| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_008463 | 5,103,224 | 2 bp→CA | coding (818‑819/1185 nt) | ftsZ ← | cell division protein FtsZ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 5,103,224 | 0 | A | C | 100.0% | 1845.7 / NA | 474 | P273M (CCT→CTG) | ftsZ | cell division protein FtsZ |
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| * | NC_008463 | 5,103,225 | 0 | G | A | 99.6% | 1946.2 / NA | 474 | P273M (CCT→CTG) | ftsZ | cell division protein FtsZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (282/190); minor base C (2/0); total (284/190) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 474 total aligned reads displayed.
TCTCCAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCA > NC_008463/5103079‑5103369 || tcCAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACa < 1:4607333/151‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAg > 1:9767438/1‑151 (MQ=255) ccAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAg < 1:2562479/151‑1 (MQ=255) aGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGAGGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGt > 1:3028511/1‑151 (MQ=255) gcCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGAccc > 1:565582/1‑151 (MQ=255) gcCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGAccc < 1:2978159/151‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCcgc > 1:1192948/1‑151 (MQ=255) ccAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCcgc > 2:6087839/1‑151 (MQ=255) 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cTCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCcatc < 1:23761/151‑1 (MQ=255) tCGCCCAGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCAGGATGCCGCGCGCGCCCAGCAGGTTGACGTCTTCCAGCAGCGGGTTGCGGATTGCCGCCTCGGTGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCcatca > 1:437001/1‑151 (MQ=255) || TCTCCAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCA > NC_008463/5103079‑5103369 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |