCCGCCCGTACGTGATCATCGGCTGCTTCGTGGTCGGCATgg > 1:8204216/1‑151 (MQ=255) aCTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGGGTGGTCGACGTCGAGTACCTGAAGAAGATCCGCCCGTACGTGATCATCGGCTGCTTCGTGGTCGGCATGGt < 2:10331472/151‑1 (MQ=255) cTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgacgaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccg < 2:6160624‑M1/151‑123 (MQ=255) ttCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccgg > 2:10924177‑M1/1‑28 (MQ=255) gTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccggaca > 2:10084509‑M1/1‑25 (MQ=255) gTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGGGTGGTCGACGTCGAGTACCTGAAGAAGATCCGCCCGTACGTGATCATCGGCTGCTTCGTGGTCGGCATGGTCCTGa > 1:3428655/1‑151 (MQ=255) gTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGGGTGGTCGACGTCGAGTACCTGAAGAAGATCCGCCCGTACGTGATCATCGGCTGCTTCGTGGTCGGCATGGTCCTGa > 1:8809227/1‑151 (MQ=255) tCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccggacat > 1:21259‑M1/1‑24 (MQ=255) ccTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccggacatc < 1:7868880‑M1/151‑129 (MQ=255) tGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGGGTGGTCGACGTCGAGTACCTGAAGAAGATCCGCCCGTACGTGATCATCGGCTGCTTCGTGGTCGGCATGGTCCTGAcccc < 2:9086392/151‑1 (MQ=255) gACCCTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccggacatcttc < 1:4124437‑M1/151‑132 (MQ=255) cccTGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccggacatcttctc > 1:5934119‑M1/1‑18 (MQ=255) cTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGGGTGGTCGACGTCGAGTACCTGAAGAAGATCCGCCCGTACGTGATCATCGGCTGCTTCGTGGTCGGCATGGTCCTGACCCCGCCgg > 2:193999/1‑151 (MQ=255) tGTTCTTCGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccggacatcttctccca > 2:7390906‑M1/1‑15 (MQ=255) gTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGGGTGGTCGACGTCGAGTACCTGAAGAAGATCCGCCCGTACGTGATCATCGGCTGCTTCGTGGTCGGCATGGTCCTGACCCCGCCGGAc < 1:5647238/151‑1 (MQ=255) tcttcGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccggacatcttctcccagac > 1:9280175‑M1/1‑12 (MQ=255) tcttcGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGGGTGGTCGACGTCGAGTACCTGAAGAAGATCCGCCCGTACGTGATCATCGGCTGCTTCGTGGTCGGCATGGTCCTGACCCCGCCGGACAt < 1:5311337/151‑1 (MQ=255) tcGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccggacatcttctcccagaccat < 2:6966515‑M1/151‑143 (MQ=255) tcGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccggacatcttctcccagaccat < 2:7960052‑M1/151‑143 (MQ=255) cGCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgagctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccggacatcttctcccagaccatg > 1:5629147‑M1/1‑8 (MQ=255) cGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGGGTGGTCGACGTCGAGTACCTGAAGAAGATCCGCCCGTACGTGATCATCGGCTGCTTCGTGGTCGGCATGGTCCTGACCCCGCCGGACAtcttc > 1:619872/1‑151 (MQ=255) gCCTTCGagatcccggtggccacggtgctgctgatctggatcggggtggtcgacgtcgagtacctgaagaagatccgcccgtacgtgatcatcggctgcttcgtggtcggcatggtcctgaccccgccggacatcttctcccagaccatgc > 1:1320543‑M1/1‑7 (MQ=255) | ATCCTGTTCTACGCCGGGATGGCCTTCGCCTACTTCCTGGTGTTCCCGATGATCTTCCACTTCTTCGCCAGCGTGACGCCCGAGGGCGTGGCGATGATGACGGACATCAACAGCTACCTGGACTTCGTCCTGACCCTGTTCTTCGCCTTCGGCGTCGCCTTCGAGATCCCGGTGGCCACGGTGCTGCTGATCTGGATCGGGGTGGTCGACGTCGAGTACCTGAAGAAGATCCGCCCGTACGTGATCATCGGCTGCTTCGTGGTCGGCATGGTCCTGACCCCGCCGGACATCTTCTCCCAG > NC_008463/5978989‑5979288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |