| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_008463 | 5,118,016 | C→T | G59D (GGC→GAC) | ftsL ← | cell division protein FtsL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 5,118,016 | 0 | C | T | 99.1% | 2855.7 / 3.8 | 675 | G59D (GGC→GAC) | ftsL | cell division protein FtsL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/1); new base T (332/336); total (337/338) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.17e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 693 total aligned reads displayed.
GGTAGAGGGCGCCCTGGAAATAATTCAGTTTCATGGCGCCACCATCCTGACCTCGGCCGGGTCGGGAACGCGCATGCGCAACTGTTCCACCGCCAGGCTTTCGATGCGGCTATGAGCGGTCCAGGTGCTCTGCTCGAGAATCAACCGGCCCCACTCGGCCTGCGCCTTGTCGCGCACGCTCAGCTCGGAATACAGCGAGTTGAGCAGTTGCCGGTTCCAGTAGGTGCTGTAGGCCACGGCAATCGCCGAGAGCAACAGACCTATATAAAGCAGCAACATGAGGAAGCTGCCGGTAG > NC_008463/5117868‑5118163 | gggagagGGCGCCCTGGAAATAATTCAGTTTCATGGCGCCACCATCCTGACCTCGGCCGGGTCGGGAACGCGCATGCGCAACTGTTCCACCGCCAGGCTTTCGATGCGGCTATGAGCGGTCCAGGTGCTCTGCTCGAGAATCAACCGGtcc < 2:6573288/148‑1 (MQ=255)ggTAGAGGGCGCCCTGGAAATAATTCAGTTTCATGGCGCCACCATCCTGACCTCGGCCGGGTCGGGAACGCGCATGCGCAACTGTTCCACCGCCAGGCTTTCGATGCGGCTATGAGCGGTCCAGGTGCTCTGCTCGAGAATCAACCGGtcc < 1:3858085/151‑1 (MQ=255)ggTAGAGGGCGCCCTGGAAATAATTCAGTTTCATGGCGCCACCATCCTGACCTCGGCCGGGTCGGGAACGCGCATGCGCAACTGTTCCACCGCCAGGCTTTCGATGCGGCTATGAGCGGTCCAGGTGCTCTGCTCGAGAATCAACCGGtcc > 2:610683/1‑151 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aaaTAAGTCAGTGTCATGGCGCCACCATCCTGACCTCGGCCGGGTCGGGAACGCGCATGCGCAACTGTTCCACCGCCAGGCTTTCGATGCGGCTATGAGCGGTCCAGGTGCTCTGCTCGAGAATCAACCGGTCCCACTCGGCCTGCGCCtt < 2:7135994/151‑1 (MQ=255) ataatTCAGTTTCATGGCGCCACCATCCTGACCTCGGCCGGGTCGGGAACGCGCATGCGCAACTGTTCCACCGCCAGGCTTTCGATGCGGCTATGAGCGGTCCAGGTGCTCTGCTCGAGAATCAACCGGTCCCACTCGGCCTGCGCCTTGt < 1:10526164/151‑1 (MQ=255) taatTCAGTTTCATGGCGCCACCATCCTGACCTCGGCCGGGTCGGGAACGCGCATGCGCAACTGTTCCACCGCCAGGCTTTCGATGCGGCTATGAGCGGTCCAGGTGCTCTGCTCGAGAATCAACCGGTCCCACTCGGCCTGCGCCTTGTc < 1:4940335/151‑1 (MQ=255) taatTCAGTTTCATGGCGCCACCATCCTGACCTCGGCCGGGTCGGGAACGCGCATGCGCAACTGTTCCACCGCCAGGCTTTCGATGCGGCTATGAGCGGTCCAGGTGCTCTGCTCGAGAATCAACCGGTCCCACTCGGCCTGCGCCTTGTc < 1:9942806/151‑1 (MQ=255) taatTCAGTTTCATGGCGCCACCATCCTGACCTCGGCCGGGTCGGGAACGCGCATGCGCAACTGTTCCACCGCCAGGCTTTCGATGCGGCTATGAGCGGTCCAGGTGCTCTGCTCGAGAATCAACCGGTCCCACTCGGCCTGCGCCTTGTc < 1:8975852/151‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |