Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_008463 | 2,762,024 | A→G | N125D (AAC→GAC) | PA14_RS12995 → | lysophospholipid acyltransferase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 2,762,024 | 0 | A | G | 99.5% | 1556.0 / ‑4.8 | 396 | N125D (AAC→GAC) | PA14_RS12995 | lysophospholipid acyltransferase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (212/182); minor base T (1/1); total (213/183) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 411 total aligned reads displayed.
CGCAGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCAAGGGCACCCGCAACCTGAACAACAAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGC > NC_008463/2761877‑2762170 | cgcAGCTACGTGCTCCCCAAGGTGTACAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGgac < 1:638043/150‑1 (MQ=255) gcAGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGgacg > 1:3269852/1‑149 (MQ=255) cAGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGgacga < 2:2157819/150‑3 (MQ=255) cAGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGgacga < 1:805368/150‑3 (MQ=255) cTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGgacgacga > 1:4534393/1‑148 (MQ=255) cGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGt < 2:9059940/150‑1 (MQ=255) gTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTc < 2:4464868/150‑1 (MQ=255) tCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGc < 1:1180779/150‑1 (MQ=255) caacaaGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCt < 2:3211641/150‑1 (MQ=255) aacaaGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTg < 1:6992528/150‑1 (MQ=255) caaGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGtt > 1:33815/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGcc < 1:9481247/150‑1 (MQ=255) gtgtTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCa > 2:6244568/1‑150 (MQ=255) tggtCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCAt < 2:4887837/147‑1 (MQ=255) ttCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTc < 2:6493713/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGc > 2:3482803/1‑150 (MQ=255) gCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCg < 1:4631168/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCg < 2:8938718/150‑1 (MQ=255) 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tCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCAtgc < 1:7363381/150‑1 (MQ=255) ccgaGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCa < 2:7279705/126‑1 (MQ=255) ccgaGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCAtgctgc > 1:9374127/4‑150 (MQ=255) cgaGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGATGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATTCCCAAGTGCCGCATGCTGcc > 2:6463984/3‑150 (MQ=255) cgaGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGcc > 1:10009038/3‑150 (MQ=255) cgaGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGcc > 2:9776335/3‑150 (MQ=255) aGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGt < 1:5922334/150‑1 (MQ=255) gggCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGtt < 1:6489304/150‑1 (MQ=255) aCCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCg > 1:3817709/1‑150 (MQ=255) aCCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCATGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGGCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCg > 2:5222559/1‑150 (MQ=255) cccGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCAGTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCgc < 1:8618973/150‑1 (MQ=255) ccGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCgct < 1:3113282/150‑1 (MQ=255) cAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCgctgct < 1:10934450/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGctc < 1:4489982/150‑1 (MQ=255) aCCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGctct > 2:4332107/1‑150 (MQ=255) aCCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGctct > 1:9931773/1‑150 (MQ=255) aCCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGctct > 1:1574319/1‑150 (MQ=255) | CGCAGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCAAGGGCACCCGCAACCTGAACAACAAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGC > NC_008463/2761877‑2762170 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |