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Only 100 of 511 total aligned reads displayed.
TCTCCAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCA > NC_008463/5103079‑5103369 || tctcCAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGa < 2:6985994/151‑1 (MQ=255) ggCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTc < 1:2382233/151‑1 (MQ=255) gcgcgcgcCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTcc > 1:10657510/1‑151 (MQ=255) 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atgTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGc > 1:8449256/1‑151 (MQ=255) gTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGATCGGACCGCTg > 2:3779433/1‑151 (MQ=255) aCATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGc > 1:9701891/1‑151 (MQ=255) aTCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCg > 1:4727601/1‑151 (MQ=255) ggAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGtc > 2:9056591/1‑150 (MQ=255) ggAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTa > 1:9074474/1‑151 (MQ=255) aGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTAcc > 2:1840834/1‑151 (MQ=255) gTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTAccc > 2:1392167/1‑151 (MQ=255) gTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTAccc < 1:8748024/151‑1 (MQ=255) tACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCca > 1:6304569/1‑151 (MQ=255) aCTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCcat > 2:1111795/1‑151 (MQ=255) cTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCcatc < 1:1703172/151‑1 (MQ=255) || TCTCCAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCA > NC_008463/5103079‑5103369 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |