| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_008463 | = 3304506 | 421 (0.830) | 19 (0.040) | 18/266 | 29.1 | 4.9% | coding (1023/1449 nt) | PA14_RS15105 | aldehyde dehydrogenase family protein |
| ? | NC_008463 | 3304825 = | 367 (0.810) | coding (704/1449 nt) | PA14_RS15105 | aldehyde dehydrogenase family protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 426 total aligned reads displayed.
AGGGTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAACGCCGCG > NC_008463/3304357‑3304655 | gggTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCTCGATGTCCAGGTCCGTATCAACGACATCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGa < 2:7174762/150‑1 (MQ=255) gggTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGa > 1:595254/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGAt < 1:2594638/150‑1 (MQ=255) cACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTg < 1:2948055/150‑1 (MQ=255) aCCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTgg > 2:6334692/1‑150 (MQ=255) aCCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATCGCCTgg > 2:363455/1‑150 (MQ=255) ccGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGc > 1:6734647/1‑150 (MQ=255) cGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGCAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCg < 2:10264984/150‑1 (MQ=255) cGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCg < 1:759326/150‑1 (MQ=255) gTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTa > 1:5348924/1‑150 (MQ=255) gTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTa > 2:9353650/1‑150 (MQ=255) gTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTa < 1:10626296/150‑1 (MQ=255) gAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgc < 1:2520986/150‑1 (MQ=255) acggTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTACAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGTCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgct < 2:1355014/148‑1 (MQ=255) aaGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgct > 2:7481871/1‑150 (MQ=255) aaGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgct < 1:4183040/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCTGTAGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGTCGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgctcg < 1:11143524/150‑1 (MQ=255) gTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgctcgc < 2:2696886/150‑1 (MQ=255) gTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgctcgc < 2:1079775/150‑1 (MQ=255) ttCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGgctcgctc > 1:4586567/1‑150 (MQ=255) tCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGctcgctcg > 1:8336613/1‑150 (MQ=255) ccTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcga < 1:3476392/150‑1 (MQ=255) ctcttGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcgac < 2:8979735/147‑1 (MQ=255) cTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcgac < 1:7231459/150‑1 (MQ=255) tGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcgacg < 1:8831997/150‑1 (MQ=255) agTTGCACGAGGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcgacg < 1:200933/149‑1 (MQ=255) ttGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcgacgcg < 1:10001713/150‑1 (MQ=255) tGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcgacgcgc < 2:9773681/150‑1 (MQ=255) cACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcgacgcgctc < 2:245729/150‑1 (MQ=255) aCGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGGACGGCTcgctcgacgcgctcg > 2:10152495/1‑150 (MQ=255) cGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcgacgcgctcga < 2:6006663/150‑1 (MQ=255) gATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTcgctcgacgcgctcgac > 2:1245558/1‑150 (MQ=255) gTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGtt > 1:7406004/1‑150 (MQ=255) 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gATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGa > 1:6501893/1‑150 (MQ=255) atcatcGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTCGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGGCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCGTTGTCGAt > 1:3689627/1‑150 (MQ=255) catcGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCa < 2:8022156/150‑1 (MQ=255) tcGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGc < 2:516319/150‑1 (MQ=255) aCCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGc > 1:9042194/1‑150 (MQ=255) 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tCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGGCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGttttac > 1:7696580/1‑148 (MQ=255) tACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGgcg < 2:7137172/150‑1 (MQ=255) cGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTg < 1:8660580/150‑1 (MQ=255) cgccgcGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCa < 2:73981/150‑1 (MQ=255) gccgcGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAg < 1:1580619/150‑1 (MQ=255) cgcgGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCTCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGc < 2:5012985/150‑1 (MQ=255) gcgGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCg < 1:8074109/150‑1 (MQ=255) cgGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGt < 1:8238486/150‑1 (MQ=255) ggACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCGCCCGGTCGCGGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGtt > 2:1643067/1‑150 (MQ=255) gACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCCGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTc > 2:2081009/1‑150 (MQ=255) gACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTATTCCACGCGCAGCGCCAGGCGTTc > 2:6415237/1‑150 (MQ=255) gACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGGCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCGGCGCCCGGCGGTc > 1:10885282/1‑150 (MQ=255) accaccaccCGCGCGCCGGCGGCGTTGGCCTGGCGTACGGCGCGCTCGACGCGCTCGACGATGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCCCGCGCAGGTTGTACGGGCGCTGCGCCAGGCGTTcg > 2:4391528/1‑150 (MQ=255) accaccaccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCTCGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTcg > 2:9171144/1‑150 (MQ=255) caccaccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTcgcg < 1:6943957/150‑1 (MQ=255) accaccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGCTCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGt < 1:5738361/150‑1 (MQ=255) ccaccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTa < 2:3021665/150‑1 (MQ=255) caccCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAg > 2:5404755/1‑150 (MQ=255) accCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGc < 1:5611433/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGGGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGGTCGCGTAGCCggt > 1:9651626/1‑148 (MQ=255) gcgcgcCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGtt < 2:8477590/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGtt < 2:9723537/150‑1 (MQ=255) gcgcCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTcg < 1:1287795/138‑1 (MQ=255) cggcggCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGGGCGGGGCCGGCGCCGGCCCCACGCGCCGGTTTTACAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTAgggca > 1:10291861/1‑147 (MQ=255) cggcggCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCaa < 2:11038066/150‑1 (MQ=255) ggcggcGAAGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAAc < 1:751163/150‑1 (MQ=255) gcggcgATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAAcg > 2:10676081/1‑150 (MQ=255) | AGGGTCAGCACCGGTCCGAAGGTTTCCTGTTGCACGATGTCCAGGTCCGGATCATCGACCTCCAGCAGGGTCGGACGGTAGAAGGCGCCGGCCGCCAGCTCGCCCTCGGTTACCGGGCCGCCGCGGACCACCACCCGCGCGCCGGCGGCGATGGCCTGGCGTACGGCTCGCTCGACGCGCTCGACGTTGGCCTTGTCGATCAGCGGCCCCATGTCGCTGCGCGGGTCCGCCGCCGGCCCCACGCGCAGGTTTTCCAGGCGCTGCGCCAGGCGTTCGCGTAGCCGTTCGGCAACGCCGCG > NC_008463/3304357‑3304655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |