| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 966,217 | 0 | T | C | 99.8% | 1785.7 / NA | 464 | intergenic (+77/‑568) | PA14_RS04485/PA14_RS04490 | fimbrial protein/response regulator transcription factor |
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Only 100 of 465 total aligned reads displayed.
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gTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCAATACCGCACGCGGAATACCGATATTgag > 2:5155500/1‑148 (MQ=255) cGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTa < 2:2032175/150‑1 (MQ=255) gCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCCGATCGCCCCAGGCGCGCTGCCAATCGCTCCGCGGCGCGTCCGGGGGCGCGTGGGCACAAGGCCGTCGCGCCCGCGGGATTCCGATATTTCGGATg > 1:5194722/1‑150 (MQ=255) cgcCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCt < 1:190454/150‑1 (MQ=255) gcCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCCGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCtt < 1:10920914/150‑1 (MQ=255) 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ccTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCTTTCTGAg < 1:330784/150‑1 (MQ=255) ccTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCTTTCTGAg < 2:5513378/150‑1 (MQ=255) | TCGGCGCGGAGGGCGAATTGAAGGCCGGGGTCGCCGACGGCGCCGCCGAGTTCACGTTTACCTTCCCCTGAGCGGCGCCGCCGCTCTTTCCCCGGCGTTTCCCGCCCCGCCTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTTGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCTTTCTGAG > NC_008463/966070‑966363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |