| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_008463 | 96,621 | (GGCTGT)12→13 | pseudogene (13/723 nt) pseudogene (789/894 nt) |
tagH ← tagH ← |
type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_008463 | = 96548 | 12 (0.040) | 232 (0.460) +TGGCTG |
97/142 | 0.8 | 89.2% | pseudogene (86/723 nt) pseudogene (862/894 nt) |
tagH tagH |
type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
| ? | NC_008463 | 96549 = | 35 (0.070) | pseudogene (85/723 nt) pseudogene (861/894 nt) |
tagH tagH |
type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
|||||
Only 100 of 433 total aligned reads displayed.
AGGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑A‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCT‑‑‑‑‑‑GTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCT‑‑‑‑‑‑GTGGCTGT‑‑‑‑‑‑TGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGC > NC_008463/96399‑96684 | agctGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCCCgctggc > 1:1282685/4‑151 (MQ=255) ctgCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtg < 2:11130744‑M1/150‑3 (MQ=255) ctgCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtg > 2:8977486‑M1/2‑149 (MQ=255) ctgCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtg < 1:1715084‑M1/150‑3 (MQ=255) tGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCCGGAACGCCGGCCGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtgg > 2:458159‑M1/1‑148 (MQ=255) tGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtgg > 1:321979‑M1/1‑148 (MQ=255) gcggccgatggctTCCATCTGCGCTCCGCCGCCGGCCGCGTCGACCTTCAA‑CCGGGTCACGCCGGCGCCGCGCAGGACCGCCTGCAGCAGGTCGCAGCCGGCCGTCGCTGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggc < 1:491074‑M1/145‑5 (MQ=255) ggccgatggCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctg < 2:10413342‑M1/147‑7 (MQ=255) ggccgatggCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctg < 2:1755906‑M1/147‑7 (MQ=255) ggccgatggCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctg > 1:5584683‑M1/5‑145 (MQ=255) ggccgatggATTCCATCTTCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGAACTTCAA‑CAGGGTCATGCAGGCGCAGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGTCCGTCGCGGCGGCGCTTGACGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctg > 2:6336000‑M1/5‑145 (MQ=255) ccgatGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGCACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtg < 1:386232‑M1/149‑9 (MQ=255) cgaTGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtgg < 1:10066327‑M1/150‑10 (MQ=255) gttggCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGGCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggc > 1:3628698‑M1/3‑141 (MQ=255) gATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggc > 2:6036545‑M1/1‑141 (MQ=255) aTGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggct < 2:3896833‑M1/151‑12 (MQ=255) tGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctg < 2:10024474‑M1/151‑13 (MQ=255) ggCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgt > 2:2004462‑M1/1‑138 (MQ=255) ttCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCGTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggc < 1:7571601‑M1/151‑17 (MQ=255) tCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑ACCTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggct < 2:8839388‑M1/151‑18 (MQ=255) ccATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctg > 2:123500‑M1/1‑133 (MQ=255) aTCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggcggtggcg‑‑‑‑‑‑gtggcggtg > 2:2499802/1‑151 (MQ=255) tCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtgg < 2:7032689‑M1/151‑22 (MQ=255) cTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggc < 2:2407765‑M1/151‑23 (MQ=255) cGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg > 2:872025‑M1/1‑121 (MQ=255) cGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggcggtggctgtggcggtggctg > 2:9730002‑M1/1‑121 (MQ=255) cGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCgggctgtggctgtggctgtggctgtggcgg > 1:4761159‑M1/1‑121 (MQ=255) ggCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt > 1:6446080‑M1/1‑120 (MQ=255) gcgcCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 1:10456913‑M1/151‑33 (MQ=255) ccggccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:1458494‑M1/151‑36 (MQ=255) ccggccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:11207164‑M1/151‑36 (MQ=255) cggccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggcggtggctg > 2:1879801‑M1/1‑115 (MQ=255) ggccggGTCGGCCTTCAA‑CGGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggcgggggctggggctgtggctggggctgtggcggt > 2:4681361‑M1/1‑114 (MQ=255) ggTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:6873682‑M1/151‑43 (MQ=255) gTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 1:3112009‑M1/151‑44 (MQ=255) gTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctggggctgtggcggtggctgtggctgt > 1:8436093‑M1/1‑108 (MQ=255) tCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 1:1953516‑M1/151‑45 (MQ=255) gACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGGGGCGCTTGGCGGGGGCGTGGGCGCCGGCACGCTGGCtggctgtgggtgtggctggggctggggcgggggcggtggctggggc > 2:9256102‑M1/1‑105 (MQ=255) gACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggcggtggctgtggctgtggctgtggc > 1:2419644‑M1/1‑105 (MQ=255) gACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggcggtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc > 1:9235882‑M1/1‑105 (MQ=255) ttcaa‑ctggGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGACGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg > 2:8194770‑M1/5‑101 (MQ=255) a‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCTCGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 2:10812947‑M1/151‑55 (MQ=255) cTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 1:4277482‑M1/151‑56 (MQ=255) cTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt > 1:1845329‑M1/1‑96 (MQ=255) tGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 2:9914153‑M1/151‑57 (MQ=255) ggTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc < 1:10974459‑M1/151‑59 (MQ=255) gTCATGCCGGCGCCGCGCAGGCACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:7331359‑M1/151‑60 (MQ=255) gTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:6496590‑M1/151‑60 (MQ=255) tCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg > 2:3555917‑M1/1‑91 (MQ=255) aTGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 1:7304649‑M1/151‑63 (MQ=255) gCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt > 1:11476674‑M1/1‑87 (MQ=255) cGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctggggctgtggctgtggctgtggcggtggctgtggcggtggctgtggctg > 2:2227514‑M1/1‑85 (MQ=255) cgccgcGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg > 1:9486988‑M1/1‑82 (MQ=255) cgccgcGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 2:6231902‑M1/151‑70 (MQ=255) ccgcGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 1:4039513‑M1/151‑72 (MQ=255) cgcgCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:5797788‑M1/151‑73 (MQ=255) cAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCGGGCTGGCTGTGGCT‑‑‑‑‑‑GTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTTGCGGTGGCTGGGGCTGTGGCGGTGGCT‑‑‑‑‑‑GGGGCTGT‑‑‑‑‑‑ggg > 2:11564431/1‑151 (MQ=38) aGGAACGCCTGCCGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCTCGCTGGCTggctggggct‑‑‑‑‑‑gtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct‑‑‑‑‑‑gtggcggtggct < 2:6904729/151‑5 (MQ=39) aCGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttg < 1:785465‑M1/151‑82 (MQ=255) ccTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggt < 1:2270353‑M1/151‑85 (MQ=255) tGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCGTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCGGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtga < 2:3249366‑M1/151‑87 (MQ=255) agcagGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggcggtggctgtggctgtggcggtggctgtggctgtggctgtggcggttgggtgatcc > 2:9086641‑M1/1‑62 (MQ=255) cagGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCgggctggggctggggctgtggctgtggctgtggctgtggcgggggctgtggctgtggctggggctgtggctggggctggtgggtgatcccc > 2:5273359‑M1/1‑60 (MQ=255) ggTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgg < 1:3829381‑M1/151‑94 (MQ=255) ggTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggcggtggctgtggctgtggctgtggctgtggcggtggctgtggctgtggctgtggctgtggcagtggctgttgggtgttccccgg > 1:11171371‑M1/1‑58 (MQ=255) gTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccggg < 2:4803307‑M1/151‑95 (MQ=255) tCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggt < 1:6088506‑M1/151‑96 (MQ=255) ccggccgTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctggggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcga < 2:4453717‑M1/151‑102 (MQ=255) ccggccgTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCT‑‑‑‑‑‑GTGGCTGT‑‑‑‑‑‑TGGGTGATCCCCGGGTCGGCGa > 2:964318/1‑151 (MQ=37) ggccgTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCT‑‑‑‑‑‑GTGGCTGT‑‑‑‑‑‑TGGGGGATCCCCGGGTCGGCGAAg > 1:8553739/1‑151 (MQ=25) tCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcat < 2:7956240‑M1/151‑109 (MQ=255) cgcgGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggcggtggctggggctgtggctgtggctgtggcggtggctgtggctgtggcggtggctggggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatc > 1:6788118‑M1/1‑42 (MQ=255) gcggcggcgCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcg > 1:2632919‑M1/1‑41 (MQ=255) cggcggcgCGTGCCGGGGGCGGCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgc < 1:10288296‑M1/151‑112 (MQ=255) ggcggcgCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgcc > 2:583369‑M1/1‑39 (MQ=255) ggcggcgCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctggggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggcggtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgcagggcatcgcc > 1:4082434‑M1/1‑39 (MQ=255) gcggcgCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgcca < 1:10751048‑M1/151‑114 (MQ=255) gcggcgCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgatgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgcca > 2:2995196‑M1/1‑38 (MQ=255) gcgcTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcg < 1:5379723‑M1/151‑117 (MQ=255) ttGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgt < 2:7588544‑M1/151‑121 (MQ=255) ttGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCT‑‑‑‑‑‑GGGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGGGGCT‑‑‑‑‑‑GTGGCGGTGGCGGGTGGGTGATCCCCGGGTGGGCGTAGGGCATCGCCAGCGGCGt > 1:7994923/1‑151 (MQ=25) tGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtc < 2:10694475‑M1/151‑122 (MQ=255) tGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCT‑‑‑‑‑‑GTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCGGTGGCTGT‑‑‑‑‑‑GGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTc > 2:8511801/1‑151 (MQ=25) cGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggt > 2:4200485‑M1/1‑27 (MQ=255) cGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggt < 2:3695269‑M1/151‑125 (MQ=255) gggggCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcggcggtg > 1:8187958‑M1/1‑26 (MQ=255) gggggCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctggggctggggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgggggtgttgggtgttccccgggtcggcgtagggcatcgccagcggcgtcgggg > 1:6300735‑M1/1‑26 (MQ=255) cGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggatcggcc > 2:2821085‑M1/1‑21 (MQ=255) cgggggcgccacgctgGGtgggtgtggctgttgctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgggtgtgggtgtggctgtggctgtggcttttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgct < 1:9626165‑M1/145‑134 (MQ=255) cGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgct > 2:7795944‑M1/1‑18 (MQ=255) ggCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctg > 1:291314‑M1/1‑17 (MQ=255) cgccgcCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctggc > 1:6244298‑M1/1‑15 (MQ=255) cgccgcCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctggc < 1:9049861‑M1/151‑137 (MQ=255) gccgccACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctggct < 1:11617230‑M1/151‑138 (MQ=255) cGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctggctgcggctg > 2:4965261‑M1/1‑7 (MQ=255) gctggctggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctggctgcggctgg < 2:8042301‑M1/151‑146 (MQ=255) ggctggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctggctgcggctggacg < 1:7407931‑M1/151‑149 (MQ=255) gctggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctggctgcggctggacga < 1:5057913‑M1/151‑150 (MQ=255) gctggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctggctgcggctggacga > 1:1108937‑M1/1‑2 (MQ=255) ctggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgttgggtgatccccgggtcggcgaagggcatcgccagcggcgtcggttcggccgctggctgcggctggacgac < 2:11452391‑M1/151‑151 (MQ=255) | AGGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑A‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCT‑‑‑‑‑‑GTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCT‑‑‑‑‑‑GTGGCTGT‑‑‑‑‑‑TGGGTGATCCCCGGGTCGGCGAAGGGCATCGCCAGCGGCGTCGGTTCGGCCGCTGGCTGCGGC > NC_008463/96399‑96684 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |