| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 5,103,303 | G→T | T247N (ACC→AAC) | ftsZ ← | cell division protein FtsZ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 5,103,303 | 0 | G | T | 99.6% | 2205.3 / ‑5.9 | 548 | T247N (ACC→AAC) | ftsZ | cell division protein FtsZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base T (280/266); total (280/268) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 550 total aligned reads displayed.
CCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGGACGCTTGATGATGTCG > NC_008463/5103156‑5103449 | cACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCg < 1:1456312/150‑1 (MQ=255) cACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCAACAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCg > 2:8621319/1‑150 (MQ=255) ccTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGa > 2:3669132/1‑150 (MQ=255) tCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTg > 1:8862506/1‑150 (MQ=255) cacaGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTgc < 1:136013/150‑1 (MQ=255) gTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTgccgcc > 2:4266113/1‑150 (MQ=255) gTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTgccgcc > 2:3334460/1‑150 (MQ=255) gTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTgccgcc < 1:7838265/150‑1 (MQ=255) 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gcGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGGACGCTTGATGATGt > 1:6291192/1‑150 (MQ=255) gggtTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGGACGCTTGATGATGTCg < 1:5953278/150‑1 (MQ=255) | CCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCATCGCCATGCCCATTTCGCTCATGACGGTCTTCACGTCGGCGAAGTCGACGTTGATCATGCCCGGACGCTTGATGATGTCG > NC_008463/5103156‑5103449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |