| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 5,905,079 | A→G | F731F (TTT→TTC) | glnE ← | bifunctional [glutamate‑‑ammonia ligase]‑adenylyl‑L‑tyrosine phosphorylase/[glutamate‑‑ammonia‑ligase] adenylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 5,905,079 | 0 | A | G | 99.6% | 1774.7 / NA | 467 | F731F (TTT→TTC) | glnE | bifunctional [glutamate‑‑ammonia ligase]‑adenylyl‑L‑tyrosine phosphorylase/[glutamate‑‑ammonia‑ligase] adenylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (255/209); minor base T (0/2); total (255/212) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 471 total aligned reads displayed.
CAGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATAAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGTTC > NC_008463/5904932‑5905225 | ggCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAaca > 1:9413660/1‑150 (MQ=255) gcgcATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAacac < 2:8926395/150‑1 (MQ=255) cgcATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACAcc < 1:1860190/150‑1 (MQ=255) gcATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCa < 2:6579591/150‑1 (MQ=255) aTGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGTGGAAATGGATGATCTACTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAgg < 1:9049543/150‑1 (MQ=255) gTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTc < 2:10891838/150‑1 (MQ=255) tCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCg < 1:2368300/150‑1 (MQ=255) cGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGa < 1:7409745/150‑1 (MQ=255) cGACCTCGAAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGa < 1:7229397/150‑1 (MQ=255) aCCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAgg > 1:10252603/1‑150 (MQ=255) cTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAATTGGTTGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGATCTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTc < 2:7024443/150‑1 (MQ=255) tCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTcc < 1:8530141/150‑1 (MQ=255) agagGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGc > 2:473211/1‑150 (MQ=255) agGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCa < 1:1454965/150‑1 (MQ=255) gggTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGATGTATTGGATGATCGTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACCCCAGGTCGAGGTACGAGCCAt < 2:425906/150‑1 (MQ=255) gggTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCAt < 1:2917090/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATg < 2:10380577/150‑1 (MQ=255) gCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGAcc < 2:1451144/150‑1 (MQ=255) gCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGAcc > 1:2199729/1‑150 (MQ=255) ggATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAAGGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATGTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGaa < 2:3397014/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTGGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACt > 2:5074167/1‑150 (MQ=255) aTGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACt > 1:458368/1‑150 (MQ=255) ggCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTcc < 2:2978411/150‑1 (MQ=255) ggCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTcc < 1:4982004/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGcc < 2:10589400/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGcc > 1:5593841/1‑150 (MQ=255) cTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGccc < 1:3375809/150‑1 (MQ=255) cTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGccc < 2:5287457/150‑1 (MQ=255) tGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCccg > 2:842431/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCccgcc < 1:10843942/150‑1 (MQ=255) gAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCtt > 2:5790222/1‑150 (MQ=255) gAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCtt < 2:3800927/150‑1 (MQ=255) gAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCtt < 1:960302/150‑1 (MQ=255) gAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCtt > 1:5803160/1‑150 (MQ=255) aGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTg > 1:9754370/1‑150 (MQ=255) aGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTg > 1:10055381/1‑150 (MQ=255) aGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGGAAAGAACTGCGCGCCAACGAGGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGGGGGGGTGGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAAAACCACCCCGCCGACCttc > 2:4494860/1‑149 (MQ=255) ggAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGc < 2:4576435/150‑1 (MQ=255) aaTGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGt > 2:8539539/1‑150 (MQ=255) aaTGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGt < 1:11086779/150‑1 (MQ=255) aaTGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGt > 1:5094028/1‑150 (MQ=255) aTGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTa > 1:9295806/1‑150 (MQ=255) tGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAg < 1:9119143/150‑1 (MQ=255) ggATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGc < 2:7868416/150‑1 (MQ=255) ggATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGAAAAGAACTGAGCGCCATCGATGGATTAGCCGCCAACGGTCTCGCAGAGGGGGTCGCCGACATGGATGAACACCAGGACGAGCTCCGAGCCATGACCGAACTCCACACCGCCGACCGAGCCGTAGc > 2:10989878/1‑150 (MQ=255) gatgatCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGcc > 1:11021584/1‑150 (MQ=255) gatgatCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGGCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGcc < 2:5916555/150‑1 (MQ=255) tgatCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCcga < 2:9057798/150‑1 (MQ=255) tgatCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCcga < 1:7852891/150‑1 (MQ=255) tgatCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCcga > 1:10549281/1‑150 (MQ=255) tctGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGa > 2:9502303/1‑150 (MQ=255) tGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACg > 2:7633792/1‑150 (MQ=255) ccccAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGaa > 1:1699659/1‑150 (MQ=255) cccAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAg > 2:7812061/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGt < 1:7630740/150‑1 (MQ=255) aGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTcc > 2:2511831/1‑150 (MQ=255) aGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGCGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTcc > 1:6187188/1‑150 (MQ=255) ggCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCg > 1:8043807/1‑150 (MQ=255) gggTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTCGCCGACGATGACGAAGTCCGGAt > 2:9578030/1‑150 (MQ=255) gggTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGAt > 1:1233707/1‑150 (MQ=255) ggTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATc < 1:9623569/150‑1 (MQ=255) aaaGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCa > 1:163056/1‑150 (MQ=255) cTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGt < 2:8000965/150‑1 (MQ=255) agcgcgcCATCGATGGAGTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTg < 1:10686962/149‑1 (MQ=255) gcgcgcCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGc > 1:8214355/1‑150 (MQ=255) cgcCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGt < 1:8448729/150‑1 (MQ=255) aTCGATGGATTAGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGACCACCAGGTCGAGGTCCTAGCCATGACCGAACTCCACCCCGCCGACCTAGCCGTAGCCGACTAAGACGAAGTCATCATCGAACGGCGAGACGTCGgc > 1:5441990/1‑150 (MQ=255) gATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGgcgcg > 1:3138908/1‑150 (MQ=255) gATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGAAGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGgcgcg > 1:4784486/1‑150 (MQ=255) aTGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGgcgcgc > 2:6184056/1‑150 (MQ=255) ggATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCaa < 1:3827951/150‑1 (MQ=255) ggATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCaa < 1:9945982/150‑1 (MQ=255) gATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAAc > 1:5163666/1‑150 (MQ=255) aTTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGCCGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAAcg < 1:8366708/150‑1 (MQ=255) aTTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACATTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAAcg > 2:9690057/1‑150 (MQ=255) tttGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAAcgg < 2:7218248/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAAcggcc < 2:3224596/150‑1 (MQ=255) ccgccATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAAcggccgg < 2:823309/150‑1 (MQ=255) ccATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGgccggccg > 2:874287/1‑150 (MQ=255) ccATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGgccggccg > 1:8689105/1‑150 (MQ=255) tCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGTCCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCTGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGa < 2:6231767/150‑1 (MQ=255) gTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGc > 1:4493294/1‑150 (MQ=255) ctcGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTg > 2:2105601/1‑150 (MQ=255) gCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCAc < 1:2702828/150‑1 (MQ=255) cAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCAcc > 2:3913805/1‑150 (MQ=255) aGTGGGGGTAGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCa > 2:3128301/1‑150 (MQ=255) tGGGGGTCGCCGTCATGGATGCACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAAc < 2:6778440/150‑1 (MQ=255) gggTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGAGGCGGCACCAACTgc > 2:4135136/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTgcc < 1:6759920/150‑1 (MQ=255) gCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgcca > 2:932721/1‑150 (MQ=255) gCCGTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgcca < 1:6641461/150‑1 (MQ=255) gTCATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggc < 2:1893627/150‑1 (MQ=255) cATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggcca > 2:9744292/1‑150 (MQ=255) cATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggcca > 1:10336948/1‑150 (MQ=255) cATGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggcca < 1:7176688/150‑1 (MQ=255) aTGGATGAACACCAGGTCTAGGTCCGAGACATGACCGAACTCAATCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGACAGGATCTCTCGGCGTGACGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCAgccaggccag > 2:10152311/1‑150 (MQ=255) aTGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCgccaggccag > 1:7046570/1‑150 (MQ=255) tGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGt > 2:10745932/1‑150 (MQ=255) tGGATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGt > 1:6430325/1‑150 (MQ=255) gATGAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGTTc < 1:4081220/150‑1 (MQ=255) | CAGGCGCATGTCGACCTCGTAGAGGGTGCCGGATGGCGTCTGCGCGGTGAGGAAATGGATGATCTTCTGCCCCAGGCGGGTAAAGAACTGCGCGCCATCGATGGATTTGCCGCCATCGGTCTCGCAGTGGGGGTCGCCGTCATGGATAAACACCAGGTCGAGGTCCGAGCCATGACCGAACTCCAGCCCGCCGACCTTGCCGTAGCCGACGATGACGAAGTCCGGATCGCACGGCGTGCCGTCGGCGCGCAACGGCCGGCCGTGACGCTGCACCAACTGCCGCCAGGCCAGTTC > NC_008463/5904932‑5905225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |