| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 2,001,811 | A→C | Q66P (CAG→CCG) | pgl → | 6‑phosphogluconolactonase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 2,001,811 | 0 | A | C | 99.8% | 1767.6 / NA | 453 | Q66P (CAG→CCG) | pgl | 6‑phosphogluconolactonase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (201/251); minor base G (1/0); total (202/251) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 453 total aligned reads displayed.
CAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGATCAGGTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCAG > NC_008463/2001668‑2001953 | cAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGa > 1:5935765/1‑150 (MQ=255) aGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGAc < 2:9878952/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCGTCCTCGAAGCCTTGAGCGCGGAGCCGCTGGAc < 2:8462279/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACt < 1:8494150/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACt < 2:875093/150‑1 (MQ=255) cgccgcCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTg < 2:8285333/150‑1 (MQ=255) gccgccGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGCGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTgg < 2:10238982/150‑1 (MQ=255) ccgccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGGGCCGCTGGACTGGt < 2:9416090/150‑1 (MQ=255) ccgccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGt > 1:4791476/1‑150 (MQ=255) gccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTcg > 1:3582433/1‑150 (MQ=255) gccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTcg < 1:4584913/150‑1 (MQ=255) ccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTcgc < 1:126016/150‑1 (MQ=255) cgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTcgcg < 1:8718938/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCgg > 1:9579207/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCgg < 1:6184234/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCgg < 1:3785755/150‑1 (MQ=255) aGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGa > 1:9897138/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGAt > 2:4147515/1‑150 (MQ=255) cAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATc < 1:2530154/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTc > 1:3345980/1‑150 (MQ=255) gcgGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCa < 2:3316491/150‑1 (MQ=255) cgGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAg < 2:2836440/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGc > 1:3941491/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGTCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGGTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGTAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCTGcc < 2:7914088/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCt > 1:4367059/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGc < 2:5346494/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGc < 2:4261291/150‑1 (MQ=255) cgccgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCcga < 2:7111385/150‑1 (MQ=255) gccgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGCGCTGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGGGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCcgac < 2:1533535/150‑1 (MQ=255) gAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAg < 1:3237539/150‑1 (MQ=255) gAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAg < 1:10748846/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAgcg > 1:10244815/1‑150 (MQ=255) cGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTg > 1:1731326/1‑150 (MQ=255) gccggccgGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTgg > 2:697348/1‑150 (MQ=255) gccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGc > 2:1904259/1‑150 (MQ=255) gccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGc < 1:7105806/150‑1 (MQ=255) gccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGc < 1:8416691/150‑1 (MQ=255) ggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCgg > 1:10604927/1‑150 (MQ=255) 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gCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGc > 1:10148208/1‑150 (MQ=255) ccGTGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCa < 2:5933457/150‑1 (MQ=255) ccGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCa > 2:3493051/1‑150 (MQ=255) aGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACg < 1:6948125/150‑1 (MQ=255) gggCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCgg > 1:9628105/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCGTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGc < 2:10921859/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTg < 2:4749499/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTg < 1:1939009/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGtt < 1:5512150/150‑1 (MQ=255) cgcTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTc > 1:7713478/1‑150 (MQ=255) cgcTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTc < 1:675068/150‑1 (MQ=255) gctgctGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTcg > 2:4908207/1‑150 (MQ=255) ctgctgGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTcgc > 1:4189766/1‑150 (MQ=255) tgctgGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTcgcc > 1:5852634/1‑150 (MQ=255) tgctgGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCGTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTcgcc < 2:9276214/150‑1 (MQ=255) 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ccGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGgcggcg < 2:7535498/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGa < 1:10630569/150‑1 (MQ=255) gTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAg < 1:8299945/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgc > 1:8932361/1‑150 (MQ=255) ggCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgc < 1:7288191/150‑1 (MQ=255) gCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgcg < 1:8068756/150‑1 (MQ=255) gCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgcg > 2:3671323/1‑150 (MQ=255) cTTCCTCGAAGCCTTGAGGTAGGAGCCGCTGGTCTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCTGGCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgcgcg < 2:5630858/150‑1 (MQ=255) cTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgcgcg < 2:1308861/150‑1 (MQ=255) cTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgcgcg > 1:7546427/1‑150 (MQ=255) cTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTAGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgcgcg > 1:3748108/1‑150 (MQ=255) ttCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgcgcgc < 2:6335976/150‑1 (MQ=255) ccTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCtt > 1:6371441/1‑150 (MQ=255) cTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTc < 2:5481684/150‑1 (MQ=255) tCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCa > 2:2130062/1‑150 (MQ=255) cGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCAt < 2:10022203/150‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATc > 2:2965877/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATc < 1:7873446/150‑1 (MQ=255) aGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCgg > 1:2153494/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCct < 2:10790070/150‑1 (MQ=255) aGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTAc < 1:2807702/150‑1 (MQ=255) gCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGACGGCGCGCTTCATCGGCCTCTAcc > 2:10291539/1‑150 (MQ=255) gCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTAcc < 2:4432271/150‑1 (MQ=255) gCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTAcc < 1:4990246/150‑1 (MQ=255) cGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCa > 1:10318306/1‑150 (MQ=255) gaggagCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCAg < 2:8981176/150‑1 (MQ=255) gaggagCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCAg > 1:79600/1‑150 (MQ=255) | CAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGATCAGGTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCAG > NC_008463/2001668‑2001953 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |