| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 1,082,923 | Δ1 bp | pseudogene (230/2518 nt) | hrpB → | ATP‑dependent helicase HrpB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 1,082,921 | 0 | G | . | 99.1% | 2135.7 / 9.9 | 446 | pseudogene (228/2518 nt) | hrpB | ATP‑dependent helicase HrpB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base . (205/232); minor base C (4/0); total (213/233) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 472 total aligned reads displayed.
AGCCCCGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAGGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACGGGATCCGCCTGGAAAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTCGACGA > NC_008463/1082771‑1083068 | aGCCCCGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAg < 2:9297204/151‑1 (MQ=255) gCCCCGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAgg < 2:8506225/151‑1 (MQ=255) gCCCCGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCAAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAgg < 1:42607/151‑1 (MQ=255) ccccGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggt < 2:527837/151‑2 (MQ=255) ccccGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggt < 2:11199406/151‑2 (MQ=255) ccgccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggtcg < 1:10007043/151‑4 (MQ=255) ccgccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggtcg < 2:1235238/151‑4 (MQ=255) gccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGc > 1:10955268/1‑151 (MQ=255) gccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCAGGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGc < 2:5116588/151‑1 (MQ=255) ccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCg < 1:7231370/151‑1 (MQ=255) cgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCga > 2:4241049/1‑151 (MQ=255) ccGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGACCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGt < 1:9655269/151‑1 (MQ=255) cGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTc < 2:6425401/151‑1 (MQ=255) ggCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCg > 1:4666113/1‑151 (MQ=255) aaGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCt < 2:3093316/151‑1 (MQ=255) aaGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCt < 1:5672392/151‑1 (MQ=255) gACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTAc < 2:7293128/151‑1 (MQ=255) gACCACCCGGGTGCCGCGGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTAc < 1:9143189/151‑1 (MQ=255) accaccCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCAGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGACCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTAcc < 2:7610187/151‑2 (MQ=255) ccaccCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTAccg < 2:191855/151‑3 (MQ=255) ccaccCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTAccg > 2:10740021/1‑149 (MQ=255) accCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGa > 1:10317343/1‑151 (MQ=255) accCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCG‑AAATGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGa > 1:7711358/1‑151 (MQ=255) cccGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGAt > 1:3410169/1‑151 (MQ=255) cccGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGAt < 1:496700/151‑1 (MQ=255) ccGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATc > 1:2745475/1‑151 (MQ=255) ccGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCAGCCTCATGCGCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATc > 2:2041380/1‑151 (MQ=255) cGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATcc < 1:10234673/151‑1 (MQ=255) cGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATcc < 1:1060034/151‑1 (MQ=255) tGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGccg > 1:7564822/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTg < 1:199857/151‑1 (MQ=255) gCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGag > 1:11164955/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGag > 1:7182983/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGACCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGCGACCGTCGGCTCCCGGATCCGCCTGGaga > 1:9326889/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCGCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGc < 1:8160407/151‑1 (MQ=255) gCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCa > 2:7815129/1‑151 (MQ=255) gCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCa > 1:2098833/1‑151 (MQ=255) cccTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAg < 1:4434022/151‑1 (MQ=255) ccTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAgg < 2:1367721/151‑1 (MQ=255) ccTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAgg < 2:697945/151‑1 (MQ=255) gCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTc < 2:493339/151‑1 (MQ=255) tCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCgg < 1:8302331/151‑1 (MQ=255) gacgaGCCCTGGCTCGCCGGCCCACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGcc > 2:4833322/1‑151 (MQ=255) gacgaGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGcc > 1:9790354/1‑151 (MQ=255) acgaGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGccc < 2:3003603/151‑1 (MQ=255) acgaGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGccc < 1:5411037/151‑1 (MQ=255) gaGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATTCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAACA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGa > 2:6707115/1‑151 (MQ=255) aGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGaa < 1:779883/151‑1 (MQ=255) cGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATc < 1:8515345/151‑1 (MQ=255) ccGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGa > 2:6210059/1‑151 (MQ=255) cGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGaa < 1:8012564/151‑1 (MQ=255) cGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGACGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGAGAGACCGTCGGCTAGCGGATCCGCCTGGAGTGCTGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGaa > 2:3333074/1‑151 (MQ=255) ggCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAg > 1:6530172/1‑151 (MQ=255) cAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTgg < 2:2265770/151‑1 (MQ=255) cAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTgg < 2:5925531/151‑1 (MQ=255) aaCGCATCCTCATGCTCGAACCGCGTCGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGt > 1:3583913/1‑151 (MQ=255) aaCGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGt < 2:10372018/151‑1 (MQ=255) aCGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTc > 1:2174400/1‑151 (MQ=255) cATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCAcc > 1:397552/1‑151 (MQ=255) ccTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAg < 1:4111859/151‑1 (MQ=255) aTGCTCGACCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTa < 2:1728075/151‑1 (MQ=255) aTGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGCGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTa > 2:6068331/1‑151 (MQ=255) aTGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTa > 1:737613/1‑151 (MQ=255) aTGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTa > 1:2440573/1‑151 (MQ=255) aaCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGc < 2:5341307/151‑1 (MQ=255) cgcgACGCCTCGAGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCAGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGTGTCGGACCGAAGACCCGCTTCGAAGTGGTCACAGCGGGTATCCTTGCCCg < 2:5748262/151‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTg < 2:3572572/151‑1 (MQ=255) tGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCa < 1:6368651/151‑1 (MQ=255) cggcgCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCTGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAga > 1:3071003/1‑151 (MQ=255) ggcgCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAgac < 1:1225943/151‑1 (MQ=255) ggcgCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAgac > 1:1935118/1‑151 (MQ=255) gcgGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAgacgac < 1:7024289/151‑1 (MQ=255) cgGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGAcc > 2:8763119/1‑151 (MQ=255) ggCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGCCCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCg < 1:9465374/151‑1 (MQ=255) ccGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGgc < 1:1477117/151‑1 (MQ=255) ggCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTAGCGGATCCGCCTGGCGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTAGCCTTGCCCGTCGCCTGCTCGACGACCCGGCGCTg > 1:3834716/1‑151 (MQ=255) gCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCG‑AAACGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGAGCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACGCGCAGCGAGGTGGTCGCCGAGGGTATCCGTGGCCGTCGCCGGCGAGTCGACCCGGCGCTggcgggt > 2:9775136/1‑146 (MQ=255) ggCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGgtgt > 1:1695337/1‑151 (MQ=255) ggCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGgtgt > 1:8708347/1‑151 (MQ=255) ggCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGgtgt > 2:2742744/1‑151 (MQ=255) gCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTc < 2:2472943/151‑1 (MQ=255) ggCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGc > 2:4013095/1‑151 (MQ=255) gccgccGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGcc > 1:4910831/1‑151 (MQ=255) ccgccgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCt > 1:6250635/1‑151 (MQ=255) cgccgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTg < 1:3690410/151‑1 (MQ=255) cgccgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTg < 1:2533751/151‑1 (MQ=255) gccgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTgg < 2:9042801/151‑1 (MQ=255) ccgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGt > 1:3216088/1‑151 (MQ=255) ccgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGt < 2:6823083/151‑1 (MQ=255) ccgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGt > 2:9188400/1‑151 (MQ=255) cgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGTAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTg > 2:80209/1‑151 (MQ=255) cgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTg > 2:9580413/1‑151 (MQ=255) cgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGACGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTg > 1:10468308/1‑151 (MQ=255) tGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCtt > 2:5485883/1‑151 (MQ=255) gggCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTc > 1:5273818/1‑151 (MQ=255) gggCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTc < 2:8308734/151‑1 (MQ=255) cgaaaaGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTcgac > 2:11123706/3‑151 (MQ=255) cgaaaaGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTcgac < 1:6010353/149‑1 (MQ=255) cgaaaaGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTcgac > 1:6286605/3‑151 (MQ=255) gaaaaGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTcgacg < 2:4437538/150‑1 (MQ=255) | AGCCCCGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAGGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACGGGATCCGCCTGGAAAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTCGACGA > NC_008463/1082771‑1083068 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |