Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_008463 | 791,848 | C→G | P610A (CCC→GCC) | pchF → | pyochelin non‑ribosomal peptide synthetase PchF |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 791,848 | 0 | C | G | 99.8% | 2170.4 / NA | 554 | P610A (CCC→GCC) | pchF | pyochelin non‑ribosomal peptide synthetase PchF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (361/192); total (361/193) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.48e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 559 total aligned reads displayed.
CGCGGGCCGTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCCCCGAAGTGGTCGC‑CTGGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGAACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCT > NC_008463/791700‑791995 | gcgGGCCGTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTCTGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCg < 2:3600712/151‑1 (MQ=255) gcgGGCCGTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCg > 2:2823849/1‑151 (MQ=255) ccGTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTg > 2:8396314/1‑151 (MQ=255) 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ccGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCcgcg > 2:7671172/1‑151 (MQ=255) gCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCgcggc > 1:4097235/1‑151 (MQ=255) aGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACCGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGa > 2:5648546/1‑151 (MQ=255) aGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGa > 2:8626696/1‑151 (MQ=255) cgccgcTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGt > 1:5861925/1‑151 (MQ=255) gccgcTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTg < 2:8568349/151‑1 (MQ=255) cTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATTTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTggcgg > 2:10082192/1‑151 (MQ=255) cTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTggcgg > 1:3964596/1‑151 (MQ=255) gcggcgCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGgcggcg < 2:1030926/151‑1 (MQ=255) gcggcgCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGgcggcg < 1:520684/151‑1 (MQ=255) ggcgCCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGga < 2:4537604/151‑1 (MQ=255) cgcCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGgacg < 2:9799169/151‑1 (MQ=255) cgcCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGgacg > 2:6151213/1‑151 (MQ=255) gcCAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGgacga > 1:3646683/1‑151 (MQ=255) ccAGGCGATCCTCGCCAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGgacgac > 2:2430325/1‑151 (MQ=255) 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ccAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGTCCTCGCCTACGTGAt > 1:9843077/1‑151 (MQ=255) cAGCGCCGAAGTGGTCGC‑GCTGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGGACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATc > 1:2773329/1‑151 (MQ=255) | CGCGGGCCGTGGCCGGCGGGTCGCGGTGATGCTGCCGAAAAGCGCCGCGCAATTGGTCGCGGTGATCGGCATCCTCCAGGCCGGCGCAGCCTATGTGCCGGTGGACATCCGCCAGCCGCCGCTGCGGCGCCAGGCGATCCTCGCCAGCCCCGAAGTGGTCGC‑CTGGGTCTGCCTGGAAAGCGATGTCCCGAACGCCGGCTGCGCCTGCGTGGCCATCGACCGGCTGGCCGCCGACAGCGCCTGGCCGCCACCGCCCGCGGCGGAGGTGGCGGCGGACGACCTCGCCTACGTGATCT > NC_008463/791700‑791995 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |