Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_008463 | 1,082,923 | Δ1 bp | pseudogene (230/2518 nt) | hrpB → | ATP‑dependent helicase HrpB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_008463 | 1,082,921 | 0 | G | . | 99.1% | 2254.3 / 13.2 | 471 | pseudogene (228/2518 nt) | hrpB | ATP‑dependent helicase HrpB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); major base . (228/234); minor base T (4/0); total (233/238) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.06e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 488 total aligned reads displayed.
CCCCGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAGGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACGGGATCCGCCTGGAAAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTCGACG > NC_008463/1082773‑1083067 | ccgccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggtc < 1:5253124/150‑3 (MQ=255) ccgccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggtc > 1:3504477/1‑148 (MQ=255) cgccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGGGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggtcg < 2:5707576/150‑4 (MQ=255) cgccgGGCGCCGGCACGACCCCCCGGCTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCCGGATCGCCGGCCAACGCATCCTCCACCTCGAACCGCGCCGCCAGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggtcg < 2:8813838/150‑4 (MQ=255) gccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggtcgg < 1:2478556/150‑5 (MQ=255) gccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggtcgg > 1:4315931/1‑146 (MQ=255) ggTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCgag < 1:8345580/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCgaga > 2:9070460/1‑150 (MQ=255) ccGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCg < 2:10643468/150‑1 (MQ=255) ccGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCg > 2:3849466/1‑150 (MQ=255) cGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGt < 2:4163819/150‑1 (MQ=255) gCAAGACCCCCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGCCGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCg < 1:7722902/150‑1 (MQ=255) gCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCg < 2:9270367/150‑1 (MQ=255) aGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCt < 1:1828613/150‑1 (MQ=255) aGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCt > 2:8165461/1‑150 (MQ=255) aGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGACAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCt > 1:6511710/1‑150 (MQ=255) cccGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTCGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGa < 2:5644607/150‑1 (MQ=255) cGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATc < 2:47664/150‑1 (MQ=255) gggTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATcc > 1:3620483/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGa > 2:2880993/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGa > 1:665949/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATACGCCTGGa > 2:10495643/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGag > 1:10106603/1‑149 (MQ=255) cTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGag > 1:10382996/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGagag > 1:9604706/1‑150 (MQ=255) ggCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGagag < 1:2910044/150‑1 (MQ=255) tGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCACCGCATCCTCATGCTCGACCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAggg < 2:1675677/150‑1 (MQ=255) tGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGACCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAggg < 1:4004212/150‑1 (MQ=255) tGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAggg > 1:3825033/1‑150 (MQ=255) gCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGt < 2:7539870/150‑1 (MQ=255) gCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGt < 1:8813693/150‑1 (MQ=255) gCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGt > 2:8579608/1‑150 (MQ=255) tCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGACCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCg < 1:6820945/150‑1 (MQ=255) gacgaGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCGGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGc < 1:2062081/150‑1 (MQ=255) aGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGa > 1:5753406/1‑150 (MQ=255) cccTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAg < 2:4379977/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGa < 1:8303561/150‑1 (MQ=255) gCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCg > 1:9066362/1‑150 (MQ=255) gCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCg < 2:9775652/150‑1 (MQ=255) cTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGc < 1:7893329/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCa < 1:4416580/150‑1 (MQ=255) cGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGACGACCCGCATCGa > 1:5162276/1‑150 (MQ=255) ggCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGaa < 1:5879537/150‑1 (MQ=255) ccAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGt > 1:10317336/1‑150 (MQ=255) cAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTg > 1:8078835/1‑150 (MQ=255) cAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCGGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTg < 1:2600058/150‑1 (MQ=255) aCGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGt < 1:1430573/150‑1 (MQ=255) aCGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGt < 2:1428603/150‑1 (MQ=255) cGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTc > 1:10684388/1‑150 (MQ=255) tCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCg > 2:3533957/1‑150 (MQ=255) cATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAggg < 2:5499873/150‑1 (MQ=255) tGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTa < 2:2247535/150‑1 (MQ=255) cTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATc > 2:776960/1‑150 (MQ=255) 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ccTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCt > 1:2718876/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCt > 1:6333282/1‑150 (MQ=255) gcggcgCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCaa > 1:9501567/1‑150 (MQ=255) ggcgCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAga < 2:6297415/150‑1 (MQ=255) ggagcgGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GTTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGTGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAga < 1:2210978/147‑1 (MQ=255) gcgcGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCCCCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAgac > 2:3172871/1‑150 (MQ=255) gcgcGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAgac > 2:8043682/1‑150 (MQ=255) cgcgGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAgacg > 2:5053277/1‑150 (MQ=255) gcgGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAACA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAgacga < 2:6724025/150‑1 (MQ=255) cgGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAgacgac < 2:8248238/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |