| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 2,341,570 | Δ1 bp | pseudogene (530/957 nt) | PA14_RS10890 → | DUF58 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 2,341,568 | 0 | C | . | 98.6% | 2030.9 / 20.8 | 425 | pseudogene (528/957 nt) | PA14_RS10890 | DUF58 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/1); new base . (211/206); total (218/207) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 450 total aligned reads displayed.
GGAATACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGCCCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAGCCCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTACCCAGCCGGGCGACT > NC_008463/2341418‑2341716 | aaTACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGcca < 2:6003981/151‑2 (MQ=255) aTACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGccag > 2:974526/1‑149 (MQ=255) aTACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGGGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCGGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGccag > 2:5706939/1‑149 (MQ=255) aCGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGccagca < 2:1662673/151‑5 (MQ=255) aCGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGccagca < 2:1427703/151‑5 (MQ=255) cGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑Ccagcag < 1:2077602/151‑1 (MQ=255) gCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAgg > 1:10319273/1‑151 (MQ=255) ccGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGgc < 2:1561337/151‑1 (MQ=255) ccGACCTGGCAGGCGACGCGGCGGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGgc < 2:2160145/151‑1 (MQ=255) cGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGgcg < 1:2578620/151‑1 (MQ=255) cGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGgcg > 2:1914918/1‑151 (MQ=255) cGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGGTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGgcg < 2:10971795/151‑1 (MQ=255) ccTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGGTCCACCCGACCGAGCGCCGCGGCTGGCTGCGGCCGGTGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGATTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTg < 1:5047026/151‑1 (MQ=255) acTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCTCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTg < 2:620615/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTgg < 2:7495427/151‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTgg > 1:8223770/1‑151 (MQ=255) tGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGt > 1:2740472/1‑151 (MQ=255) ggCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCGGGTGGCCTGGAGCGGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTc > 1:1485425/1‑151 (MQ=255) cAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTACCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTa < 2:433793/151‑1 (MQ=255) ggCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCGTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTAcc < 1:7598193/151‑1 (MQ=255) gACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTc < 2:10135411/151‑1 (MQ=255) aCGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCGGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCg > 1:4063186/1‑151 (MQ=255) aCGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCGTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCg > 1:1825162/1‑151 (MQ=255) cgcgGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCgg > 2:10477890/1‑151 (MQ=255) cgGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCCCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGcc < 2:2616041/151‑1 (MQ=255) cTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTCCCCTCGGCCGCt > 2:2930357/1‑151 (MQ=255) tGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTg > 1:10077547/1‑151 (MQ=255) tGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTg < 1:1631859/151‑1 (MQ=255) ggTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGc < 2:4135849/151‑1 (MQ=255) ggTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTACCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGc > 1:2939401/1‑151 (MQ=255) tgTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAGccgtt < 2:1802660/151‑4 (MQ=255) gTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAGccgttc < 2:6675740/151‑5 (MQ=255) gTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAGccgttc < 1:6929849/151‑5 (MQ=255) ttCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTcc < 2:7731991/151‑1 (MQ=255) tCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCGGGTGGCCGGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCGGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGTGCCGGtcct > 1:3149326/1‑148 (MQ=255) ccACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTc < 2:844192/151‑1 (MQ=255) ccACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCGGGGGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAGccattcctc > 2:3252544/1‑144 (MQ=255) cACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTcg < 1:3898299/151‑1 (MQ=255) cACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTcg > 1:9846285/1‑151 (MQ=255) cgaccgaGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCGGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGcc > 2:5152025/1‑151 (MQ=255) cgaccgaGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGAGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGcc < 1:800682/151‑1 (MQ=255) gaccgaGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCg > 1:5723518/1‑151 (MQ=255) accgaGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGGGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCgg > 1:2454068/1‑151 (MQ=255) accgaGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCgg < 1:1235144/151‑1 (MQ=255) cgaGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGATTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCGGGAGCTGGGTGGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGTG‑CCGTTCGTCGCGCCGGgc > 1:10761036/1‑151 (MQ=255) aGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGgcgc < 1:5308381/151‑1 (MQ=255) gCGACGCGGCGGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGGTCCTCGCGCCGGGcgcg < 1:10392110/151‑1 (MQ=255) ggctggctGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATg > 2:8705698/1‑151 (MQ=255) ggctggctGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATg < 1:3382252/151‑1 (MQ=255) ggctggctGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATg > 1:3474060/1‑151 (MQ=255) ctggctgCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGcc < 2:5394172/151‑1 (MQ=255) gctgCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAg < 2:4936283/151‑1 (MQ=255) ctgCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAgg < 1:4613337/151‑1 (MQ=255) ctgCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCGGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAgg > 1:5199944/1‑151 (MQ=255) tgCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGATTTCACCTGTGCCTGCTGGTGGCCAGGAGCTGGGTCGTCCTGCG‑CCATCTGGCGCTGCTCTAGCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CGGTTCCACGCGGCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGa < 2:7964442/151‑1 (MQ=255) ggCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGGCGGGAGCTGGGTCGACCGGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCGCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTGCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGGGGCCGAGGAccc > 1:8814055/1‑150 (MQ=255) ggCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCGGGCCGGCGAG‑CCGGTGCTCGCGCCGGGCGCGGAGGTTGCCGAGGGCCa > 1:9878172/1‑151 (MQ=255) ccGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGCCCAgg > 2:6393197/1‑151 (MQ=255) ccGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAgg < 2:3788541/151‑1 (MQ=255) cGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAggg > 1:11101400/1‑151 (MQ=255) cGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAggg < 1:7345391/151‑1 (MQ=255) gggCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGgc < 2:3462026/151‑1 (MQ=255) ggCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTACCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTTGTCTACCCACGGCCGCTGTCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGgcg > 2:10315627/1‑151 (MQ=255) 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tttCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTcg > 1:8636678/1‑151 (MQ=255) tCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTcgac > 1:6555498/1‑151 (MQ=255) tCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCAGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCCCGGGCgacgac < 2:7009685/151‑1 (MQ=255) ccTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCgacgac > 2:8628733/1‑151 (MQ=255) cTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGCTGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCTCGGGCGTCGACGACt > 2:8293129/1‑151 (MQ=255) tCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCCGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGAGGACtg > 2:2327777/1‑150 (MQ=255) cGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTAc > 1:6070621/1‑151 (MQ=255) ccTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAg > 2:7322533/1‑151 (MQ=255) ccTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAg > 2:314749/1‑151 (MQ=255) ctgctgGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAgg < 2:3563343/151‑1 (MQ=255) tgctgGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAggg < 1:9151663/151‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACt > 1:7666811/1‑151 (MQ=255) gtggCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGGCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGTTGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGTCGACTACCAGGGACTgc > 1:9472990/1‑151 (MQ=255) gtggCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTgc < 2:10812782/151‑1 (MQ=255) ggCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTgcgc < 2:2787302/151‑1 (MQ=255) cTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGcc > 2:9168825/1‑151 (MQ=255) ggAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTa > 2:4591340/1‑151 (MQ=255) gAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTAc < 2:1594314/151‑1 (MQ=255) aGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTAcc < 1:4951976/151‑1 (MQ=255) aGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTAcc > 1:3666473/1‑151 (MQ=255) cTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTAccag < 1:8354032/151‑3 (MQ=255) gggTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTAccagcc > 1:4419427/1‑147 (MQ=255) ggTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGGTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTA‑CCAGCCg < 2:6134369/151‑1 (MQ=255) gTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTA‑CCAGCCgg > 1:10794520/1‑151 (MQ=255) tCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTA‑CCAGCCggg < 1:4787617/151‑1 (MQ=255) cGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTA‑CCAGCCGGGc < 1:7112256/151‑1 (MQ=255) gACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTA‑CCAGCCGGGCg < 1:2394667/151‑1 (MQ=255) | GGAATACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGCCCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAGCCCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTACCCAGCCGGGCGACT > NC_008463/2341418‑2341716 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |