Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_008463 | 2,762,027 | A→G | N126D (AAC→GAC) | PA14_RS12995 → | lysophospholipid acyltransferase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 2,762,027 | 0 | A | G | 99.8% | 1556.9 / NA | 398 | N126D (AAC→GAC) | PA14_RS12995 | lysophospholipid acyltransferase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (198/199); minor base C (1/0); total (199/199) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 406 total aligned reads displayed.
AGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCAAGGGCACCCGCAACCTGAACAACAAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGC > NC_008463/2761880‑2762170 | cTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGgacgacga < 1:606858/150‑3 (MQ=255) cGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGt < 1:7749028/150‑1 (MQ=255) aTCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAg > 2:4421299/1‑150 (MQ=255) 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cTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAg > 2:10798470/1‑150 (MQ=255) cTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAg < 1:3422932/150‑1 (MQ=255) gATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAggg > 1:2107124/1‑150 (MQ=255) tcatcTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGcc > 1:6981566/1‑150 (MQ=255) catcTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCg < 1:3650022/150‑1 (MQ=255) tcTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCa < 2:8594610/150‑1 (MQ=255) tcTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCa < 2:4682075/150‑1 (MQ=255) ttCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCAtg < 1:854268/150‑1 (MQ=255) ccgaGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCAtgctgc > 1:5811095/4‑150 (MQ=255) ccgaGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCAtgctgc > 2:8193639/4‑150 (MQ=255) gggCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGtt > 2:2362647/1‑150 (MQ=255) gCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGc < 1:9283942/150‑1 (MQ=255) ccGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCTTTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCgct < 2:1952020/150‑1 (MQ=255) ccGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCgct > 2:675038/1‑150 (MQ=255) gCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCgctgc > 1:2904957/1‑150 (MQ=255) gCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGACTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCgctgc > 2:6488150/1‑150 (MQ=255) aaCCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGctc < 2:788159/150‑1 (MQ=255) ccTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTg > 1:6501634/1‑150 (MQ=255) ccTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTg > 1:10458094/1‑150 (MQ=255) cTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCACCCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGc < 2:10292201/150‑1 (MQ=255) cTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGc > 1:2644966/1‑150 (MQ=255) cTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGc < 2:4939543/150‑1 (MQ=255) | AGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCAAGGGCACCCGCAACCTGAACAACAAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGC > NC_008463/2761880‑2762170 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |