Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_008463 | 5,905,079 | A→G | F731F (TTT→TTC) | glnE ← | bifunctional [glutamate‑‑ammonia ligase]‑adenylyl‑L‑tyrosine phosphorylase/[glutamate‑‑ammonia‑ligase] adenylyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_008463 | 5,905,079 | 0 | A | G | 99.8% | 2022.7 / NA | 522 | F731F (TTT→TTC) | glnE | bifunctional [glutamate‑‑ammonia ligase]‑adenylyl‑L‑tyrosine phosphorylase/[glutamate‑‑ammonia‑ligase] adenylyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (255/266); minor base T (0/1); total (255/267) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 528 total aligned reads displayed.
GCAGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATAAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGTTCG > NC_008463/5904931‑5905226 | cgcATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCa < 2:6134412/151‑1 (MQ=255) aTGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGt > 1:8769940/1‑151 (MQ=255) aTGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGt < 2:2267036/151‑1 (MQ=255) tGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAACTGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTc < 2:10008578/151‑1 (MQ=255) tGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTc < 1:10079961/151‑1 (MQ=255) tGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTc < 1:3073006/151‑1 (MQ=255) tCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGa > 1:5397431/1‑151 (MQ=255) cGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAAAGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAg > 2:10038699/1‑151 (MQ=255) gACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAgg > 2:8722960/1‑151 (MQ=255) aCCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGt < 1:9318416/151‑1 (MQ=255) aCCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGt < 1:4144824/151‑1 (MQ=255) aCCTCGGAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGACATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACGGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGt < 2:614664/151‑1 (MQ=255) cGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGa > 2:5819178/1‑151 (MQ=255) agagGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGcc > 2:8112185/1‑151 (MQ=255) agGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCAt < 1:9223559/151‑1 (MQ=255) agGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCAt > 2:4864453/1‑151 (MQ=255) agGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCAt < 1:6937524/151‑1 (MQ=255) gggTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATg < 2:2507077/151‑1 (MQ=255) ggTGCCGGAAGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGAACGACTGCCCCCGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGa < 1:10737596/151‑1 (MQ=255) ggCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCa < 1:3216507/151‑1 (MQ=255) gCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAg > 2:7689831/1‑151 (MQ=255) cTGCGCGGTGACGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCCTGTAAAGAACTGCGCGCCATCGCTGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCccg < 2:60385/151‑1 (MQ=255) gcgcGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCccgcc < 2:9612889/151‑1 (MQ=255) cgcgGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCccgccg < 1:4046014/151‑1 (MQ=255) cgGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGAc > 2:2766478/1‑151 (MQ=255) cgGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGAc > 1:4756368/1‑151 (MQ=255) ggTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGAcc > 1:2962292/1‑151 (MQ=255) gTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCt < 1:6121000/151‑1 (MQ=255) tGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCtt < 1:3179251/151‑1 (MQ=255) aGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGc < 1:800183/151‑1 (MQ=255) gAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCg < 1:2445431/151‑1 (MQ=255) aaaTGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGt > 1:6425055/1‑151 (MQ=255) aaaTGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGt > 2:8453649/1‑151 (MQ=255) aaTGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTa > 2:7222041/1‑151 (MQ=255) aTGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAg < 1:9550214/151‑1 (MQ=255) aTGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAg > 2:7589300/1‑151 (MQ=255) ggATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGcc < 2:10499426/151‑1 (MQ=255) gatgatCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCcg < 2:9171858/151‑1 (MQ=255) atgatCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCcga > 1:909708/1‑151 (MQ=255) tgatCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCcgac < 1:11226306/151‑1 (MQ=255) gatCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCcgacg < 2:2389794/151‑1 (MQ=255) tcttctGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGAt > 1:2709289/1‑151 (MQ=255) tcttctGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGAt < 2:1943412/151‑1 (MQ=255) cttctGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATg < 2:5477538/151‑1 (MQ=255) cttctGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATg < 2:6536547/151‑1 (MQ=255) ttctGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGa > 1:8248957/1‑151 (MQ=255) ttctGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGa < 1:2086752/151‑1 (MQ=255) tctGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGAc > 2:3377757/1‑151 (MQ=255) ccAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTc > 1:6361915/1‑151 (MQ=255) ccAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTc > 1:4984900/1‑151 (MQ=255) aGGCGGGTAATGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGGGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGACGTCCg > 2:8261166/1‑151 (MQ=255) aGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCg > 2:1211744/1‑151 (MQ=255) ggCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCgg < 1:8603909/151‑1 (MQ=255) gggTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATc < 1:7342836/151‑1 (MQ=255) ggTAAAGAACTGCGCGCAATCGATGGATTTGCAGCCATCTGTCTCTCTGTGGGGGTCGCAGTCATGGATGAACACCTGGTCGAGGTCCGTTCCTTGACCGTACTCCTGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCg < 2:10849754/151‑1 (MQ=255) tAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCa > 2:568227/1‑151 (MQ=255) tAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCa > 2:1910447/1‑151 (MQ=255) aaaGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCAc < 2:3687350/151‑1 (MQ=255) gAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGc < 2:10702342/151‑1 (MQ=255) gAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGc < 1:7778816/151‑1 (MQ=255) gAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGc < 1:4291089/151‑1 (MQ=255) aaCTGCGCGCCATCGATGGATGTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCg < 2:1489689/151‑1 (MQ=255) cTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTg > 1:3557394/1‑151 (MQ=255) tGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGc > 2:4707376/1‑151 (MQ=255) cgcCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTc > 2:749262/1‑151 (MQ=255) gcCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCg < 2:6930409/151‑1 (MQ=255) ccATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCgg > 2:9042291/1‑151 (MQ=255) tCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGgcgc > 1:9785951/1‑151 (MQ=255) tCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGgcgc < 2:167866/151‑1 (MQ=255) tCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGgcgc > 1:5664317/1‑151 (MQ=255) aTGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCTCGGCGTGCCGTCGGCGCGCa > 2:3279635/1‑151 (MQ=255) aTGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCa > 1:7588202/1‑151 (MQ=255) tGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCaa > 1:9001224/1‑151 (MQ=255) tGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCaa > 1:848079/1‑151 (MQ=255) tttGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCACGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAAcggc > 2:5003178/1‑151 (MQ=255) tggccgccATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAAcggcc < 2:4120646/149‑1 (MQ=255) gccgccATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAAcggccgg < 2:9498151/151‑1 (MQ=255) ccttCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGt < 2:4359574/148‑1 (MQ=255) ccATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGt < 1:7117320/151‑1 (MQ=255) cATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACCCCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTg < 1:6742212/151‑1 (MQ=255) cATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTg > 2:4537602/1‑151 (MQ=255) tCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGACCGCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGAc < 1:6655456/151‑1 (MQ=255) cGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACg > 2:7967410/1‑151 (MQ=255) cGGTCTCGCAGGGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGATCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACg < 2:3881359/151‑1 (MQ=255) gTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGACCACCAGGTCGATGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCt < 2:3182634/151‑1 (MQ=255) gTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCt < 1:5059976/151‑1 (MQ=255) gTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCt < 1:1509984/151‑1 (MQ=255) gTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCt > 1:1807195/1‑151 (MQ=255) gCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCAcc > 2:6742524/1‑151 (MQ=255) gTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCaaa > 1:5874634/1‑150 (MQ=255) gTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAAc > 2:9888471/1‑151 (MQ=255) agggggTCGCCGTCATAGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACt > 2:10619592/2‑151 (MQ=255) cGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgcca > 1:3370510/1‑151 (MQ=255) cGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggc > 2:11020994/1‑151 (MQ=255) cGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggc > 1:1106786/1‑151 (MQ=255) gTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggcc > 1:6266802/1‑151 (MQ=255) gTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACATTTCCGTAGCCGAAGATGACGAAGTCAGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggcc > 1:10332536/1‑151 (MQ=255) tCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggcca > 1:10479570/1‑151 (MQ=255) cATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggccag > 1:1240276/1‑151 (MQ=255) tGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCTCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGtt < 2:400904/151‑1 (MQ=255) | GCAGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATAAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGTTCG > NC_008463/5904931‑5905226 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |