| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_008463 | 3,374,601 | A→G | F41S (TTC→TCC) | PA14_RS15385 ← | aminotransferase class V‑fold PLP‑dependent enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 3,374,601 | 0 | A | G | 99.8% | 1981.6 / NA | 494 | F41S (TTC→TCC) | PA14_RS15385 | aminotransferase class V‑fold PLP‑dependent enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (186/307); minor base T (0/1); total (186/308) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 495 total aligned reads displayed.
CGCCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGAAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATCGGACGGA > NC_008463/3374453‑3374748 | cgcCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGgaa < 1:5841672/151‑1 (MQ=255) gcCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAAt < 1:5036837/151‑1 (MQ=255) gcCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAAt < 1:10172038/151‑1 (MQ=255) cTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTc > 1:9026055/1‑151 (MQ=255) cACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCCGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGAcgcg < 2:4304381/151‑1 (MQ=255) cccTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCTCCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCCTGGGACTTCGACGCGGGAt > 2:6406176/1‑151 (MQ=255) cccTTGAGGGCCAGGTTGTTGGAGTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTCGGCATGGGAATTCGACGCGGGAt > 2:7324229/1‑151 (MQ=255) ttGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGc > 2:10536448/1‑151 (MQ=255) tGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGcc > 1:4144627/1‑151 (MQ=255) gAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCa < 1:6379364/151‑1 (MQ=255) aGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCaa < 1:1366439/151‑1 (MQ=255) aGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCaa < 2:2749092/151‑1 (MQ=255) gCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACTATCTGCCCGGCGATGGCGCCGACCAGCGCGGCCACATGCTCCCAGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCTGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCTGGATTGCCAAAac > 2:4994950/1‑151 (MQ=255) gCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAac < 1:205177/151‑1 (MQ=255) ccAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAaca < 1:4555595/151‑1 (MQ=255) ccAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAaca > 1:3606390/1‑151 (MQ=255) cAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAacac < 1:1488651/151‑1 (MQ=255) aGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACg > 2:4593759/1‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |