| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_008463 | 3,711,749 | T→C | L37L (TTG→CTG) | cobA → | uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_008463 | 3,711,749 | 0 | T | C | 99.8% | 1984.2 / NA | 506 | L37L (TTG→CTG) | cobA | uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (300/205); minor base A (1/0); total (301/205) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 506 total aligned reads displayed.
CCCCCCGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATTTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGGTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGA > NC_008463/3711601‑3711896 | ccccccGTCCCAGGTCGGCGAATGCCTGAGGAGATCGACTTTGTGCTGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTTCGGGTCCCGTCGCTCCTGAAATTTTGTCCCTGACGGCAGTTCCCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTg < 2:419735/151‑1 (MQ=255)ccccccGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTg > 2:2243305/1‑151 (MQ=255)ccccccGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTg > 2:5304987/1‑151 (MQ=255) 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ggATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGa > 1:7794247/1‑151 (MQ=255) ggATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGa > 1:912164/1‑151 (MQ=255) gATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGAc > 2:93577/1‑151 (MQ=255) aTGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACg > 1:1883174/1‑151 (MQ=255) ggtgATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGc > 1:4798124/1‑151 (MQ=255) 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gaTCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGa > 2:1253024/1‑151 (MQ=255) gaTCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGa > 1:1016573/1‑151 (MQ=255) | CCCCCCGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATTTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGGTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTGA > NC_008463/3711601‑3711896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |