Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_008463 | 3,424,154 | A→G | Q421E (CAA→GAG) | mexY → | multidrug efflux RND transporter permease subunit MexY |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 3,424,154 | 0 | A | G | 99.8% | 1769.2 / ‑4.7 | 468 | Q421E (CAA→GAG) | mexY | multidrug efflux RND transporter permease subunit MexY |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (235/232); minor base T (0/1); total (235/233) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 474 total aligned reads displayed.
GTGGCCCTGCTCGGCACCTTCACGGTGATGCTCGGCCTGGGCTTCTCGATCAACGTGCTGACCATGTTCGGCATGGTCCTGGCGATCGGCATCCTGGTGGACGACGCGATCATCGTGGTGGAGAACGTCGAGCGGCTGATGGCCCAAGAAGGCCTGTCGCCGCACGACACCACGGTCAAGGCGATGCGCCAAATCAGCGGGGCCATCGTCGGCATCACCGTGGTGCTGGTCTCGGTATTCGTGCCGATGGCGTTCTTCAGCGGCGCGGTGGGCAACATCTACCGCCAGTT > NC_008463/3424008‑3424297 | gTGGCCCTGCTCGGCACCTTCACGGTGATGCTCGGCCTGGGCTTCTCGATCAACGTGCTGACCATGTTCGGCATGGTCCTGGCGATCGGCATCCTGGTGGACGACGCGATCATCGTGGTGGAGAACGTCGAGCGGCTGATGGCCGaggaa < 2:2782977/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTGCTCGGCACCTTCACGGTGATGCTCGGCCTGGGCTTCTCGATCAACGTGCTGACCATGTTCGGCATGGTCCTGGCGATCGGCATCCTGGTGGACGACGCGATCATCGTGGTGGAGAACGTCGAGCGGCTGATGGCCGaggaag < 1:1355014/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCTCGGCACCTTCACGGTGATGCTCGGCCTGGGCTTCTCGATCAACGTGCTGACCATGTTCGGCATGGTCCTGGCGATCGGCATCCTGGTGGACGACGCGATCATCGTGGTGGAGAACGTCGAGCGGCTGATGGCCGAGGAAGGc < 2:4628546/150‑1 (MQ=255) cTGCTCGGCACCTTCACGGTGATGCTCGGCCTGGGCTTCTCGATCAACGTGCTGACCATGTTCGGCATGGTCCTGGCGATCGGCATCCTGGTGGACGACGCGATCATCGTGGTGGAGAACGTCGAGCGGCTGATGGCCGAGGAAGGCCTg > 2:4033281/1‑150 (MQ=255) tGCTCGGCACCTTCACGGTGATGCTCGGCCTGGGCTTCTCGATCAACGTGCTGACCATGTTCGGCATGGTCCTGGCGATCGGCATCCTGGTGGACGACGCGATCATCGTGGTGGAGAACGTCGAGCGGCTGATGGCCGAGGAAGGCCTGt < 1:4078623/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCACCTTCACGGTGATGCTCGGCCTGGGCTTCTCGATCAACGTGCTGACCATGTTCGGCATGGTCCTGGCGATCGGCATCCTGGTGGACGACGCGATCATCGTGGTGGAGAACGTCGAGCGGCTGATGGCCGAGGAAGGCCTGTc > 1:6449745/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCACCTTCACGGTGATGCTCGGCCTGGGCTTCTCGATCAACGTGCTGACCATGTTCGGCATGGTCCTGGCGATCGGCATCCTGGTGGACGACGCGATCATCGTGGTGGAGAACGTCGAGCGGCTGATGGCCGAGGAAGGCCTGTc < 2:7439914/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCACCTTCACGGTGATGCTCGGCCTGGGCTTCTCGATCAACGTGCTGACCATGTTCGGCATGGTCCTGGCGATCGGCATCCTGGTGGACGACGCGATCATCGTGGTGGAGAACGTCGAGCGGCTGATGGCCGAGGAAGGCCTGTc < 1:94370/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |