| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_008463 | 5,103,224 | 2 bp→CA | coding (818‑819/1185 nt) | ftsZ ← | cell division protein FtsZ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 5,103,224 | 0 | A | C | 100.0% | 2100.9 / NA | 534 | P273M (CCT→CTG) | ftsZ | cell division protein FtsZ |
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| * | NC_008463 | 5,103,225 | 0 | G | A | 99.4% | 2232.5 / NA | 534 | P273M (CCT→CTG) | ftsZ | cell division protein FtsZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (320/211); minor base C (2/1); total (322/212) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 534 total aligned reads displayed.
TCTCCAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCAGGGGACAGGTCCGGACCCGCGGTGATGTTCACCATGATGCCGCGCGCGCCCTGCAGGTTGACGTCTCCCAGCAGCGGGGTGCGGATTGCCGCCTCGGGGGCCTCGCGGGCACGGTTCGGACCGCTGGCGCAGCCGGTACCCATCA > NC_008463/5103079‑5103369 || tcCAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACa < 1:8016947/151‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAg > 2:3283820/1‑151 (MQ=255) cAGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAgg > 1:6559325/1‑151 (MQ=255) aGGCGCGCGCCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGt > 1:1504234/1‑151 (MQ=255) gcgcgcgcCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTcc < 2:7890524/151‑1 (MQ=255) gcgcgcgcCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTcc < 1:10986922/151‑1 (MQ=255) gcgcgcgcCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTcc < 1:3500179/151‑1 (MQ=255) cgcgcgcCCAGGCCGGTGGCGACTACGGTGACGTGCAGCTCATCGCGCATGTCCGCGTCGATCACGGTGCCCACCTTCACAGTGGCGTGCTCGGAAGCGAACTGTTCGATGATGTTGCCGACATCGGAGTACTCGCCCAGGGACAGGTCCg < 1:3109318/151‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |