Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_008463 | 2,985,345 | A→G | K2233E (AAA→GAA) | pvdD → | pyoverdine non‑ribosomal peptide synthetase PvdD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_008463 | 2,985,345 | 0 | A | G | 99.6% | 1843.8 / NA | 461 | K2233E (AAA→GAA) | pvdD | pyoverdine non‑ribosomal peptide synthetase PvdD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (216/242); minor base T (1/1); total (217/244) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 465 total aligned reads displayed.
CTGTTACAAGACCCTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCAAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGCACCGGTCAGGGTCGAAGCGTTCTGGAACG > NC_008463/2985197‑2985492 | cTGTTACAAGACCCTCTCCATCGCGCTGCGCGATCGTCATCCGGTCAACGGTGTTGTCTGCCGGGCCCTGCTGGGCGCTGGACGCGAGGCGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAAATGCTGCAGGAGCACCCCgaa < 2:7661726/151‑1 (MQ=255) tGTTACAAGACCCTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAg < 2:2233310/151‑1 (MQ=255) ttACAAGACCCTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAggg > 1:11211934/1‑151 (MQ=255) aCAAGACCCTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGt < 2:9475133/151‑1 (MQ=255) cAAGACCCTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGtt < 1:10428356/151‑1 (MQ=255) caGACCCTCGCCTTGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCGGCAGGAGCACCCCGAAGGGGttt < 2:6769049/150‑1 (MQ=255) aaGACCCTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGttt > 2:8829307/1‑151 (MQ=255) aGACCCTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGtttt < 1:11062835/151‑1 (MQ=255) gACCCTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTc < 2:8310361/151‑1 (MQ=255) aCCCTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGGTGCGGTAGACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCCCCCCGAAGGGGTTTTCa > 2:10821045/1‑151 (MQ=255) cccTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCaa > 1:467565/1‑151 (MQ=255) ccTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAAc > 1:669489/1‑151 (MQ=255) cTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAAcc > 1:2214345/1‑151 (MQ=255) tCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCt < 2:7568192/151‑1 (MQ=255) gCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTgg < 2:9752695/151‑1 (MQ=255) gCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTgg > 1:6507172/1‑151 (MQ=255) aTGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCgg > 1:7356682/1‑151 (MQ=255) aTGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCgg > 1:2157561/1‑151 (MQ=255) aTGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCgg < 1:4341052/151‑1 (MQ=255) tGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCggg > 1:2315660/1‑151 (MQ=255) cgcTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATg > 2:1570171/1‑151 (MQ=255) gcTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATgg > 1:8768906/1‑151 (MQ=255) cTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGt > 2:6214769/1‑151 (MQ=255) cTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGt > 1:7105377/1‑151 (MQ=255) cTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGt < 1:10392371/151‑1 (MQ=255) gCGGTATGGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATCTGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACACCTAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCg < 2:4127009/151‑1 (MQ=255) gggATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCt > 1:1552263/1‑151 (MQ=255) gTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTcggcgg < 1:35278/151‑1 (MQ=255) ccGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAAcc < 1:3332136/151‑1 (MQ=255) cGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCt < 2:8493698/151‑1 (MQ=255) gTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTgg > 2:6061973/1‑151 (MQ=255) tCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGc < 2:4598540/151‑1 (MQ=255) tCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCGGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGc < 2:1729362/151‑1 (MQ=255) aaGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCga > 1:2810882/1‑151 (MQ=255) aaGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCga > 1:6947113/1‑151 (MQ=255) gggTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCgatg > 2:1158286/1‑151 (MQ=255) ggTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCgatgg < 1:1014044/151‑1 (MQ=255) gtgtTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCgatgga > 2:11018134/1‑151 (MQ=255) gtgtTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCgatgga < 2:7863203/151‑1 (MQ=255) ttgtCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGt < 2:5014171/151‑1 (MQ=255) ttgtCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGt > 1:7481899/1‑151 (MQ=255) ccGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGcc > 1:1000279/1‑151 (MQ=255) ccGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGcc < 1:2403658/151‑1 (MQ=255) 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tgctgGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGa > 2:483004/1‑151 (MQ=255) tgGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGACTACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGagca < 2:5134013/151‑1 (MQ=255) gggCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGagcag < 2:6985236/151‑1 (MQ=255) gcTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTg < 1:2633904/151‑1 (MQ=255) tGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTggg < 2:4327482/151‑1 (MQ=255) tCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGggcgg < 1:5511637/151‑1 (MQ=255) cgcgAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGggcggc > 2:2374241/1‑151 (MQ=255) gcgAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCa < 1:911618/151‑1 (MQ=255) cgAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAg > 1:9534274/1‑151 (MQ=255) gAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAgg > 1:10981960/1‑151 (MQ=255) aGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGt > 1:8055048/1‑151 (MQ=255) tGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGc < 1:1697532/151‑1 (MQ=255) ggAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTtc > 2:7246094/1‑151 (MQ=255) gAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTtcg > 1:421657/1‑151 (MQ=255) tGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTtcgtcg > 2:2179562/1‑151 (MQ=255) tGGGACGAGATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAAGTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTtcgtcg < 2:1319164/151‑1 (MQ=255) gggACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCgg < 1:6758560/151‑1 (MQ=255) ggACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGc > 1:764961/1‑151 (MQ=255) ggACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGc > 2:6106253/1‑151 (MQ=255) ggACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGc < 1:11380947/151‑1 (MQ=255) atatGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGAt < 1:6292448/151‑1 (MQ=255) tGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGCGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGa > 2:11229418/1‑151 (MQ=255) tGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGa < 1:5253127/151‑1 (MQ=255) tGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGa < 2:9047385/151‑1 (MQ=255) ggTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGAt < 1:3747382/151‑1 (MQ=255) ggTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGAt > 1:3056316/1‑151 (MQ=255) ggTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGAt < 1:8086520/151‑1 (MQ=255) gTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATg > 1:8268729/1‑151 (MQ=255) ttGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATgc > 1:4063671/1‑151 (MQ=255) ggAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCg > 1:5716252/1‑151 (MQ=255) ggAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCg > 1:2510568/1‑151 (MQ=255) ggAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCg < 2:3303864/151‑1 (MQ=255) aaTACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGc > 1:11481827/1‑151 (MQ=255) aTACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGCa < 1:8567868/151‑1 (MQ=255) cGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGCACCg > 2:1835672/1‑151 (MQ=255) 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ttGCTGCAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGCACCGGTCAGGGTCg < 2:2918617/151‑1 (MQ=255) gctgcAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGCACCGGTCAGGGTCGaa > 1:5832336/1‑151 (MQ=255) gctgcAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGCACCGGTCAGGGTCGaa < 1:5665470/151‑1 (MQ=255) gcAGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGCACCGGTCAGGGTCGAAGCg > 1:9831445/1‑151 (MQ=255) aGGAGCACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGCACCGGTCAGGGTCGAAGCGtt > 2:5938538/1‑151 (MQ=255) 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cACCCCGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGCACCGGTCAGGGTCGAAGCGTTCTGGa < 2:2715152/151‑1 (MQ=255) cccGAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGCACCGGTCAGGGTCGAAGCGTTCTGGAACg < 2:5631164/151‑1 (MQ=255) | CTGTTACAAGACCCTCGCCATGGCGCTGCGGGATCGTCATCCGGTCAAGGGTGTTGTCTGCCGTGCCCTGCTGGGCGCTGGTCGCGAGGTGCCGGAGTGGGACGATATGGTTGCGGAATACGCCGAGCAATTGCTGCAGGAGCACCCCAAAGGGGTTTTCAACCTGGCGGGATGGTCGCTCGGCGGCAACCTGGCGATGGATGTCGCGGCCCGGCTGGAGCAGCGTGGGCGGCAGGTGGCTTTCGTCGGCTGGATCGATGCGCCGGCACCGGTCAGGGTCGAAGCGTTCTGGAACG > NC_008463/2985197‑2985492 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |