| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 3,390,474 | Δ1 bp | pseudogene (440/1997 nt) | PA14_RS15455 → | alkaline phosphatase D family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 3,390,472 | 0 | G | . | 99.6% | 2269.5 / 2.1 | 463 | pseudogene (438/1997 nt) | PA14_RS15455 | alkaline phosphatase D family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (202/259); minor base C (0/2); total (202/261) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
Only 100 of 478 total aligned reads displayed.
TGCGCCTCGCCGCCGACGGC‑GGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCGGGCGGCCGATGGGCCTGCTGCAGGTAGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGCCATCCATGGG > NC_008463/3390324‑3390618 | tGCGCCTCGCCGCCGACGGC‑GGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCgg < 2:3825370/150‑1 (MQ=255)tGCGCCTCGCCGCCGACGGC‑GGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCACTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGATGATCAACGGCTACTGCCGCAAGCCGCATCACCCgg > 1:28977/1‑150 (MQ=255) gccgACGGC‑GGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGATggc > 1:11105071/1‑149 (MQ=255) ccgACGGCGGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGATggc > 1:10216781/1‑149 (MQ=255) ccgACGGC‑GGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGATggcc < 1:10345983/150‑3 (MQ=255) ccgACGGC‑GGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGATggcc > 2:3015185/1‑148 (MQ=255) cgACGGC‑GGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGATggcct > 1:5467593/1‑147 (MQ=255) gACGGC‑GGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGATggcctg > 2:2109500/1‑146 (MQ=255) aCGGC‑GGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCctgc > 1:6285944/1‑150 (MQ=255) cggc‑ggGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCctgct < 1:1275633/150‑1 (MQ=255) gc‑ggGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCtgctgc > 2:9591840/1‑150 (MQ=255) gc‑ggGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCtgctgc < 1:9391062/150‑1 (MQ=255) gccgggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCACGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACCGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCtgctgc < 2:7936871/147‑1 (MQ=255) gggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAgg < 2:331222/150‑1 (MQ=255) ggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATC‑CCCCGGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGt < 1:8319984/150‑1 (MQ=255) gAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGtc < 1:9632093/150‑2 (MQ=255) ccGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGAcc < 2:6916385/150‑1 (MQ=255) cgcgGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCg < 2:595331/150‑1 (MQ=255) cgGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGgc > 2:6521185/1‑150 (MQ=255) ggAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGGCTCGACCAGTTGCTCCACGGCGCCTGCCGCACGCCGCAGCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGgctg > 1:536133/1‑150 (MQ=255) aaTCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGgctgct < 1:10021698/150‑1 (MQ=255) tCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTgg < 2:10413353/150‑1 (MQ=255) ccGACTGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCACGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTggagg < 2:4986542/150‑1 (MQ=255) gAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGaa < 1:1615184/150‑1 (MQ=255) gAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGaa < 1:8639815/150‑1 (MQ=255) aaTGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGaaa < 2:7058942/150‑1 (MQ=255) aaTGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGaaa < 1:2685676/150‑1 (MQ=255) aTCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAgg < 2:238547/150‑1 (MQ=255) tCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGc > 2:5709711/1‑150 (MQ=255) cTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGcc < 1:347153/150‑1 (MQ=255) tACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAgc < 1:3951389/150‑1 (MQ=255) tACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAgc > 2:9295225/1‑150 (MQ=255) aCCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAgcc < 2:7836564/150‑1 (MQ=255) cccGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAgccgc < 1:1233868/150‑1 (MQ=255) ccGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAgccgcc < 2:1193131/150‑1 (MQ=255) cGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGccc > 1:4302395/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGc > 2:11003490/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGc < 1:4781718/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGt > 1:10510986/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCGCCAGCCGGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGt > 2:3445520/1‑150 (MQ=255) aGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGc > 1:7570761/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCt < 2:8764636/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCAGCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGTAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTGGCt > 1:3527042/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGCCAGGTGCACAAGCCACGTCTACACCATTTGCTCCACGGCTCCAGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GCCTGCCGAT‑TGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGCAGGAAAACCTGCAGCAGCCCGAAAGCCGCCCGGCGTAGCaga > 2:5119551/1‑150 (MQ=255) gcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatg > 1:6024169/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGCCCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTGGCtgatga < 2:9418471/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatga < 2:7236608/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCGGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatga > 1:1951047/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatgatg < 2:3712193/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAg < 1:3229957/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAg > 1:6711070/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGGTGCTGATGATGAgc > 1:8257812/1‑150 (MQ=255) gTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAgcggc < 1:4905560/150‑1 (MQ=255) cTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGAc < 1:4146613/150‑1 (MQ=255) tCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGAcc < 2:6398578/150‑1 (MQ=255) cAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGAcaa < 1:5810270/150‑3 (MQ=255) aaGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAg < 1:5198385/150‑1 (MQ=255) aGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAgg > 2:8427333/1‑150 (MQ=255) ccACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTc < 1:9334700/150‑1 (MQ=255) cGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTAc < 1:2168944/150‑1 (MQ=255) gTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACg > 2:8863152/1‑150 (MQ=255) tctcGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGc < 2:7517455/150‑1 (MQ=255) ctcGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGcc < 1:5130154/150‑1 (MQ=255) cGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCACGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTTGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCcga < 2:6148415/150‑1 (MQ=255) cGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCcga < 2:5354394/150‑1 (MQ=255) cGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCcga < 1:3765758/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCgacgac > 2:10709248/1‑150 (MQ=255) cAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCgacgac < 2:6073025/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCgacgac > 1:7805718/1‑150 (MQ=255) cAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCgacgac < 1:900808/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGt > 1:2463830/1‑150 (MQ=255) gTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGt < 2:4659948/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGt < 2:9014986/150‑1 (MQ=255) ttGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTc > 1:5591055/1‑150 (MQ=255) cTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGcc > 2:2647227/1‑150 (MQ=255) tCCCCGGCTCCTGCCGCATGCCGCATCACCC‑GGCGGCCG‑TTGGCCTGCTGCTGGTCGACCGGCTGCTGGTGGAAAACCTGCTGCTGGCCTAAAGCCGCGCGGGTTTGCTTATTATGTGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCg < 2:1837862/150‑1 (MQ=255) tCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCg > 1:8119644/1‑150 (MQ=255) cACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCggg < 1:6529078/150‑1 (MQ=255) cGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGcc < 2:3194516/150‑1 (MQ=255) cGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGcc > 1:8716025/1‑150 (MQ=255) ggCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCg < 1:10090535/150‑1 (MQ=255) gCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGa < 1:1331676/150‑1 (MQ=255) cTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGAt < 1:10288798/150‑1 (MQ=255) tCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATg > 1:2297593/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGc > 1:9482840/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGc > 1:3138138/1‑150 (MQ=255) cTGCCGCCAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCt < 1:7373304/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCt > 2:889909/1‑150 (MQ=255) tGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTTCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCtg > 2:11059478/1‑150 (MQ=255) gCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCtgg > 2:1550951/1‑150 (MQ=255) cAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGc < 1:11005601/150‑1 (MQ=255) aaGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGcc > 1:3703049/1‑150 (MQ=255) ccGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGGGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGccatc > 1:8358895/1‑150 (MQ=255) cGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGccatcc < 2:10038649/150‑1 (MQ=255) cATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGccatccat < 2:1997806/150‑1 (MQ=255) aTCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGCCATCCATg < 1:9835806/150‑1 (MQ=255) aTCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGCCATCCATg > 2:10357111/1‑150 (MQ=255) tCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGCCATCCATgg < 1:3600939/150‑1 (MQ=255) cACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGCCATCCATggg < 2:4235055/150‑1 (MQ=255) cACCC‑GGCGGCCGA‑GGGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGCCATCCATggg < 2:7386297/150‑1 (MQ=255) | TGCGCCTCGCCGCCGACGGC‑GGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCGGGCGGCCGATGGGCCTGCTGCAGGTAGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGCCATCCATGGG > NC_008463/3390324‑3390618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |