| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_008463 | = 1707447 | 547 (1.090) | 16 (0.040) | 15/270 | 35.3 | 3.1% | coding (830/1758 nt) | PA14_RS07935 | DUF1302 domain‑containing protein |
| ? | NC_008463 | 1707841 = | 490 (1.080) | coding (1224/1758 nt) | PA14_RS07935 | DUF1302 domain‑containing protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 550 total aligned reads displayed.
GGAATGGGACCAGACGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGCGGCGGAGCTGAACGACACCGAGTTCGGCCTGTACGCGATGAACTACCACAGTCGCAACCCGTACTACAGCGTGATCGCCGGCAACGGCCTGGCCACCT > NC_008463/1707298‑1707596 | aaTGGGACCAGACGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATc > 1:8803246/1‑150 (MQ=255) aTGGGACCAGACGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATcg < 2:485509/150‑1 (MQ=255) aTGGGACCAGACGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATcg < 2:5989559/150‑1 (MQ=255) tGGGACCAGACGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATcgc < 1:9131163/150‑1 (MQ=255) tGGGACCAGACGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATcgc > 2:7765422/1‑150 (MQ=255) tGGGACCAGACGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATcgc < 2:4633801/150‑1 (MQ=255) aCCAGACGGTGATCGACAACAGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATg < 2:3593301/150‑1 (MQ=255) ccAGACGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGc > 1:1428916/1‑150 (MQ=255) cAGACGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGcc > 2:258834/1‑150 (MQ=255) taCGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCcg > 2:10056166/2‑150 (MQ=255) cGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCcgcg > 2:7214040/1‑150 (MQ=255) gTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGAc > 2:155595/1‑150 (MQ=255) cAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGTTCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCa > 1:10516715/1‑150 (MQ=255) aaCTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAg > 1:7665509/1‑150 (MQ=255) tGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTgg < 1:8250560/150‑1 (MQ=255) cGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTgggg > 1:5400426/1‑150 (MQ=255) ggCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGc > 1:2335174/1‑150 (MQ=255) ggCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGc > 1:9653493/1‑150 (MQ=255) gCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGcc < 1:1133634/150‑1 (MQ=255) cACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCt > 2:10272219/1‑150 (MQ=255) aCCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGCTCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTg > 2:9394641/1‑150 (MQ=255) cttcttCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGc > 1:1268163/1‑150 (MQ=255) ttcttcTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGcc > 1:3594965/1‑150 (MQ=255) ttcttcTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGcc > 1:6183568/1‑150 (MQ=255) ttctCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTg < 2:3694896/150‑1 (MQ=255) ttctCCACCACCGACGTGGTCGCCGAGGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTg < 1:7422459/150‑1 (MQ=255) ctcCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCCGTGGGGCCTGGCCCTgcg > 2:5722203/1‑150 (MQ=255) ctcCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTgcg > 1:5068813/1‑150 (MQ=255) ccaccaCCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCt < 2:7965857/150‑1 (MQ=255) ccccacccacGTCGTCGCCGCCGGCCGCCAGCGGACGGTCTACGCCGGCAGCGACATCGCCCCGCACCCGCCCAACGGCGACCGCGCCCTGCCGCGCGCCGGCGACCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTg < 2:6252622/148‑1 (MQ=255) accaccGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTgg > 2:8420311/1‑150 (MQ=255) ccaccGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGt < 1:8040974/150‑1 (MQ=255) caccGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTa < 2:5310881/150‑1 (MQ=255) ccGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTAcg < 2:10849387/150‑1 (MQ=255) ccGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTAcg > 1:3331295/1‑150 (MQ=255) aCGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGAGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACgcgg > 2:9183513/1‑150 (MQ=255) cGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACgcggc < 1:4359906/150‑1 (MQ=255) tGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCTACAGCGGCCAGACGGGCAAGCCCGCGCGCTGGTCcgcctcgc > 2:6963683/1‑145 (MQ=255) tGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGcggcgg > 1:7883312/1‑150 (MQ=255) gggTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGcggcgg < 2:9805085/149‑1 (MQ=255) ccGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGTCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGCGGCGGAGCTGa > 1:7237631/1‑150 (MQ=255) gATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGCGGCGGAGCTGAAc > 1:1018817/1‑150 (MQ=255) gATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGCGGCGGAGCTGAAc < 2:6681240/150‑1 (MQ=255) 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accgctaccTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGCGGCGGAGCTGAACGACACCGAGTTCGGCCTGTACGCGATGAACTACCACAGTCGCAACCCGTACTACAGCGTGa < 1:5952083/150‑1 (MQ=255) accgctaccTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGCGGCGGAGCTGAACGACACCGAGTTCGGCCTGTACGCGATGAACTACCACAGTCGCAACCCGTACTACAGCGTGa < 1:665166/150‑1 (MQ=255) ccgctaccTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTCCGCGGCGGAGCTGAACGACACCGAGTTCGGCCTGTACGCGATGAACTACCACAGTCGCTACCCGTACTACAGCGTGAt > 2:1694777/1‑150 (MQ=255) ccgctaccTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGCGGCGGAGCTGTACGACACCGAGTTCGGCCTGTACGCGATGAACTACCACAGTCGCAACCCGTACTACAGCGTGAt > 1:4511803/1‑150 (MQ=255) ccgctaccTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGCGGCGGAGCTGAACGACACCGAGTTCGGCCTGTACGCGATGAACTACCACAGTCGCAACCCGTACTACAGCGTGAt < 2:1416459/150‑1 (MQ=255) 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gATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGCGGCGGAGCTGAACGACACCGAGTTCGGCCTGTACGCGATGAACTACCACAGTCGCAACCCGTACTACAGCGTGATCGCCGGCAACGGCCTGGCCAcc < 1:9943043/150‑1 (MQ=255) aTCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGCGGCGGAGCTGAACGACACCGAGTTCGGCCTGTACGCGATGAACTACCACAGTCGCAACCCGTACTACAGCGTGATCGCCGGCAACGGCCTGGCCACCt > 2:1787792/1‑150 (MQ=255) | GGAATGGGACCAGACGGTGATCGACAACTGCGGCACCTTCTTCTCCACCACCGACGTGGTCGCCGATGGCTGCGAGCGGATGGTCTACGCCGGCAGCGACTTCGACCCGAACCCGGCCAACGGCTACCGCTACCTGCCGCGCGCCGGCGATCGCGATGCCCGCGACAGCGGCCAGTGGGGCCTGGCCCTGCGCTGGTACGCGGCGGAGCTGAACGACACCGAGTTCGGCCTGTACGCGATGAACTACCACAGTCGCAACCCGTACTACAGCGTGATCGCCGGCAACGGCCTGGCCACCT > NC_008463/1707298‑1707596 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |