| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_008463 | 3,374,601 | A→G | F41S (TTC→TCC) | PA14_RS15385 ← | aminotransferase class V‑fold PLP‑dependent enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_008463 | 3,374,601 | 0 | A | G | 99.6% | 2024.3 / NA | 512 | F41S (TTC→TCC) | PA14_RS15385 | aminotransferase class V‑fold PLP‑dependent enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (154/355); minor base T (0/2); total (155/357) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 516 total aligned reads displayed.
GCCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGAAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATCGGACGG > NC_008463/3374454‑3374747 | ggCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCgt < 1:5504942/150‑2 (MQ=255) ggCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGa < 1:6930352/150‑1 (MQ=255) ggCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGa < 2:5439172/150‑1 (MQ=255) 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cTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGAtt > 2:10740310/1‑150 (MQ=255) gggCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCaa > 2:2518124/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAac < 2:2900208/150‑1 (MQ=255) cAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAaca > 1:2286908/1‑150 (MQ=255) aGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAacac > 1:8662425/1‑150 (MQ=255) 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cATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATcggac < 2:9046711/150‑1 (MQ=255) aTGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATcggacg > 1:10300336/1‑150 (MQ=255) | GCCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGAAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATCGGACGG > NC_008463/3374454‑3374747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |