New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_008463 | = 5422623 | 513 (1.010) | 11 (0.020) | 11/276 | 34.5 | 2.4% | coding (919/1440 nt) | oprJ | multidrug efflux transporter outer membrane subunit OprJ |
? | NC_008463 | 5423053 = | 434 (0.930) | coding (489/1440 nt) | oprJ | multidrug efflux transporter outer membrane subunit OprJ | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 483 total aligned reads displayed.
CCGGCCGCGCGGCGCTGGTCGATCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGATTGCCGGCGGACAGGTCGGCCGG > NC_008463/5422904‑5423202 | cggccgCGCGGCGCTGGTCGATCAGGGCGCAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTg < 2:2896581/150‑1 (MQ=255) cggccgCGCGGCGCTGGTCGATCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTg > 1:26157/1‑150 (MQ=255) ggccgCGCGGCGCTGGTCGATCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGc > 2:391514/1‑150 (MQ=255) gccgCGCGGCGCTGGTCGATCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGcc > 2:2065103/1‑150 (MQ=255) cgcgGCGCTGGTCGATCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGcctcct > 1:2798085/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGATCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGc < 1:4529843/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGATCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGc > 2:5901969/1‑150 (MQ=255) ggTCGATCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCa > 1:8828178/1‑150 (MQ=255) cGATCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGt > 1:6887089/1‑150 (MQ=255) cGATCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGt < 2:10934994/150‑1 (MQ=255) aTCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTAc < 2:5360877/150‑1 (MQ=255) aGGGCGAAGGACTACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGt > 2:8937146/1‑150 (MQ=255) gggCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGtt < 2:5499394/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGGAATACTCTCGGCTGACCAGGGTCTGTCTGGTCAGCGCCAGGCGCTGCAGGGCGCAGTCGTTGGTGAGGTAGGCCCGGCTGTACTCGGCGACCAGTGCGAACCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTg < 1:3571266/150‑1 (MQ=255) gCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGc > 2:9794223/1‑150 (MQ=255) gCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGc < 1:11088157/150‑1 (MQ=255) cGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCa < 1:6710870/150‑1 (MQ=255) aGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAggg > 2:4446255/1‑150 (MQ=255) ggAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGc < 2:6785152/150‑1 (MQ=255) gAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCt < 1:5199382/150‑1 (MQ=255) aTACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGc < 1:10832248/150‑1 (MQ=255) tACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCg < 1:10739576/150‑1 (MQ=255) tACTCCCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGAAGCACAGGAAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCg < 1:875966/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGACCAGGGTCTGACGTGTCAGCGCCATGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTTGCTGACCTCGGCGACCAGTGCGAACAGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGt < 1:1486120/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGt > 2:1495344/1‑150 (MQ=255) cgGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTc < 1:3248806/150‑1 (MQ=255) gACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGct < 1:8257262/150‑1 (MQ=255) cAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCtt < 1:5262663/150‑1 (MQ=255) cAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCtt < 1:5648580/150‑1 (MQ=255) aGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTg > 1:6501411/1‑150 (MQ=255) gggTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGa > 1:7046290/1‑150 (MQ=255) gTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGAcc > 2:3488555/1‑150 (MQ=255) aCGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACccgacc < 2:10503010/150‑1 (MQ=255) aCGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACccgacc > 1:3514913/1‑150 (MQ=255) cGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTCCTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCCGGCTCTTGACccgaccg > 2:5039662/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGaa < 1:9742763/150‑1 (MQ=255) gTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAag > 2:8677448/1‑150 (MQ=255) gTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAag > 1:1683387/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAaga < 1:2944016/150‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAgg < 2:8169834/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGt > 1:6323939/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGt < 1:10475537/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGt > 2:10061807/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCa > 1:7634518/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGtt < 2:3223253/150‑1 (MQ=255) ggCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGtt < 1:1765908/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTc < 1:7509769/150‑1 (MQ=255) cgccgcAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCg < 1:5448892/150‑1 (MQ=255) cgccgcAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCg < 2:10309138/150‑1 (MQ=255) gccgcTGGCCGCCGTCGTTGCACATGGCGGCCTGGCAGGCCTGGGAGAAGAGGGGGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGt < 2:6298839/150‑1 (MQ=255) ccgcAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGTGGTCCAGTTCGTa > 1:914983/1‑150 (MQ=255) ccgcAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGAAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGAACCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTa < 1:341191/150‑1 (MQ=255) gcAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACt < 1:799340/150‑1 (MQ=255) aGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCTCGCGCTGACTCCTCGCTTGCCATGTACTGTTTCTGGGCTGCGTCGGTCAGGCTATTGACCCGACCGAAGTGGTCATGTTCGTACTcc < 2:1248007/150‑1 (MQ=255) gggCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCg < 2:8268256/150‑1 (MQ=255) gcCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAg < 2:9073630/150‑1 (MQ=255) gcCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAg < 2:8717118/150‑1 (MQ=255) ccGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAgg > 2:7919866/1‑150 (MQ=255) cgtcgtAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAggg > 2:2492937/1‑150 (MQ=255) gtcgtAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGNCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGc > 1:5858513/1‑150 (MQ=255) gtcgtAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGc > 1:10338831/1‑150 (MQ=255) tcgtAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGcc < 1:10002064/150‑1 (MQ=255) tcgtAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGcc > 2:698870/1‑150 (MQ=255) cgtAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCa < 1:8496622/150‑1 (MQ=255) tAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGc > 2:7357819/1‑150 (MQ=255) aGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGcc < 2:7605436/150‑1 (MQ=255) gCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGccc > 2:10824573/1‑150 (MQ=255) tCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGa < 1:8915199/150‑1 (MQ=255) tCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGa > 2:6706995/1‑150 (MQ=255) aGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGAcc < 1:6627640/150‑1 (MQ=255) ggTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCt > 2:2762228/1‑150 (MQ=255) tAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTgg > 1:5067777/1‑150 (MQ=255) ccTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAgc < 1:7453622/150‑1 (MQ=255) tGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAgctg < 2:5787294/150‑1 (MQ=255) ggCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAgctgc > 2:7480583/1‑150 (MQ=255) ggCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAgctgc > 1:4396452/1‑150 (MQ=255) aCCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCGGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGcc < 2:9594902/150‑1 (MQ=255) tCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACt > 1:9508589/1‑150 (MQ=255) ggCGACCTGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTc < 1:10949865/150‑1 (MQ=255) ggCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTc < 2:10748506/150‑1 (MQ=255) ggCGACCAGGGAGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTc < 2:7183455/150‑1 (MQ=255) gCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTcc < 1:2722085/150‑1 (MQ=255) cGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCg < 2:4761728/150‑1 (MQ=255) aCCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAg > 1:3895972/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGc < 1:2044037/150‑1 (MQ=255) gCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGATTg < 1:4807432/150‑1 (MQ=255) gCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGATTg < 1:998774/150‑1 (MQ=255) gATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGATTGcc < 1:3716450/150‑1 (MQ=255) gATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGAGTGcc > 2:11069615/1‑150 (MQ=255) agccGTGCCGCGCGCGCGGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGATTGCcg < 2:7223216/148‑1 (MQ=255) gTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCCGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCGGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGATTGCcggcgg > 2:8574313/1‑150 (MQ=255) gcgcgcgcTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGATTGCCGGCGGACAgg < 2:3625887/150‑1 (MQ=255) gcgcgcTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGATTGCCGGCGGACAGGTc < 1:6116153/150‑1 (MQ=255) 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gcTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGATTGCCGGCGGACAGGTcggcc > 1:4156252/1‑150 (MQ=255) gcTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGGACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGATTGCCGGCGGACAGGTcggcc < 2:1595906/150‑1 (MQ=255) | CCGGCCGCGCGGCGCTGGTCGATCAGGGCGAAGGAATACTCGCGGCTGACCAGGGTCTGACGGGTCAGCGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCGTCGTAGCTCAGGTAGGCCTGGCTGACCTCGGCGACCAGGGCGATCCGTGCCGCGCGCGCTGCCTCCTCGCTGGCCAGGTACTGTTGCAGGGCTGCGTCGGTCAGGCTCTTGACCCGACCGAAGAGGTCCAGTTCGTACTCCGGCAGGGCCAGCCCGACCTGGTAGCTGCTGGCCACTTCCGAGCGATTGCCGGCGGACAGGTCGGCCGG > NC_008463/5422904‑5423202 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |