Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 1,280,712 | 0 | C | . | 99.8% | 2588.2 / ‑3.7 | 523 | intergenic (‑41/+46) | PA14_RS06005/PA14_RS06010 | DUF4345 domain‑containing protein/M23 family metallopeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base . (311/211); minor base T (0/1); total (311/212) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.05e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 557 total aligned reads displayed.
CGCCGCTGGTGAGCAGGGAGGCGAGCGGGCCGGGGAAGAAGACGAAGCCCAGGCCGAGGACCACGAACAGTGCCGAGCACAGCCAGAGCAGGCGAAGCGGGTGAGTCATGCGGTGTCTCCCTTGGTCATGAAAGGGGCGCATCGACGCGCCCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGCCGGTGGCG > NC_008463/1280563‑1280857 | cgccgcTGGTGAGCAGGGAGGCGAGCGGGCCGGGGAAGAAGACGAAGCCCAGGCCGAGGACCACGAACAGTGCCGAGCACAGCCAGAGCAGGCGAAGCGGGTGAGTCATGCGGTGTCTCCCTTGGTCATGAAAGGGGCGCATCGACgcgc < 1:6302921/150‑1 (MQ=255) cgcTGGTGAGCAGGGAGGCGAGCGGGCCGGGGAAGAAGACGAAGCCCAGGCCGAGGACCACGAACAGTGCCGAGCACAGCCAGAGCAGGCGAAGCGGGTGAGTCATGCGGTGTCTCCCTTGGTCATGAAAGGGGCGCATCGACGCGcccc > 2:3298067/1‑150 (MQ=255) tGGTGAGCAGGGAGGCGAGCGGGCCGGGGAAGAAGACGAAGCCCAGGCCGAGGACCACGAACAGTGCCGAGCACAGCCAGAGCAGGCGAAGCGGGTGAGTCATGCGGTGTCTCCCTTGGTCATGAAAGGGGCGCATCGACGCGccccctg > 1:6165421/1‑148 (MQ=255) 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tCATGAAAGGGGCGCATCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTcc > 2:4926941/1‑150 (MQ=255) cATGAAAGGGGCGCATCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCg < 1:284155/150‑1 (MQ=255) agAAAGGGGCGCATCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGt < 2:6879354/149‑1 (MQ=255) aaGGGGCGCATCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGc < 2:8081740/150‑1 (MQ=255) aGGGGCGCATCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGcc > 1:7591767/1‑150 (MQ=255) aGGGGCGCATCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGcc > 1:1674254/1‑150 (MQ=255) ggtgcgcATCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGGTGCTCACTTCTCAGGGCTGTAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGccc < 2:5924272/147‑1 (MQ=255) cgcATCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGcc < 1:8971540/150‑1 (MQ=255) cATCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGCCgg < 1:640510/150‑1 (MQ=255) cATCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGCCgg > 1:10492160/1‑150 (MQ=255) cATCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGCCgg > 1:10330316/1‑150 (MQ=255) aTCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGCCGGt > 2:3163063/1‑150 (MQ=255) aTCGACGCG‑CCCCCGGGGCCGTCGGACCACCGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCGCCGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGAGCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGGTCAGGCGGACGTTCCAGGGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGCCGGt < 2:6597626/150‑1 (MQ=255) tCGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGCCGGTg < 2:2717436/150‑1 (MQ=255) cGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGCCGGTgg < 1:4983318/150‑1 (MQ=255) cGACGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGCCGGTgg < 1:4709281/150‑1 (MQ=255) aCGCG‑CCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGCCGGTGgcg > 2:5575052/1‑150 (MQ=255) | CGCCGCTGGTGAGCAGGGAGGCGAGCGGGCCGGGGAAGAAGACGAAGCCCAGGCCGAGGACCACGAACAGTGCCGAGCACAGCCAGAGCAGGCGAAGCGGGTGAGTCATGCGGTGTCTCCCTTGGTCATGAAAGGGGCGCATCGACGCGCCCCCCTGTTCCTTCTGACCTCAGCCGGCGCCGCGTTGCTCACTTCTCAGGGCTGGAAGGCACCGATGAAGATCGCCGGGTCGACCCGCGCGTCGTTCAGGCTGACGTTCCAGTGCATGTGCGGTCCGGTGGCCCTGCCGGTGGCG > NC_008463/1280563‑1280857 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |