| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_008463 | 791,848 | C→G | P610A (CCC→GCC) | pchF → | pyochelin non‑ribosomal peptide synthetase PchF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 791,848 | 0 | C | G | 99.7% | 2309.6 / ‑4.3 | 595 | P610A (CCC→GCC) | pchF | pyochelin non‑ribosomal peptide synthetase PchF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (371/222); minor base T (1/1); total (372/223) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 596 total aligned reads displayed.
GCGGGCCGTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCCCCGAAGTGGTCGC‑CTGGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGAACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATC > NC_008463/791701‑791994 | gcgGGCCGTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGcgcc > 2:5763149/1‑150 (MQ=255) gggCCGTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAACAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGa < 2:1602310/150‑1 (MQ=255) cGTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTg < 1:6278644/150‑1 (MQ=255) cGTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTg < 1:7481422/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTgg < 2:8381363/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCCATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGt > 2:10912676/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTc > 2:3301333/1‑150 (MQ=255) gCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCg < 1:5617730/150‑1 (MQ=255) 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cATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCAccgcc > 2:5647955/1‑150 (MQ=255) aTCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCCTCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCAccgccc > 2:6109540/1‑150 (MQ=255) aTCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCAccgccc > 1:10428553/1‑150 (MQ=255) aTCAGCCAGACGCCGCTCCGGCGCCAGTCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCGGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCAccgccc < 1:5161737/150‑1 (MQ=255) tCCGCCAGCCGCCGCTGGGGCGCCAGGCGATCCGCGCCAGCGCCGATGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGTTGTCCCGGACGCCGGATGCGCCTGGGTGGCCATCTACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCAccgcccg < 2:10402639/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCAccgcccgc > 1:2155899/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCgcggc > 1:6915810/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCgcggc > 2:812112/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCgcggcg > 2:9888118/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGcggcgg > 1:1984860/1‑150 (MQ=255) gccgccGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGa > 2:4285694/1‑150 (MQ=255) cgccgcTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAgg < 2:3705899/150‑1 (MQ=255) gccgcTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGt > 2:10635484/1‑150 (MQ=255) cgcTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTgg > 1:2228756/1‑150 (MQ=255) gcTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTggc > 2:4944212/1‑150 (MQ=255) gcTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTggc > 2:8002412/1‑150 (MQ=255) ggcgCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGcggcgg > 1:5048810/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGga > 1:7845258/1‑150 (MQ=255) cgcCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGgac > 2:6197074/1‑150 (MQ=255) gcCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGgacg > 2:5988275/1‑150 (MQ=255) 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ccAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGa < 1:10017563/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGa < 2:6964873/150‑1 (MQ=255) | GCGGGCCGTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCCCCGAAGTGGTCGC‑CTGGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGAACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATC > NC_008463/791701‑791994 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |