| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 2,001,809 | T→G | D65E (GAT→GAG) | pgl → | 6‑phosphogluconolactonase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 2,001,809 | 0 | T | G | 99.8% | 1895.8 / NA | 483 | D65E (GAT→GAG) | pgl | 6‑phosphogluconolactonase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (209/273); total (209/274) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 486 total aligned reads displayed.
GCAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGATCAGGTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCAGC > NC_008463/2001667‑2001954 | gCAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCTGGGCCAGGGGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGATCGAGGAGCCGCTGGa < 2:2870569/151‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCGCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGAc > 1:1629371/1‑151 (MQ=255) gcgcCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTg < 2:1085052/151‑1 (MQ=255) cgccgcCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTgg < 2:1977446/151‑1 (MQ=255) cgccgcCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTgg > 1:9098463/1‑151 (MQ=255) gccgccGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGt < 2:2135409/151‑1 (MQ=255) ccgccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTc < 1:11437506/151‑1 (MQ=255) cgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCgg > 2:11456291/1‑151 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGa > 1:3087097/1‑151 (MQ=255) aGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCAc > 2:11306028/1‑151 (MQ=255) aGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCAc < 2:639246/151‑1 (MQ=255) ccGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTAGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGATCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTc < 1:4565057/151‑1 (MQ=255) cgGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGc > 2:3281826/1‑151 (MQ=255) cgGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGc < 1:7677077/151‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCt < 1:1131219/151‑1 (MQ=255) cTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCTGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTgg < 2:10441778/151‑1 (MQ=255) tGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGc > 1:4458829/1‑151 (MQ=255) cgccgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCcgac > 1:894031/1‑151 (MQ=255) gccgAGGTCGGCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCGGCTGGTGGTGTCCGGTGGGGGCCGGCCGGGGGCCTTCCACGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCCCCCTCGGCCGGGCcgacg > 2:8615716/1‑151 (MQ=255) gccgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCcgacg < 1:7812807/151‑1 (MQ=255) cgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGTGCGAGGAGCCGCTGGACGGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAg > 2:5972185/1‑151 (MQ=255) cgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAg < 1:6181767/151‑1 (MQ=255) gAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAgc > 1:3897390/1‑151 (MQ=255) 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ggccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCGAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCAGTCCTCGAAGCCTTGAGCGATGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGc < 1:8353308/151‑1 (MQ=255) ggccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGc > 1:2717258/1‑151 (MQ=255) gccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGcc < 2:1171853/151‑1 (MQ=255) ccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCg > 2:100670/1‑151 (MQ=255) ccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCg < 1:3768518/151‑1 (MQ=255) ggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGa < 1:6482779/151‑1 (MQ=255) gTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAg > 1:6019716/1‑151 (MQ=255) gTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAg < 1:826370/151‑1 (MQ=255) tGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTc > 1:2890098/1‑151 (MQ=255) cgcTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGc < 1:10017243/151‑1 (MQ=255) 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gggCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGc < 1:864268/151‑1 (MQ=255) ggCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGcc > 1:6619809/1‑151 (MQ=255) ccAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTg < 2:8006825/151‑1 (MQ=255) aGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGt > 2:5091770/1‑151 (MQ=255) aGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGt > 2:4706592/1‑151 (MQ=255) 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ccTTCCGCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgcgcg < 2:2363167/151‑1 (MQ=255) gtCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCt < 2:5638955/150‑1 (MQ=255) ccTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTc > 2:9485244/1‑151 (MQ=255) cTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCa > 1:2087178/1‑151 (MQ=255) cTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCGGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCa < 2:7224966/151‑1 (MQ=255) tCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCAt > 1:692309/1‑151 (MQ=255) aaGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGGTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCgg < 2:8934243/151‑1 (MQ=255) aaGCCTAGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCAAGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCgg > 2:10569956/1‑151 (MQ=255) aGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGc > 2:1700843/1‑151 (MQ=255) cTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCctc > 1:1316098/1‑151 (MQ=255) ttGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCctct < 1:1465916/151‑1 (MQ=255) tGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTa > 1:3450338/1‑151 (MQ=255) | GCAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGATCAGGTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCAGC > NC_008463/2001667‑2001954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |