| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_008463 | 2,762,027 | A→G | N126D (AAC→GAC) | PA14_RS12995 → | lysophospholipid acyltransferase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 2,762,027 | 0 | A | G | 99.7% | 1499.1 / NA | 381 | N126D (AAC→GAC) | PA14_RS12995 | lysophospholipid acyltransferase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (203/177); minor base C (0/1); total (203/178) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 387 total aligned reads displayed.
CAGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCAAGGGCACCCGCAACCTGAACAACAAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGCA > NC_008463/2761879‑2762171 | ccgCTACGTGATCAACAAGGTGGTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCATCGCAGCGATGCCAAGGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGgacgac < 2:4323966/149‑1 (MQ=255)cAGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGgacgac < 1:1629603/151‑1 (MQ=255) gCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGgacgacga > 1:5732761/1‑149 (MQ=255) aCGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGt > 2:6234465/1‑151 (MQ=255) cGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTc < 1:10074560/151‑1 (MQ=255) cGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTc < 1:1978322/151‑1 (MQ=255) gTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCa > 2:901321/1‑151 (MQ=255) aTCAACAAGGTGTTCTACGTCGTGCTGGGCGACCGCCAGCGCAGCGAGGCCAATGCCAATCCGCTCGACCCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGc < 2:10181723/151‑1 (MQ=255) caacaaGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTg > 1:6331402/1‑151 (MQ=255) aacaaGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGt > 2:5279467/1‑151 (MQ=255) caaGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTg > 1:775754/1‑151 (MQ=255) aaGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGc < 1:9215999/151‑1 (MQ=255) aaGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGc < 2:5148352/151‑1 (MQ=255) aaGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGc < 2:6486333/151‑1 (MQ=255) gtTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTc > 2:2416880/1‑151 (MQ=255) ttCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCa > 1:9640928/1‑151 (MQ=255) ttCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCa > 2:4443972/1‑151 (MQ=255) ttCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCACTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGTCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCa < 1:8615057/151‑1 (MQ=255) 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cgaGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCg < 1:8263916/149‑1 (MQ=255) gggCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTg > 1:10203072/1‑151 (MQ=255) ggCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGc > 1:3048474/1‑151 (MQ=255) gCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGcc < 2:2588049/151‑1 (MQ=255) cACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCg < 1:1223783/151‑1 (MQ=255) 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gCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCgctgct > 2:8561098/1‑151 (MQ=255) aCCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTg < 1:1826111/151‑1 (MQ=255) | CAGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCAAGGGCACCCGCAACCTGAACAACAAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGCA > NC_008463/2761879‑2762171 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |