Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_008463 | 3,515,863 | T→C | intergenic (+617/+267) | PA14_RS16005 → / ← PA14_RS16010 | AAA family ATPase/DUF4354 family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_008463 | 3,515,863 | 0 | T | C | 99.0% | 1132.1 / NA | 302 | intergenic (+617/+267) | PA14_RS16005/PA14_RS16010 | AAA family ATPase/DUF4354 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (140/159); minor base G (3/0); total (143/159) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.05e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
TATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCTTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAA > NC_008463/3515716‑3516009 | aCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGACTGTGGTGTT‑GGCCCTCAcc > 2:8884417/1‑150 (MQ=255) aCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCAcc < 2:5635838/150‑1 (MQ=255) aGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCAcccc < 1:7911500/150‑1 (MQ=255) ccccTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCGCACCCCaa > 1:4047793/1‑150 (MQ=255) ccccTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCaa < 2:8506778/150‑1 (MQ=255) cctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAAcc < 2:4038964/150‑1 (MQ=255) cctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACAACCCaaac > 1:6702784/1‑148 (MQ=255) cctccccACGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACCGCACACCTAGTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAAcc < 2:5570832/150‑1 (MQ=255) ctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTCGTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAAccc < 2:10304021/150‑1 (MQ=255) cctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCctct < 2:2525750/150‑1 (MQ=255) ctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCtct‑c < 2:8926434/150‑1 (MQ=255) tAAGACATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑cc < 2:5108267/150‑1 (MQ=255) aaGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCGCACCCCAACCCACA‑ccc > 2:1787308/1‑150 (MQ=255) aGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCTCAACCCCACACACT‑cccc > 1:4719952/1‑149 (MQ=255) aGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTGTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCg > 2:5923243/1‑150 (MQ=255) aTAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCACT‑CCCCCAcg > 2:9669160/1‑150 (MQ=255) cccTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCggg < 2:3647016/150‑1 (MQ=255) tCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGagag < 2:8038862/150‑1 (MQ=255) ccccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCTCAACCCAACCCACA‑ACCGCACGCGGGAGAgg > 2:3621935/1‑150 (MQ=255) cccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAggg < 1:1046829/150‑1 (MQ=255) cATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCCCACCCCCACCCACA‑ACCCCCCCCGGGGGAggggg > 1:1622854/1‑150 (MQ=255) cATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCGCT‑CCCCCACCCGGGGGAggggg > 2:5260371/1‑150 (MQ=255) aTACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGc < 1:4183799/150‑1 (MQ=255) aTACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGc < 2:7711418/150‑1 (MQ=255) aTACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCCCACCCCAACCCAAA‑ACCCCACCCGGGGGAGGGGGc > 2:1155975/1‑150 (MQ=255) tACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCGCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACCCCGGAGAggggggc > 1:8698679/1‑148 (MQ=255) aCCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑TGCCCTCACCCCAACCCACA‑ACCGCCAGCGGGAGAGGGGGGCg > 1:10765114/1‑150 (MQ=255) aCCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACACCCCAACCCACA‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCg > 2:169656/1‑150 (MQ=255) ccTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCgg < 1:6073686/150‑1 (MQ=255) cTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGTGGGGGCCggg > 2:7870633/1‑150 (MQ=255) gAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCCCCCCAACCCACT‑CCCCCCCGCGGGAGAGGGGGCCCGGCg > 2:8264102/1‑150 (MQ=255) aCGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCACCCCCCAACCCACTACCCGC‑CGCGGGGGAGGGGGCCGGGCggg > 1:5302699/1‑148 (MQ=255) ggCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGcc < 2:9199070/150‑1 (MQ=255) ggCACACCTATTCCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCGAACCCCCAACCACA‑CCCCCACGCGGGGGAGGGGGCCCGGccgggc > 1:9102850/1‑145 (MQ=255) gCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCt < 1:5092368/150‑1 (MQ=255) acacCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACAACCCAAACCTCA‑CCCGCACGCCGGAGTGGGGggcgggcggggcgtg > 2:10292690/1‑143 (MQ=255) ccTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGACTGTGGTGTTGGGCCGCCACCCC‑ACCCGCT‑CCCCCCCGCGGGACATGGGGGCGGGGGTGCCATGAgg > 2:3764473/1‑150 (MQ=255) ccTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGGT‑GGCCCCCACCCCCACCCTCA‑CCCGCACGCGGGGGAGGGGGCCGGGCGGGGCtggtgg > 2:3019943/1‑150 (MQ=255) ccTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGGG‑GGGCCGCACCCCCACCCTCG‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTgg > 2:4790390/1‑150 (MQ=255) tATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGt < 2:4250872/150‑1 (MQ=255) aTTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTc < 2:4830934/150‑1 (MQ=255) aTTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACAACCCAAACCACA‑CCCGCCCCGGGGTGGGGGGGGCGGGCGTGCCTTGTGGGTc > 1:8247132/1‑150 (MQ=255) ccACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCGCAACCCCAACCACA‑ACCCCACCCCGGGGGGGGGGGCCGGCGTGGCGTGGGGGtggggg > 1:450073/1‑145 (MQ=255) cACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGTCGAgcg > 2:3449371/1‑150 (MQ=255) cACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTAAACCCCAACCACT‑CCCGCACGCGGGCGAGGGGGCCGGGCGTGGCTTGTGGGTCGAgcg > 2:2106075/1‑150 (MQ=255) gCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACACCCCCAACCACT‑ACCCCACGCGGGGGGGGGGGCCGGGGGGGCCGGGTGGGGGGCGCGCcacg > 1:5757815/1‑150 (MQ=255) aaaaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCGCACCCCCACCCCAT‑ACCGCCCGCGGGGGGGGGGGCCGGGGGGGCCGTGTGGGGCGGGCGCctcgcg > 1:9201601/1‑149 (MQ=255) aaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCGCACCCCAACCCAAA‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCCGGCGTGGCTTGTTGGTGCATCGCctcgctcc > 2:7084760/1‑149 (MQ=255) aaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACACCCCAACCCACG‑CCCGCACGCGGGCGAGGGGGCCGGGGGTGCCGTGTGGGGCGAGCGCctcgctcg > 2:6352094/1‑150 (MQ=255) ccaccaCCTCCCCCGCGGCTACCCGCAATCGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCCCCCCACCCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCggg < 2:6153807/150‑1 (MQ=255) ccACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACAACCCCACCCCCA‑ACCCCCCGCGGGCGAGGGGGGCGGGCGGGGCGGGTGGGGGGAGCGCCACCCGCggg > 2:2030513/1‑150 (MQ=255) ccACAACCACCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCggg < 2:5467691/150‑1 (MQ=255) acaACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCAAACCCCCACACACA‑CCCGCCCCCCGGGGGGGGGGGCGGGCGGGGCCTGTGGGTGGAGCGGCGCGCACggggg > 1:7442567/1‑148 (MQ=255) acaACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACACCCCAACCCACA‑ACCCCACCCCGGGGAGGGGGGCGGGCGGGGCGTGTGGGGGGGGCGCcacgcaccgggg > 1:846689/1‑143 (MQ=255) ccaCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGgcgc < 2:5067609/148‑1 (MQ=255) ccgccccccCTGCTAACCGCAATCGCTGCGGCTAGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGAT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGCGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCACGGGCGCAGc < 2:2217097/147‑1 (MQ=255) ccccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCTCAACCCCAACCACA‑ACCCCCCCCGGGTGTGGGGGGCGGGGGGGCCTGGTGGGTCGGGCGCCGCCCGCGGGCGCCGCCTgg > 2:9444552/1‑150 (MQ=255) ccccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCGCACCCCCACCCACG‑ACCCCACGCGGGGGAGGGGGGCGGGCGGGCGGTGTGGGTGGTGGGCCGCGCTCGGGCgccgccgcg > 1:11187978/1‑147 (MQ=255) cccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCGCACCCCCACCCAAT‑ACCGCACCCCGGGGGGGGGGGCGGGCGTGGCTGTTGGGGCGGGCGGCGCGCTGGGGGGCAggcgggg > 1:7043659/1‑144 (MQ=255) ccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGTTCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGGCGCACCCCAAACCGAT‑CCCGCACGCGGGGGCGGGGGGCGGGCCGGCCGGGTGGGGGGTGCGCCGCGCTCGGGGGCGGccatgag > 1:7750554/1‑145 (MQ=255) ccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCTCACCCCAACCCACA‑CCCCCACCCCGGAGAGGGGGCCCGGGGGGCCGTGTGGGTCGAGCGCCGCCCGCCGGCGCAGCCGGGaa > 1:3489818/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGaa < 1:7287844/150‑1 (MQ=255) cGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCTCACCCCAACCCCCA‑ACCCCCAGCGGGTGTGGGGGCCGGGCGTGCCATGTGGGTAGAGCGCCGCGGGCGGGCGCCGCCGGGAAc > 2:7448704/1‑150 (MQ=255) cGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCGCACCCCCACCCACA‑ACCCCACCCCGGGGTGGGGGGCGGGCGGGCCGTGTGGGTCGAGCCCCGCGCACGGGCGCAGCCAGGTAc > 1:3683406/1‑150 (MQ=255) ctgctAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCACCCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGa < 2:2453635/150‑1 (MQ=255) ctgctAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGa < 1:638729/150‑1 (MQ=255) tgctAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACACCCCAACCCACA‑ACCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGGCGGGTGGGTCGAGCGCCGCGCACGGGCGCAACCggggaacat > 2:1662458/1‑144 (MQ=255) gctAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCCAAACCCAAACCACA‑ACCCCACCCCGGGGGGGGGGCCGGGCGGGGCGTGTGGGGGGGGCGCCGCCCGCGGGCGCCGCCCGGAAccctg > 1:7222373/1‑146 (MQ=255) ctAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCACCCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGt < 1:18543/150‑1 (MQ=255) tAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTc < 2:8669786/150‑1 (MQ=255) aaCCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCt < 1:10106268/150‑1 (MQ=255) aCCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCACACCCCCACCCACA‑CCCCCCCCCCGGGGAGGGGGGCGGGCGGGGCGTGTGGGTGGCTGGCCCCGCGCCGGCGCAGCCCGGGACGATGACTa > 1:1238129/1‑150 (MQ=255) gCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTAccc < 1:4025963/150‑1 (MQ=255) aTAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCAAA‑CCCGCACGCCGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGTCGAGCGCCGCGCAAGGGGGCCGCCAGGAACGATGTCAAACCTcc > 2:4535630/1‑150 (MQ=255) aGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCACCCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTcccc < 1:1718357/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTcccc < 1:6557124/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTcccc < 2:6747510/150‑1 (MQ=255) gCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCGCACCCCAACCCGGT‑CCCGCACGCGGGTGGTGGGGCCGGGCGGGGCGTGTGGGTGGAGCGCCGCGGGCGGGGGCAGCCCGGGAAGATGTGTAACccccccg > 1:10002275/1‑149 (MQ=255) gCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCt < 2:6041767/150‑1 (MQ=255) gCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCt < 1:7068283/150‑1 (MQ=255) gCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCCCACCCCCAACCACA‑CCCCCCCCCGGGTGAGGGGGGCCGGGGGGCCGTGTGGGGCGAGCCCCCCCCGCGGGGGCACCCAGGGAAGAGGTCTACCCAcccca > 1:4409127/1‑149 (MQ=255) gCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGccc < 1:9923379/150‑1 (MQ=255) cTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGcccc < 2:1392163/150‑1 (MQ=255) ttGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCAAACCCCAAACCACG‑ACCGCCCCCCGGGGCTGGGGGCGGGCGGGGCTTGTGGGGCGGGCGCCACGCGCGGGCGCCGCCGTGAACCAATTCGACCCACCCCCAGGGCCCg > 2:3251055/1‑150 (MQ=255) gAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCggg < 1:6913245/150‑1 (MQ=255) gtCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATc < 2:4347179/150‑1 (MQ=255) cgcgGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACAACCCAACCCACT‑CCCGCACCCGGGTGAGGGGGCCGGGCGGGCCGTGTGGGTCGAGCGCCACGCGCGGGCGGCCCCGGGCACCGAGGCTACCCCCCCCCAGGCCCCcgggcaagg > 2:6506563/1‑144 (MQ=255) gcgGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCCACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTgg < 1:3096557/150‑1 (MQ=255) ggATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGaa < 1:180328/150‑1 (MQ=255) aTCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAAtt < 2:210990/150‑1 (MQ=255) tccgTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACAACCCAACCCACA‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGTCGAGCGCCACGCTCGGGCGCAGCCGGGAACGATGTCTACCCAACCCTAGGCCCCGGGTGTCTGGAATTc > 2:3372336/4‑150 (MQ=255) ttttGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGccc < 1:2122599/150‑1 (MQ=255) tttGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGcccc < 1:1732387/150‑1 (MQ=255) tGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCccca < 1:1382395/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGTT‑GGCCCGCACCCCAACCCACA‑CCCGCACCCCGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGTCGAGCGCCACCCTCGGGGGCACCCGGGAACCATGTCTACCCACCCCTAGGCCCCCGGTAACTGGAATTAGGCCcccccccca > 2:8086897/1‑150 (MQ=255) tggtgTT‑GGCCCTCACCCCCACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAgg < 2:1010581/150‑1 (MQ=255) tgtT‑GGCCCTCCCCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCaa < 1:9824916/150‑1 (MQ=255) gtT‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAAc < 2:5199248/150‑1 (MQ=255) tt‑GGCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAAcc < 2:11036388/150‑1 (MQ=255) gCCCTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCaaa < 1:154402/150‑1 (MQ=255) | TATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCTTCACCCCAACCCTCT‑CCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAA > NC_008463/3515716‑3516009 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |