| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 96,452 | +A | pseudogene (182/723 nt) | tagH ← | type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 96,451 | 1 | . | A | 97.0% | 1829.0 / 39.6 | 479 | pseudogene (183/723 nt) | tagH | type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/10); new base A (212/249); total (217/262) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 498 total aligned reads displayed.
TGCACAGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGTTGTCCAGCGTGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGACAGCGATAGGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑A‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTG > NC_008463/96302‑96596 | tGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑a < 2:7251216/151‑1 (MQ=255) caccGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCTGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGTCCTTC‑aac > 1:3675031/1‑149 (MQ=255) caccGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑aac > 1:2234672/1‑149 (MQ=255) accggCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑aact < 1:4932126/148‑4 (MQ=255) tGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCa > 2:4478899/1‑151 (MQ=255) ggATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCAt < 1:1311429/151‑1 (MQ=255) ggATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCAt > 1:6097384/1‑151 (MQ=255) aTCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGc < 2:8780649/151‑1 (MQ=255) tCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGcc < 2:2964217/151‑1 (MQ=255) cATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCg < 1:10384828/151‑1 (MQ=255) cATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCg < 2:6554901/151‑1 (MQ=255) aTGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCgg < 1:8504313/151‑1 (MQ=255) tGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGgc < 2:8738973/151‑1 (MQ=255) tGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGgc < 2:505969/151‑1 (MQ=255) tGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGgc < 1:1424608/151‑1 (MQ=255) tGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGgc < 2:8982470/151‑1 (MQ=255) tGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGgc < 1:4099590/151‑1 (MQ=255) tGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGgc < 1:10089678/151‑1 (MQ=255) tGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGcgccgc < 2:4537910/151‑1 (MQ=255) cATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAgg > 1:8582915/1‑151 (MQ=255) aTGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGa < 1:6890009/151‑1 (MQ=255) aTGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGa > 2:3675925/1‑151 (MQ=255) aTGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGa < 1:3913301/151‑1 (MQ=255) aTGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGa > 2:10612929/1‑151 (MQ=255) ggAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGc < 1:5179835/151‑1 (MQ=255) gAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGcc > 1:5226958/1‑151 (MQ=255) aaCTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCGCCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCt > 1:10528512/1‑151 (MQ=255) aCTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTg < 2:7933155/151‑1 (MQ=255) 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ctggcccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTcgccgc > 2:10195764/8‑151 (MQ=255) ctggcccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTcgccgc > 1:3488122/8‑151 (MQ=255) tggcccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCgccgcc > 1:2568487/7‑151 (MQ=255) tggcccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCgccgcc < 1:3221351/145‑1 (MQ=255) ggcccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGccgccg < 2:5919549/146‑1 (MQ=255) cccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCgccggc < 1:2990168/148‑1 (MQ=255) cgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTc < 1:9420233/148‑1 (MQ=255) gcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTcg > 2:2601147/3‑151 (MQ=255) gcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTcg < 1:678889/149‑1 (MQ=255) gcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTcg < 2:9505984/149‑1 (MQ=255) 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ccgATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtg > 2:2019369/3‑151 (MQ=255) ccgATGGCTGCCATCTGCGCGGCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGGCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtg < 2:10300006/149‑1 (MQ=255) cgagggCGTCCCTCTGCGCCCCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑T‑CGGGGGTCACGCCGGCGGCGCGCAGGTTGGCCTGCCGCTGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtgg < 2:2819062/147‑1 (MQ=255) tGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCGGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctg > 1:6695996/1‑151 (MQ=255) tGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctg > 1:5929696/1‑151 (MQ=255) ggCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgt < 2:9347289/151‑1 (MQ=255) cTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑ACC‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtgg < 2:11142049/151‑1 (MQ=255) tCCCTCTGCGCTCCGGCGCCGGCCGGGGCGACCTTCAA‑C‑GGGGTCTAGCCGGCGGCGCGCAGGACGGCCCGCAGCAGGGCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggct < 2:5370465/151‑1 (MQ=255) ccATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGCACGCCTGCCGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctg > 2:4645299/1‑151 (MQ=255) ccATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctg < 1:2388723/151‑1 (MQ=255) cATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgt > 1:11091746/1‑151 (MQ=255) cATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgt > 2:4862315/1‑151 (MQ=255) aTCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtg > 1:10813531/1‑151 (MQ=255) aTCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtg > 2:1472237/1‑151 (MQ=255) tCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtgg < 2:4774433/151‑1 (MQ=255) tGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggct < 2:10862666/151‑1 (MQ=255) gcgcTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctg < 2:7705056/151‑1 (MQ=255) cgcTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCGGGCtggctgtggctgaggctgtggctgg > 2:5751544/1‑150 (MQ=255) cgcCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGAGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 1:4660659/151‑1 (MQ=255) cggccggGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 2:3616799/151‑1 (MQ=255) ggccggGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCCCGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt < 2:9757773/151‑1 (MQ=255) gccggGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 1:806225/151‑1 (MQ=255) ccggGTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCCGGTCGCCGCCGGCAGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGAGACGGCGCCGCCAGGCTGGCtggcggtggctgtggctgtggcggtgggtgtggctgtgg > 1:643410/1‑151 (MQ=255) gggTCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct > 2:9647481/1‑151 (MQ=255) tCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 2:8118601/151‑1 (MQ=255) tCGACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 1:9748238/151‑1 (MQ=255) gACCTTCAA‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggc > 1:6270613/1‑151 (MQ=255) | TGCACAGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGTTGTCCAGCGTGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGACAGCGATAGGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑A‑C‑TGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTG > NC_008463/96302‑96596 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |