| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 5,103,322 | G→T | P241T (CCC→ACC) | ftsZ ← | cell division protein FtsZ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 5,103,322 | 0 | G | T | 99.8% | 2205.9 / NA | 522 | P241T (CCC→ACC) | ftsZ | cell division protein FtsZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (295/226); total (295/227) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 525 total aligned reads displayed.
GCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGGACGCTTGATGATGTCGGAGATACCGCGCACGGCAC > NC_008463/5103175‑5103468 | gCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCTGAGTACTCGCACAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCTCCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCggtgg < 2:4769490/150‑1 (MQ=255) tCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGGGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGcc < 2:7801720/150‑1 (MQ=255) cGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCt < 2:1595459/150‑1 (MQ=255) cGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCt > 1:9687302/1‑150 (MQ=255) cGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCt < 1:8660897/150‑1 (MQ=255) gCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCgg > 2:2307054/1‑150 (MQ=255) cGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCggg < 2:9579662/150‑1 (MQ=255) gAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGc > 1:7991741/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |