| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 1,082,923 | Δ1 bp | pseudogene (230/2518 nt) | hrpB → | ATP‑dependent helicase HrpB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 1,082,921 | 0 | G | . | 99.5% | 2153.1 / 2.7 | 441 | pseudogene (228/2518 nt) | hrpB | ATP‑dependent helicase HrpB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base . (204/233); minor base T (2/0); total (207/234) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 461 total aligned reads displayed.
CCCCGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAGGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACGGGATCCGCCTGGAAAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTCGACG > NC_008463/1082773‑1083067 | ccccGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAgg > 1:7171879/1‑150 (MQ=255) cccGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggt > 1:10093856/1‑149 (MQ=255) ccgccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAggtc > 1:3827290/1‑148 (MQ=255) ccgGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCGGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCAGGCTCGACCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGc < 1:5845871/150‑1 (MQ=255) gggTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCga > 2:5952402/1‑150 (MQ=255) gggTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCga > 1:873384/1‑150 (MQ=255) gggTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCga > 1:6756196/1‑150 (MQ=255) gTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGTCCGTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCTGCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCgaga < 2:3337218/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCgaga > 1:8620868/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGAc < 2:2601133/150‑1 (MQ=255) ggCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTc < 2:9531270/150‑1 (MQ=255) gCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCg < 1:10032509/150‑1 (MQ=255) gCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCg < 2:10403759/150‑1 (MQ=255) aaGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGc < 2:10685058/150‑1 (MQ=255) aGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCt > 2:3812106/1‑150 (MQ=255) gACCACCCGGGTGCCCCTCGCCCTGCACGACCACCCCTGCCTCGACGCCCAACCCCTCCCCCTCCTCGAACCGCGCCGCGAGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTa < 2:9012137/150‑1 (MQ=255) accaccCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTAc < 1:1133750/150‑1 (MQ=255) accCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACcgg > 1:4942691/1‑150 (MQ=255) cccGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCCTGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGa < 1:6071625/150‑1 (MQ=255) cGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATc < 2:8290864/150‑1 (MQ=255) cGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATc < 1:10728745/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCg > 1:189723/1‑150 (MQ=255) ggTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCg > 1:6132802/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCt < 1:2200104/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGag < 1:9042254/150‑2 (MQ=255) ggCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGagag < 2:10102163/150‑1 (MQ=255) ggCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGagag > 1:6318443/1‑150 (MQ=255) ggCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGagag > 1:7360540/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGATAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGc < 2:8474606/150‑1 (MQ=255) cccTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCa < 1:7625120/150‑1 (MQ=255) cTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGGCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAgg > 1:6515001/1‑150 (MQ=255) tGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAggg < 1:7831781/150‑1 (MQ=255) cTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTc < 2:2062729/150‑1 (MQ=255) tCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCg < 2:816391/150‑1 (MQ=255) gacgaGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGc > 1:1096155/1‑150 (MQ=255) gacgaGCCCGGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGACCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGc < 2:6551011/150‑1 (MQ=255) aGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGa > 1:5951698/1‑150 (MQ=255) ggCTCGCCGGCCAACGCCTCCTCATGCTCGCACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGAccc < 1:5434092/150‑1 (MQ=255) ggCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGAccc < 2:4694062/150‑1 (MQ=255) cTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGc > 1:5532959/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCa < 2:1749074/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCa < 1:8498781/150‑1 (MQ=255) cGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCAt < 2:3556248/150‑1 (MQ=255) cGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCAt < 1:6932336/150‑1 (MQ=255) ccGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCg > 1:4180575/1‑150 (MQ=255) ccGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCg > 2:869667/1‑150 (MQ=255) cGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGa > 2:1407795/1‑150 (MQ=255) cGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGa > 1:3238455/1‑150 (MQ=255) ggCCAACGCATCCTCATGCTCGTACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCG‑AAACGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGaa < 2:5289273/150‑1 (MQ=255) ggCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGaa > 1:573188/1‑150 (MQ=255) gCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAg < 1:994424/150‑1 (MQ=255) aaCGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTgg < 1:2949079/150‑1 (MQ=255) cGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTggac < 1:816499/150‑3 (MQ=255) cGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTc < 1:9667984/150‑1 (MQ=255) aTCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCAcc > 1:3839035/1‑150 (MQ=255) tCCTCATGCTCGAACCGCAACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCg > 1:4060233/1‑150 (MQ=255) tCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAgg < 2:7512605/150‑1 (MQ=255) tCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAgg < 1:7075815/150‑1 (MQ=255) tGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTa < 1:4747437/150‑1 (MQ=255) ggCTCGCACCGGGACGCCTGGCGGGGCGGGCCGCTGCCGAGCGGCTGGCCGCCGATCTGGGCGTATA‑GGTCGGCGAGTCCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTa < 1:2799678/149‑1 (MQ=255) gCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTAt < 2:7784581/150‑1 (MQ=255) cGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCt > 1:9139487/1‑150 (MQ=255) gAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCtt > 1:10376398/1‑150 (MQ=255) aaCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTCCCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGACGTGGTCACCGAGGGGATCCTTg > 2:6161631/1‑150 (MQ=255) aCCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGc < 2:4728172/150‑1 (MQ=255) ccGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCGGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGcc < 2:6099632/150‑1 (MQ=255) cgcgACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGccc < 1:2612270/150‑1 (MQ=255) cgcgACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGccc > 2:3220301/1‑150 (MQ=255) cgcgACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGccc < 1:8338764/150‑1 (MQ=255) gcgACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCg < 1:9333601/150‑1 (MQ=255) gACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTc > 2:9204240/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCg > 1:4318034/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCg < 1:7976186/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCt > 1:6849840/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGc < 2:6919772/150‑1 (MQ=255) ggcggcGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCa > 2:5138664/1‑150 (MQ=255) gcggcgCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGACAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGACGTCCCGCATCGACGTGCTCACAGCGGGGATCCCTGCCCGGCGCCAGCaa > 2:3019571/1‑150 (MQ=255) ggcgCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCTCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAga < 2:7253062/150‑1 (MQ=255) gcgcGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAgac > 2:10975359/1‑150 (MQ=255) cgcgGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAgacg < 1:2406825/150‑1 (MQ=255) cgGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAgacgac > 2:5502602/1‑150 (MQ=255) gggCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGAcc > 1:3366025/1‑150 (MQ=255) ggCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGAccc < 1:9550499/150‑1 (MQ=255) ggCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGAccc < 2:10855087/150‑1 (MQ=255) cgGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGgcgc > 1:897378/1‑150 (MQ=255) cGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGa < 2:4088260/150‑1 (MQ=255) cGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGa < 1:10698170/150‑1 (MQ=255) aGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACg > 2:2257644/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGgtgt > 2:2913619/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCgg > 2:10283764/1‑150 (MQ=255) gccgccGAGCTGGGCGAACA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGc < 2:6426517/150‑1 (MQ=255) gccgccGAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGc < 1:6634634/150‑1 (MQ=255) ccgccgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGcc < 1:3475042/150‑1 (MQ=255) cgccgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGCGGGTATCCTGGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGACGGCCt < 2:4348868/150‑1 (MQ=255) cgAGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGt > 2:1168413/1‑150 (MQ=255) aGCTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGa < 1:1275222/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTTCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATc < 2:4274763/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATc < 1:5195916/150‑1 (MQ=255) ggCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTc < 1:6513575/150‑1 (MQ=255) gCGAAAA‑GGTCGGCGAGACCGTCGGCTACCGGATCCGCCTGGAGAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTcg > 2:7339784/1‑150 (MQ=255) | CCCCGCCGGGTGCCGGCAAGACCACCCGGGTGCCGCTGGCCCTGCTCGACGAGCCCTGGCTCGCCGGCCAACGCATCCTCATGCTCGAACCGCGACGCCTGGCGGCGCGGGCCGCGGCCGAGCGGCTGGCCGCCGAGCTGGGCGAAAAGGGTCGGCGAGACCGTCGGCTACGGGATCCGCCTGGAAAGCAGGGTCGGCCCGAAGACCCGCATCGAAGTGGTCACCGAGGGTATCCTTGCCCGTCGCCTGCAAGACGACCCGGCGCTGGACGGTGTCGGCCTGGTGATCTTCGACG > NC_008463/1082773‑1083067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |