| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 5,461,009 | 0 | A | G | 30.4% | 811.5 / inf | 434 | N1282N (AAT→AAC) | PA14_RS25000 | MBG domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (164/127); new base G (68/59); total (233/201) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.74e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 439 total aligned reads displayed.
GATCGGCGTCGCCATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGTGC > NC_008463/5460861‑5461158 | gATCGGCGTCGCCATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACAt < 2:9809796/150‑1 (MQ=255) aTCGGCGTCGCCTTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACagt < 2:9013064/150‑3 (MQ=255) cGGCGTCGCCATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATtct < 1:3423528/150‑1 (MQ=255) ggCGTCTCCTTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCATGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATtctc < 2:1098428/150‑1 (MQ=255) gcatCGCCATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCg > 2:3253250/4‑150 (MQ=255) gCGTCGCCATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCAGCCTGGTTGATGCCGGACACGCCGACAttaacg > 2:4402281/1‑146 (MQ=255) cGTCTCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCgc < 2:2286114/150‑1 (MQ=21) atCGCCATAGACCTTGGTCTTGCCGTCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCgc > 2:7863397/2‑149 (MQ=255) atCGCCATAGACCTTGGTCTTGCCGTCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCgc < 1:7863397/148‑1 (MQ=255) tcaccgtAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCgcca < 1:181993/144‑1 (MQ=17) tCGCCATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCgcca > 2:2724075/1‑150 (MQ=255) ccATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGCTCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCgccagcc < 2:7576064/150‑1 (MQ=255) cATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCgccagcca < 1:2672525/150‑1 (MQ=38) aGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGTGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGGGCAGGTCGTAGTTCCCGCTGACCAGACCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCATACACGCCGACGTTATCGCCAGACAcgc > 1:6884760/1‑150 (MQ=11) cTTGGTCTTGCCGTCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTAATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCt > 1:3183552/1‑150 (MQ=255) gTCTTGCCGTCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCgccagcca > 2:5425662/1‑139 (MQ=255) tCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTGTTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGc < 2:987912/150‑1 (MQ=17) tCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGc < 1:2449651/150‑1 (MQ=37) aTCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCAcc > 2:1631313/1‑150 (MQ=39) aTCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCAcc < 1:2819812/150‑1 (MQ=39) ggCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTGTTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCt < 2:10646370/141‑1 (MQ=17) cGATCACATTCATCAGCGCATTTGTGATGGTCAGGTTTTTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCTCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCTGGCTGCCACCGTTGa < 2:2112878/150‑1 (MQ=11) cacaTTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCAc > 2:1904732/1‑150 (MQ=39) ttCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCCACATTCTCGCCAGCCACGCGACTCAGGCTGCCACCGTTAAGCACCGcg > 1:10165278/1‑149 (MQ=255) cagcagCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCAcc > 1:8648435/1‑150 (MQ=39) gcCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGgtg > 1:976692/1‑150 (MQ=40) cTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTc > 2:4712934/1‑150 (MQ=255) ttGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCg > 1:8397368/1‑150 (MQ=255) tGGTGATGGTCAGGTTGTTGCCTTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGc < 1:10696490/150‑1 (MQ=17) cAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAg > 1:902316/1‑150 (MQ=255) cAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAg > 1:5691771/1‑150 (MQ=255) ttATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCg > 1:735195/1‑150 (MQ=255) aTTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACCTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCt < 1:9458669/150‑1 (MQ=255) ttGCCTTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGt < 1:4436587/136‑1 (MQ=21) ccTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACTTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCt < 2:33193/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTg > 2:8556100/1‑150 (MQ=255) tGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCCTACACTCCCACGTTCTCGCCAGCCACGCGTCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCTGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCACTGAcaagt > 1:4186939/1‑146 (MQ=11) ggTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACCTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGt < 2:4213275/150‑1 (MQ=255) aGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAg > 1:9120559/1‑150 (MQ=255) cTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTc > 1:5090224/1‑150 (MQ=255) tCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCa > 1:6741114/1‑150 (MQ=255) ggTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGc > 1:5193189/1‑150 (MQ=255) ggTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGc > 1:1302018/1‑150 (MQ=255) ggTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGc < 2:8215362/150‑1 (MQ=255) gTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTATCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAgtca > 2:5378698/1‑147 (MQ=255) gTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGTCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCCCTGACCTGGTAAGTCAGGCt < 2:7332318/150‑1 (MQ=255) tCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCATGCTGCCACCGTAGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTc > 1:883793/1‑150 (MQ=255) tCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTc < 1:3955823/150‑1 (MQ=255) cGTTGTTCGCGCTGACCAGGCCCATTCCACCCTGGTGTATGCCGTACACGCCTACATTCTCGCCTGCCTCGCGGCTCATGCTGCCTCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCTCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCg < 1:11063066/150‑1 (MQ=14) cGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCg < 1:10821099/150‑1 (MQ=255) gTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTATCGCCGTTCTTCAGCCCGCTGACCTGGTAAGTCAGTCTCgg > 2:10821099/1‑150 (MQ=255) gTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCgg > 2:5790231/1‑150 (MQ=255) gTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCgg > 1:9903482/1‑150 (MQ=255) tAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCTCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCggg > 1:4829142/1‑150 (MQ=255) tAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCggg > 1:5372706/1‑150 (MQ=255) tAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGACTCAGGCTGCCACCGTTAAGCACCGCGCCAGCGGTATc > 1:3928357/1‑110 (MQ=11) tAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGACTCAGGCTGCCACCGTTAAGCACCGCGCCAGCGGTATc < 2:3928765/110‑1 (MQ=11) aGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGt < 1:6043990/150‑1 (MQ=255) tctggtgcTGACCAGCCCCAGGCCTCCCTGGTTGATGCCTTACACCCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGTCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTc < 1:1358484/144‑1 (MQ=11) gTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGc < 2:9674909/77‑1 (MQ=34) attgctgcTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACGTGGTAAGTCAGGCTCGGGTc > 2:8733447/7‑150 (MQ=1) cgcgCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGc < 2:10188791/150‑1 (MQ=255) cgcTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACGTGGTAGGTCAGGCTCGGTTctgatc > 1:8173068/1‑145 (MQ=255) cgcTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCAt > 2:504705/1‑150 (MQ=40) gcTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATc < 1:5561826/150‑1 (MQ=21) gcTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATc > 2:7712594/1‑150 (MQ=255) gcTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATc < 2:7459774/150‑1 (MQ=39) gcTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATc > 1:4964934/1‑150 (MQ=39) tGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGc < 1:7072474/150‑1 (MQ=21) tGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGc > 2:1363608/1‑150 (MQ=21) tGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGc < 1:6366512/150‑1 (MQ=255) tGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGc > 1:750979/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACTCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACCGCACCTGCGGTCTCGCCGTTCTTCAGGCCCCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCAACGCCATAg > 1:9279588/1‑150 (MQ=11) aGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGTCATCGCCGTAg > 2:7110419/1‑150 (MQ=255) ggCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGa > 1:2238268/1‑150 (MQ=255) ggCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGa > 1:4660759/1‑150 (MQ=255) ggCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGa > 1:8576409/1‑150 (MQ=255) gCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGAc > 1:1932395/1‑150 (MQ=255) cccAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAGGTCAGGCTCGGGTCGGCGTCGCCGTAGAcc < 2:11092067/150‑1 (MQ=255) aGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGcgt < 2:8035700/136‑3 (MQ=16) gTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCGTCGCCGTAGACCTTgg > 2:3035866/1‑150 (MQ=16) cACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACATGGTACGTCAGGCTCGGATCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCt > 2:10412976/1‑150 (MQ=255) aCCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCtt < 1:2148766/150‑1 (MQ=40) cTGGTTGATGCCGTACACGCCGACCTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGc < 1:6269716/150‑1 (MQ=255) gTTGATGCCTTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATc < 2:6869194/150‑1 (MQ=255) tGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCGTCgg < 2:6476248/150‑1 (MQ=255) tGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCGTCgg > 2:4784025/1‑150 (MQ=255) tGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGa > 2:9175025/1‑150 (MQ=21) tGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCGTCGGCGa > 1:10006842/1‑150 (MQ=255) gTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCGTCGGCGATcac > 1:7726144/1‑150 (MQ=255) tACACGCCGACTTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCGTCGGCGATcaca < 2:3530043/150‑1 (MQ=255) cacGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACAtt > 2:6084653/1‑150 (MQ=21) acGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTc < 1:3734542/150‑1 (MQ=39) cGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTca > 1:6626068/1‑150 (MQ=21) ccGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCTTCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTcagc < 1:9568238/150‑1 (MQ=12) ccGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTcagc > 2:9262960/1‑150 (MQ=21) ccGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACAGGCGGTTTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTACGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGAAAATGGTCTTGTCAACGGCGATCACATTaagc > 1:3002796/1‑150 (MQ=11) gACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACTTTcagcag > 1:7209329/1‑150 (MQ=255) aCATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCGTCGGCGATCACATTCAGCAGt > 1:10454051/1‑150 (MQ=255) aTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCGTCAGGCCGCTGACCGGGTAAGTCAGGCTCGGGGCGGCATCGCCGGAGACCTTGGTCTTGGCGTCGGCGATCGCAGTCAGCAGGGc > 2:8347109/1‑150 (MQ=14) | GATCGGCGTCGCCATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGTGC > NC_008463/5460861‑5461158 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |