Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_008463 | 1,271,763 | Δ1 bp | intergenic (+20/+69) | PA14_RS05965 → / ← PA14_RS05970 | YidB family protein/aldo/keto reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_008463 | 1,271,761 | 0 | G | . | 99.8% | 2317.1 / ‑3.6 | 468 | intergenic (+18/+71) | PA14_RS05965/PA14_RS05970 | YidB family protein/aldo/keto reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base . (242/225); total (243/225) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 500 total aligned reads displayed.
CGGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCGGGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTCG > NC_008463/1271611‑1271907 | cgGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCg > 1:910828/1‑151 (MQ=255) cgGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCg > 2:2071995/1‑151 (MQ=255) cgGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCg < 1:7815544/151‑1 (MQ=255) ggAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCgg < 2:7063731/151‑1 (MQ=255) gAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCgga < 1:2715082/151‑2 (MQ=255) gAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCgga < 1:6719325/151‑2 (MQ=255) cAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCgg > 1:6350041/1‑151 (MQ=255) aGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATgc‑ggagcgga > 1:1626017/1‑151 (MQ=255) gCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGAt > 2:3965454/1‑151 (MQ=255) aGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGc < 2:4600553/151‑1 (MQ=255) gggCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGcc < 2:5926679/151‑1 (MQ=255) gCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcgc < 2:3674303/151‑1 (MQ=255) cGAGGCGGCCGAACACCTTAGCAGCCTGCTGCCGTAACTGTTCATCAAGCTGTCGCCGTTCGGCCAGGCGCCGCAGGGCGAACTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGAGCTTCTGATAAGGTTTTCCCGTCGATTC‑GGAGCGGATAGCcgcg < 2:4507615/151‑1 (MQ=255) cGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcgcg < 2:7999140/151‑1 (MQ=255) cGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcgcg < 1:6448880/151‑1 (MQ=255) aGGCGGCCGCACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGAt < 1:2316792/151‑1 (MQ=255) aGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGAt < 1:10532613/151‑1 (MQ=255) gcggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATAc < 1:8148741/151‑1 (MQ=255) gcggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATAc < 2:6283118/151‑1 (MQ=255) gcggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATAc < 2:1159822/151‑1 (MQ=255) cggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACCAGCGGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCCGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACg < 2:10558156/151‑1 (MQ=255) gcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGt < 1:2926107/151‑1 (MQ=255) gAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTAt < 2:6553081/151‑1 (MQ=255) gAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTAt > 2:3010225/1‑151 (MQ=255) acCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCTCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATCCGGTTATCCGc > 1:4457710/1‑151 (MQ=255) acCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGc < 1:8635806/151‑1 (MQ=255) cagcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTc > 2:10002071/1‑151 (MQ=255) cagcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTc < 1:10186195/151‑1 (MQ=255) agcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACAGCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGGTTTCCCGTCGATG‑GGGAGCGCATAGCCGCGATGCGGTGATCCGCTCCACTCa > 1:7634579/1‑151 (MQ=255) ctgctgCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGAGAGCCGCGATACGGGTCTCCGCTCCACTCAACg > 1:9819095/1‑151 (MQ=255) tgctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACgg > 2:9451241/1‑151 (MQ=255) tgctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACgg > 1:689100/1‑151 (MQ=255) tgctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGAGAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACgg < 1:2125865/151‑1 (MQ=255) ctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACgggg < 2:1937778/151‑1 (MQ=255) gcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCg < 2:9022777/151‑1 (MQ=255) gcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCg > 2:1723886/1‑151 (MQ=255) cGGACCTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAg > 1:10382572/1‑151 (MQ=255) cGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGCTAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAg > 2:3484395/1‑151 (MQ=255) cGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAg > 1:7095737/1‑151 (MQ=255) tGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgccgcc < 2:8694305/151‑1 (MQ=255) gTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCt < 1:3891585/151‑1 (MQ=255) caaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACg < 1:844888/151‑1 (MQ=255) aaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACgg > 1:6821984/1‑151 (MQ=255) aaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACgg < 1:2253694/151‑1 (MQ=255) ccGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCGGGCGCGCTTCAGCTAAGGATTTCCCGTCGATGC‑GGCGCGGATAGCCGCGNTACGGTTCTCCGCTCCACTCACCGGGGCGCGGCCGCCCTCGACGGCAggtc < 1:5650242/150‑1 (MQ=255) aCGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtc < 2:4926416/151‑1 (MQ=255) cGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtcggtc > 2:4343822/1‑151 (MQ=255) gACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCaa > 2:7335935/1‑151 (MQ=255) gACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCaa > 2:9639688/1‑151 (MQ=255) ggCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAg > 1:8876416/1‑151 (MQ=255) ggCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAg > 2:6962595/1‑151 (MQ=255) gCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAgg > 2:2566928/1‑151 (MQ=255) gCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAgg < 1:3329440/151‑1 (MQ=255) ccAGGCGCCGCAGGGCGACCAGGACAACGGTTCGCTCCTGGCGCGCGTCAGCTAAGGTGTTCCCGACGATGC‑GCAGCGGATAGCCGCGATACGGTAATCCGCTCCACTCAACTGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAAAAggc > 2:9714740/1‑151 (MQ=255) cAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcg > 2:10188429/1‑151 (MQ=255) cgcAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctggcgc > 1:7944790/1‑151 (MQ=255) ggCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTcc < 2:3301224/151‑1 (MQ=255) cGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAg > 1:10076173/1‑151 (MQ=255) gACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAgg < 2:7127666/151‑1 (MQ=255) tGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGt < 2:5177278/151‑1 (MQ=255) gACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTgg < 1:5264927/151‑1 (MQ=255) aCATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGa < 1:7388196/151‑1 (MQ=255) aTCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCTGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATc > 2:7536744/1‑151 (MQ=255) 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gTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATGGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCt > 1:4302708/1‑151 (MQ=255) cGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGtt < 1:6247027/151‑1 (MQ=255) gctgctGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtc < 1:1804115/151‑1 (MQ=255) tgctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgt < 2:8380232/151‑1 (MQ=255) ctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgtcg < 1:3983316/151‑1 (MQ=255) ggCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAg < 1:5533948/151‑1 (MQ=255) gcgcgcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGc > 1:5794601/1‑151 (MQ=255) gcgcgcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGc < 2:7685735/151‑1 (MQ=255) gcgcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCtt > 1:2633248/1‑151 (MQ=255) cgcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATCGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTc < 2:951117/151‑1 (MQ=255) cgcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTc < 2:6188455/151‑1 (MQ=255) gcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGATGCCGCCCTCGACGGCAGGTAGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTTGATCGCCTTTTCGTCGAGCTTCa > 2:1319714/1‑151 (MQ=255) cTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAg < 2:6819303/151‑1 (MQ=255) tCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggt > 2:5421903/1‑151 (MQ=255) aGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggtgg > 1:10301605/1‑151 (MQ=255) aGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggtgg < 1:1690531/151‑1 (MQ=255) gCTNAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggtggg > 1:4670226/1‑151 (MQ=255) gCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggtggg < 2:3781503/151‑1 (MQ=255) cTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggtgggt > 1:4918076/1‑151 (MQ=255) tAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggtgggtg > 1:1075447/1‑151 (MQ=255) aGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTggc < 2:9222774/151‑1 (MQ=255) aGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTggc < 1:1320129/151‑1 (MQ=255) ttttCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTggcggc < 1:7275119/151‑1 (MQ=255) ttCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGa > 1:939453/1‑151 (MQ=255) cccGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATc > 1:9557208/1‑151 (MQ=255) ccGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGCTCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCa > 2:6409981/1‑151 (MQ=255) ccGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCa < 2:3383294/151‑1 (MQ=255) cGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCACCGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAAGAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAg < 1:1996270/151‑1 (MQ=255) gTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAgg < 1:3686837/151‑1 (MQ=255) gTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAgg > 1:6090421/1‑151 (MQ=255) tCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAAGAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGgt > 2:4095014/1‑151 (MQ=255) gATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGgtcg < 2:2259690/151‑1 (MQ=255) | CGGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCGGGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTCG > NC_008463/1271611‑1271907 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |